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吉林省10个柞蚕品种的线粒体基因组分析
1
作者
靳向东
王坤龙
+6 位作者
郝大东
黄镜潮
万军
苗隆
张世宇
刘彦群
朱兴友
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期405-412,共8页
吉林省是我国二化性柞蚕(Antheraea pernyi)的种源基地,种茧产量占全国用种量的80%以上。本文测定了吉林省10个柞蚕品种的线粒体基因组,并结合已有的8个柞蚕品种的线粒体基因组重建了这些品种的系统发育关系。吉林省10个柞蚕品种中,选大...
吉林省是我国二化性柞蚕(Antheraea pernyi)的种源基地,种茧产量占全国用种量的80%以上。本文测定了吉林省10个柞蚕品种的线粒体基因组,并结合已有的8个柞蚕品种的线粒体基因组重建了这些品种的系统发育关系。吉林省10个柞蚕品种中,选大4号的线粒体基因组为15 570 bp,其余9个品种(吉青、高油1号、永青、超杂1号、吉抗109、吉黄2号、选大2号、吉柞889、吉柞882)的线粒体基因组长度均为15 572 bp;这10个柞蚕品种的线粒体基因组均编码13个蛋白编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因。系统发育分析发现,供试的18个柞蚕品种分为3个线粒体DNA世系群,即豫早1号世系群、青黄1号世系群、青6号世系群;吉林的柞蚕品种5个属于青黄1号群,5个属于青6号群。18个柞蚕品种的线粒体基因组共鉴定出17个单倍型,其中吉黄2号和选大2号的序列完全一致。序列分析共鉴定出224个单核苷酸变异位点(包括20个插入/缺失位点),豫早1号群5个品种的多态性位点高达164个;青黄1号群6个品种的多态性位点仅为11个;青6号群7个品种的多态性位点为16个。分子变异方差分析(AMOVA)表明,豫早1号群与青6号群和青黄1号群之间的分化系数Fst高达0.66,而青6号群和青黄1号群之间的分化系数Fst也达到0.26。研究结果从分子水平揭示了这10个吉林柞蚕品种与辽宁种群高度同源;与河南品种资源相比,供试的10个吉林柞蚕品种资源的遗传基础较为狭窄。本研究为深入理解吉林柞蚕品种资源的遗传基础与创新利用提供了基本信息。
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关键词
柞蚕
线粒体基因组
品
种
资源
种内系统发育关系
吉林
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题名
吉林省10个柞蚕品种的线粒体基因组分析
1
作者
靳向东
王坤龙
郝大东
黄镜潮
万军
苗隆
张世宇
刘彦群
朱兴友
机构
吉林省蚕业科学研究院
河南省蚕业科学研究院
沈阳农业大学生物科学技术学院
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期405-412,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31972617)
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目
辽宁省应用基础研究计划项目(2022JH2/101300178)。
文摘
吉林省是我国二化性柞蚕(Antheraea pernyi)的种源基地,种茧产量占全国用种量的80%以上。本文测定了吉林省10个柞蚕品种的线粒体基因组,并结合已有的8个柞蚕品种的线粒体基因组重建了这些品种的系统发育关系。吉林省10个柞蚕品种中,选大4号的线粒体基因组为15 570 bp,其余9个品种(吉青、高油1号、永青、超杂1号、吉抗109、吉黄2号、选大2号、吉柞889、吉柞882)的线粒体基因组长度均为15 572 bp;这10个柞蚕品种的线粒体基因组均编码13个蛋白编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因。系统发育分析发现,供试的18个柞蚕品种分为3个线粒体DNA世系群,即豫早1号世系群、青黄1号世系群、青6号世系群;吉林的柞蚕品种5个属于青黄1号群,5个属于青6号群。18个柞蚕品种的线粒体基因组共鉴定出17个单倍型,其中吉黄2号和选大2号的序列完全一致。序列分析共鉴定出224个单核苷酸变异位点(包括20个插入/缺失位点),豫早1号群5个品种的多态性位点高达164个;青黄1号群6个品种的多态性位点仅为11个;青6号群7个品种的多态性位点为16个。分子变异方差分析(AMOVA)表明,豫早1号群与青6号群和青黄1号群之间的分化系数Fst高达0.66,而青6号群和青黄1号群之间的分化系数Fst也达到0.26。研究结果从分子水平揭示了这10个吉林柞蚕品种与辽宁种群高度同源;与河南品种资源相比,供试的10个吉林柞蚕品种资源的遗传基础较为狭窄。本研究为深入理解吉林柞蚕品种资源的遗传基础与创新利用提供了基本信息。
关键词
柞蚕
线粒体基因组
品
种
资源
种内系统发育关系
吉林
Keywords
Antheraea pernyi
Mitochondrial genome
Germplasm resource
Phylogenetic relationship
Jilin Province
分类号
S885.1 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
吉林省10个柞蚕品种的线粒体基因组分析
靳向东
王坤龙
郝大东
黄镜潮
万军
苗隆
张世宇
刘彦群
朱兴友
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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