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随机森林方法预测膜蛋白类型 被引量:14
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作者 袁敏 胡秀珍 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期349-355,共7页
膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义。文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随... 膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义。文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随机森林分类器,对8类膜蛋白进行了预测。在Jackknife检验下的预测精度为86.3%,独立检验的预测精度为93.8%,取得了好于前人的预测结果。 展开更多
关键词 生物膜蛋白 随机森林法 离散增量 离散傅里叶谱 伪氨基酸组分
原文传递
Matrix Decomposition and Calculation of Chrestenson Spectra
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作者 胡磊 《Journal of Mathematical Research and Exposition》 CSCD 北大核心 2003年第1期21-27,共7页
Calculation of a variation of discrete Fourier transform.Chrestenson spectraof functions of n indeterminates over integer modulo m(composite integer),is con-sidered.Based on sparse matrix decomposition,two fast algori... Calculation of a variation of discrete Fourier transform.Chrestenson spectraof functions of n indeterminates over integer modulo m(composite integer),is con-sidered.Based on sparse matrix decomposition,two fast algorithms with complexityO(mnn∑ri=1pi)are given to calculate the Chrestenson spectra,where p1p2…p2 is theprime factor decomposition of m. 展开更多
关键词 discrete Fourier transform Chrestenson spectra sparse matrix fast algorithm.
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