两种新稀土双核配合物的合成、表征及其对磷酸二酯键模型物(BDNPP)和DNA的作用研究

合成和表征了两种新的双核配合物 [Eu2 (bbimp) (CH3 COO) (CH3 CH2 O) 2 (CH3 CH2 OH ) ] (ClO4) 2 (A)和 [Nd2 (bbimp) (CH3 COO) (CH3 CH2 O) 2 (CH3 CH2 OH) ] (ClO4) 2 (B) .用紫外光谱法分别研究了磷酸二酯键模型物双 (2 ,4 二硝基苯基 )磷酸盐(BDNPP)与配合物 (A ,B)的水解动力学反应 .当BDNPP与A ,B的浓度均为 2 .5× 10 -5mol/L时 ,反应为二级反应 ;在 2 5℃ ,pH 7.2 6时 ,二级水解速率常数分别为 2 479(mol/L) -1·min-1,1678(mol/L) -1·min-1,半衰期分别为 16.1min和 2 3 .8min ,比单独的Eu3 + ,Nd3 + 水解BDNPP的速率均快得多 ,3 7℃时反应更快 ;在 2 5℃ ,pH 6.5 0～ 8.5 0时 ,两个反应的水解速率常数的lgK与pH值均呈正的线性关系 .两种配合物与小牛胸腺 (CT)DNA作用 ,使CTDNA最大吸收峰发生减色和红移 ,使溴化乙锭 (EB) DNA复合物体系荧光强度减弱 .两种配合物对超螺旋质粒pBR3 2 2DNA的断裂在 5 0℃ ,pH 8.0时 ,效果最好 .

关于磷酸二酯键、磷酸键和高能磷酸键的辨析

本文对3＇,5＇—磷酸二酯键、磷酸键及高能磷酸键的来源、含义和关系进行辨析。

关于氢键和磷酸二酯键

1氢键 氢键是分子间的作用力,指和负电性原子或原子团共价结合的氢原子（正电性）与邻近的负电性原子（往往为氧或氮原子）之间形成的一种非共价键、作用力。

浅谈磷酸二酯键的生成与断裂

简要介绍磷酸二酯键的结构特点,对其形成和断裂过程进行进一步的分析。

结合化学知识重新认识磷酸二酯键

生物学科中考查DNA分子结构与DNA聚合酶等各种酶的作用部位时往往通过图文信息指示出DNA分子中的氢键和磷酸二酯键,其中关于磷酸二酯键的位置等问题存在不同的观点,有人认为磷酸二酯键可看作一个分子基团,有人认为磷酸二酯键是C-O原子之间的化学键,笔者结合例题对磷酸二酯键的错误理解进行纠正。

核酸分子中的3',5'-磷酸二酯键及其关联知识点的教学整合

从核酸、核苷酸生物合成过程中形成酯键的反应机制出发,分析了核酸分子中的3',5'-磷酸二酯键.核酸分子链的延伸、DNA的连接反应形成的都是3'-磷酸酯键,5'-磷酸酯键则是在核苷酸生物合成过程中形成,由此可见"多核苷酸链是由(脱氧)核糖核苷-5'-磷酸通过3'-磷酸酯键相连而成"的表述更为准确,以此可有效澄清相关教学中的认识误区.在教学过程中以3',5'-磷酸二酯键的形成为核心,整合相关知识点,可培养学生构建整合知识、有效解决问题的综合能力.

DNA/RNA分子中的3′,5′-磷酸二酯键之刍议

3′,5′-磷酸二酯键是生物学、生物化学及有机化学等相关学科中一个重要名词和考点,然而对其释义及内涵的理解在国内外各教材、文献及网络平台上却不同,长期以来是一个争论热点。现利用基团和化学键的基本概念、酯化反应机理及影响因素、磷酸的结构等知识,结合3′,5′-磷酸二酯键的形成机制即核苷酸从头合成途径和核酸合成的相关过程,对3′,5′-磷酸二酯键进行系统剖析和探讨,明确其本质及内涵,体现教学要注重多学科知识的交融和思维的培养。

Ce离子水解断裂Oligomers DNA中磷酸二酯键

报道了用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染法和增强Raman光谱研究Ce离子水解断裂26个碱基的单链Oligomers DNA的实验结果. Ce3+离子需要有氧气存在的条件下, 氧化生成Ce4+离子后才能切断Oligomers DNA. 系统研究了各种条件下Ce4+离子对Oligomers DNA的切断反应, 在酸性、碱性条件下都能水解切断Oligomers DNA, 在近中性时切断作用最强. 反应温度的升高、反应时间的延长以及Ce4+离子浓度的增大都有利于该切断反应. 由增强Raman光谱的研究可推断Ce4+离子可以水解断裂Oligomers DNA中5′位和3′位的磷酸二酯键并提出了反应机理.

如何理解磷酸二酯键中的“二”

有关磷酸二酯键的知识是高中生物中的一个重难点，其中关于磷酸二酯键中的“二”就有不同的理解，笔者总结如下：

杂氮冠醚化Schiff碱钴(Ⅱ)配合物模拟磷酸二酯水解酶的研究

含杂氮冠醚的Schiff碱过渡金属配合物作为模拟水解酶被用于催化BNPP水解 ,讨论了两种杂氮冠醚化单Schiff碱钴 (Ⅱ )配合物催化BNPP水解的动力学和机理 ,分析了反应体系的特征光谱变化。提出了配合物催化BNPP水解的动力学数学模型 ,结果表明 ,在反应过程中形成中间物种的假设是合理的 ;随着缓冲溶液pH的增大 ,两种配合物催化BNPP水解速率提高 ;两种配合物在催化BNPP水解中表现出好的催化活性。

高中生物学教材中涉及的4种化学键辨析

本文对高中生物学教材中涉及的四种化学键进行简要介绍.

DNA重组技术中有关碱基对之间氢键断裂的知识问题

本文从限制性核酸内切酶的作用、维持DNA双螺旋稳定结构的三种作用力、DNA中氢键的化学本质等方面来探讨了在体外DNA重组中,双链DNA酶切位点处核苷链上碱基对之间氢键断裂的原因。

功能核酸的机遇与挑战

核酸是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,是储存、复制和传递遗传信息的主要物质基础。从化学结构来看,核酸是通过相同的“化学键”(即核糖和磷酸之间的磷酸二酯键)连接不同的核酸碱基(5种天然碱基AGTCU)的功能分子。这些碱基有时也被称为分子基元。生物体利用5种天然碱基的程序性排列构造了多种核酸序列,实现了生命体遗传信息的精准编码。内源核酸作为遗传物质,其结构和功能的多样性造就了生物的多样性,在生命过程、疾病发生发展中发挥重要作用。

新型有机小分子DNA切割试剂的合成

根据活性基团的协同催化原理,设计合成了有机小分子核酸切割剂1-(N-胍乙基)-4-(N-羟乙基)哌嗪盐酸盐(4),并通过核磁共振和液相色谱-质谱联用技术对其结构进行了表征.利用琼糖凝胶电泳研究了pH值对其切割pUC 19 DNA效率的影响,通过自由基猝灭实验研究其切割DNA的反应类型.运用密度泛函理论,利用Gaussian软件进行了理论计算,研究其裂解DNA的反应方式.研究结果表明,在pH=7.2时化合物4的裂解效率最高,且能通过非氧化还原反应以磷酯转移的方式裂解DNA的磷酸二酯键.

对“基因工程”重要考点的解读

基因工程相关内容操作性强，但是在中学生物学教学中难以进行实际的实验操作。为此，本文对近年来基因工程的重要考点进行了解读。 1限制酶 限制酶中的“限制”的含义是它比普通酶具有更强的专一性，这种专一性表现在三个层次：识别DNA（不识别RNA）、识别特定序列（两条链正反谤序列一样）、只能切割特定序列内特定位点的磷酸二酯键。

基于DNA重组模型的供应链业务流程重组分析

从生物DNA的角度,提出了供应链DNA的模型,基于模型对供应链重组过程中的企业内部和供应链节点间的流程重组加以论述,通过供应链磷酸二酯键以及供应链氢键的描述,从定性和定量的角度提出了业务流程重组的方法,突出关系重组的重要性,为解决供应链业务流程重组问题提供了新思路。

消除非特异性识别的放大策略用于酶活性及其抑制剂检测

核酸内切酶作为核酸酶家族中重要的“分子剪刀”之一,可以通过对核苷酸序列的特异性识别来切割核酸骨架中的磷酸二酯键,参与一系列重要的生物学过程,如DNA复制、重组和修复^([1])。因此,在疾病预防和药物开发过程中,开发更灵敏、更方便、背景信号低的检测方法进行核酸内切酶检测至关重要。然而,现存的常规检测方法中仍然存在许多不可避免和难以处理的非特异性识别问题。同时,分离的单个有机染料分子发出的荧光信号通常是光漂白的,这导致可获取的整个信号太差,无法在许多应用中量化目标表达^([2])。

保护基在有机合成方面的应用

保护基是指多官能团化合物在进行某一反应时,为了使某些官能团在反应过程中免受影响,遭到破坏而“暂时”引入的一类保护性基团。例如:当一个含有羟基或氨基的多官能团化合物,需要在分子中的其它部位进行反应时,为使羟基或氨基不致受影响,可以在羟基或氨基上“暂时”引入—C—OR基,将羟基或氨基保护起来。待其它部位反应完成后。

高中生物学教学中涉及的一些重要酶及其作用

1基因工程中的重要酶 1.1限制性核酸内切酶（简称＂限制酶＂）是可以识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA,使DNA链中磷酸二酯键断开的一类内切酶,被誉为＂分子手术刀＂。

一种制作DNA双螺旋结构的新方法

DNA分子结构的提出揭示了＂生命之谜＂,标志着分子生物学的到来,它的双螺旋结构具有特殊的美感。学生通过制作DNA的结构模型,可以取得事半功倍的学习效果。DNA模型的制备方法有多种,但是有的并不简单,成本也高,难以在课堂教学中实现。笔者现介绍一种使用卡纸、使用过的草稿纸和铁丝等简易材料制作、可在课堂中完成的DNA模型的制作方法。