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三种礁膜属藻类的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析
被引量:
4
1
作者
谢恩义
孙彬
马家海
《上海水产大学学报》
CSCD
北大核心
2005年第1期6-11,共6页
用RAPD技术对礁膜、袋礁膜和宽礁膜进行了DNA多样性分析,这3种礁膜的基因组DNA分子量均约23Kb。在使用的88个随机引物中,有43个引物在所有样品中都能重复性较好地扩增出条带清晰的多态性片段,多态引物比例为48.86%,袋礁膜、宽礁膜和礁...
用RAPD技术对礁膜、袋礁膜和宽礁膜进行了DNA多样性分析,这3种礁膜的基因组DNA分子量均约23Kb。在使用的88个随机引物中,有43个引物在所有样品中都能重复性较好地扩增出条带清晰的多态性片段,多态引物比例为48.86%,袋礁膜、宽礁膜和礁膜多态位点比例分别为55.93%、65.28%和53.14%。礁膜与宽礁膜、宽礁膜与袋礁膜以及礁膜与袋礁膜种间遗传距离分别为0.4118,0.4148,0.4375。通过对遗传距离分析,结果表明采自3个不同海区的样本为同一礁膜属的3个种,与传统分类鉴定结果相吻合。UPGMA和NJ法构建的种间分子系统树一致,结果是宽礁膜和礁膜之间的亲缘关系最近,宽礁膜与袋礁膜之间的亲缘关系较远,礁膜与袋礁膜之间的亲缘关系最远,这与宽礁膜与礁膜共有形态特征较多,袋礁膜与宽礁膜、礁膜共有形态特征少相验证。
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关键词
礁膜属
RAPD
遗传多样性
亲缘关系
下载PDF
职称材料
用18S rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育
被引量:
7
2
作者
张耀东
沈颂东
+1 位作者
林阿朋
张劲
《大连水产学院学报》
CSCD
北大核心
2009年第1期76-78,共3页
测定了宽礁膜Monostroma latissimum、浒苔Enteromorpha prolifera、孔石莼Ulva pertusa的18S rRNA基因序列,并与肠浒苔E.intestinalis、穿孔石莼U.fenesrtata、石莼U.lactuca、礁膜M.nitidum和格氏礁膜Monostroma grevillei5种已知的...
测定了宽礁膜Monostroma latissimum、浒苔Enteromorpha prolifera、孔石莼Ulva pertusa的18S rRNA基因序列,并与肠浒苔E.intestinalis、穿孔石莼U.fenesrtata、石莼U.lactuca、礁膜M.nitidum和格氏礁膜Monostroma grevillei5种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并进行比较,分析了核苷酸序列差异和碱基替换特点,并构建系统发生树。结果表明:浒苔与肠浒苔之间的Kimura双参数距离大于浒苔与石莼属3个物种之间的Kimura双参数距离;用UPGMA法和MP法构建的系统树基本一致,在构建的系统发生树中,浒苔与石莼属物种聚为一类,表现出与石莼属物种更近的亲缘关系。
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关键词
石莼
属
浒苔
属
礁膜属
18S
RRNA
序列变异
系统发育
下载PDF
职称材料
大型海洋绿藻5.8S rRNA基因序列及系统发育分析
被引量:
8
3
作者
沈颂东
张劲
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期427-432,共6页
采用PCR方法,将扩增的产物直接测序,测定了孔石莼Ulva pertusa和浒苔Enteromorpha prolifera的5.8S rRNA基因序列,与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔、礁膜、北极礁膜、袋礁膜和格氏礁膜等7种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并进行比较,...
采用PCR方法,将扩增的产物直接测序,测定了孔石莼Ulva pertusa和浒苔Enteromorpha prolifera的5.8S rRNA基因序列,与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔、礁膜、北极礁膜、袋礁膜和格氏礁膜等7种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并进行比较,分析了核苷酸序列差异和碱基替换特点,并构建系统发生树。结果表明,浒苔和孔石莼的颠换率为0.690%,小于浒苔与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔的颠换率;且浒苔与孔石莼之间的Kimura双参数距离也小于浒苔与肠浒苔、扁浒苔以及缘管浒苔之间的平均Kimura双参数距离。相对于浒苔属的其他物种,浒苔与孔石莼的亲缘关系更近。在构建的系统发生树中,缘管浒苔与孔石莼聚为一类,表现出与石莼属物种更近的亲缘关系。
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关键词
石莼
属
浒苔
属
礁膜属
5.8S
RRNA
序列变异
系统发育
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职称材料
题名
三种礁膜属藻类的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析
被引量:
4
1
作者
谢恩义
孙彬
马家海
机构
上海水产大学生命科学与技术学院
出处
《上海水产大学学报》
CSCD
北大核心
2005年第1期6-11,共6页
基金
浙江省科学技术厅科技兴海专项基金(2002C23014)
文摘
用RAPD技术对礁膜、袋礁膜和宽礁膜进行了DNA多样性分析,这3种礁膜的基因组DNA分子量均约23Kb。在使用的88个随机引物中,有43个引物在所有样品中都能重复性较好地扩增出条带清晰的多态性片段,多态引物比例为48.86%,袋礁膜、宽礁膜和礁膜多态位点比例分别为55.93%、65.28%和53.14%。礁膜与宽礁膜、宽礁膜与袋礁膜以及礁膜与袋礁膜种间遗传距离分别为0.4118,0.4148,0.4375。通过对遗传距离分析,结果表明采自3个不同海区的样本为同一礁膜属的3个种,与传统分类鉴定结果相吻合。UPGMA和NJ法构建的种间分子系统树一致,结果是宽礁膜和礁膜之间的亲缘关系最近,宽礁膜与袋礁膜之间的亲缘关系较远,礁膜与袋礁膜之间的亲缘关系最远,这与宽礁膜与礁膜共有形态特征较多,袋礁膜与宽礁膜、礁膜共有形态特征少相验证。
关键词
礁膜属
RAPD
遗传多样性
亲缘关系
Keywords
Monostroma
RAPD
genetic diversity
genetic relationship
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
用18S rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育
被引量:
7
2
作者
张耀东
沈颂东
林阿朋
张劲
机构
苏州大学医学部基础医学与生物科学学院
出处
《大连水产学院学报》
CSCD
北大核心
2009年第1期76-78,共3页
基金
江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题(2005HS006)
文摘
测定了宽礁膜Monostroma latissimum、浒苔Enteromorpha prolifera、孔石莼Ulva pertusa的18S rRNA基因序列,并与肠浒苔E.intestinalis、穿孔石莼U.fenesrtata、石莼U.lactuca、礁膜M.nitidum和格氏礁膜Monostroma grevillei5种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并进行比较,分析了核苷酸序列差异和碱基替换特点,并构建系统发生树。结果表明:浒苔与肠浒苔之间的Kimura双参数距离大于浒苔与石莼属3个物种之间的Kimura双参数距离;用UPGMA法和MP法构建的系统树基本一致,在构建的系统发生树中,浒苔与石莼属物种聚为一类,表现出与石莼属物种更近的亲缘关系。
关键词
石莼
属
浒苔
属
礁膜属
18S
RRNA
序列变异
系统发育
Keywords
Ulva
Enteromorpha
Monostroma
18 S rRNA
sequence divergence
phylogeny
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
大型海洋绿藻5.8S rRNA基因序列及系统发育分析
被引量:
8
3
作者
沈颂东
张劲
机构
苏州大学生命科学学院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期427-432,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目"紫菜
江蓠等优质
+4 种基金
高产
抗逆品种的培育"
2006AA10A413号
江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题资助
2005HS006号
文摘
采用PCR方法,将扩增的产物直接测序,测定了孔石莼Ulva pertusa和浒苔Enteromorpha prolifera的5.8S rRNA基因序列,与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔、礁膜、北极礁膜、袋礁膜和格氏礁膜等7种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并进行比较,分析了核苷酸序列差异和碱基替换特点,并构建系统发生树。结果表明,浒苔和孔石莼的颠换率为0.690%,小于浒苔与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔的颠换率;且浒苔与孔石莼之间的Kimura双参数距离也小于浒苔与肠浒苔、扁浒苔以及缘管浒苔之间的平均Kimura双参数距离。相对于浒苔属的其他物种,浒苔与孔石莼的亲缘关系更近。在构建的系统发生树中,缘管浒苔与孔石莼聚为一类,表现出与石莼属物种更近的亲缘关系。
关键词
石莼
属
浒苔
属
礁膜属
5.8S
RRNA
序列变异
系统发育
Keywords
Ulva, Enteromorpha, Monostroma, 5.8S rRNA, Sequence divergence, Phylogeny
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三种礁膜属藻类的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析
谢恩义
孙彬
马家海
《上海水产大学学报》
CSCD
北大核心
2005
4
下载PDF
职称材料
2
用18S rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育
张耀东
沈颂东
林阿朋
张劲
《大连水产学院学报》
CSCD
北大核心
2009
7
下载PDF
职称材料
3
大型海洋绿藻5.8S rRNA基因序列及系统发育分析
沈颂东
张劲
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2008
8
下载PDF
职称材料
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