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题名农作物Pht1家族磷转运体蛋白的生物信息学分析
被引量:6
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作者
李立芹
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机构
四川农业大学农学院
植物生理学与生物化学国家重点实验室
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出处
《作物杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期20-24,共5页
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基金
国家自然基金(31070244)
植物生理学与生物化学国家重点实验室开放课题(SKLPPBKF09011)资助
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文摘
以AtPT1所编码的氨基酸序列做为检索序列,通过对GenBank NR数据库以及EMBI、DDBJ、PDB数据库进行检索,发现小麦、大麦、玉米、水稻和番茄等植物中具全长cDNA的33个Pht1家族磷转运体基因,包括马铃薯1个,苜蓿5个,辣椒3个,茄子2个,烟草2个,番茄2个,菜豆1个,玉米4个,大麦2个,小麦1个,水稻7个,大豆2个和木薯1个。利用生物信息学分析,首次将Pht1家族磷转运体基因保守特征序列确定为GGDYPLSATIMSE。对检索到的33个Pht1家族磷转运体蛋白进化关系分析表明,与AtPT1亲缘关系较近的双子叶植物磷转运体蛋白是木薯MePT1和GmPT2,关系较近的单子叶植物磷转运体蛋白是OsPHT8和OsPHT12。
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关键词
Pht1家族
磷转运体蛋白
生物信息学
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Keywords
Pht1 family
Phosphate transporters protein
Bioinformatics
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分类号
S312
[农业科学—作物栽培与耕作技术]
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