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从松属相关物种筛选红松微卫星标记及其种群遗传多样性分析
被引量:
6
1
作者
张悦
易雪梅
姬兰柱
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期2307-2313,共7页
近缘物种筛选法是获取微卫星引物的主要方法之一。利用松属植物EST-SSRs的种间通用性,从马尾松微卫星引物中筛选出红松EST-SSR标记,并与已有的红松基因组SSR标记进行对比分析。采集长白山露水河红松母树林4个种群的248个样本,分析种群...
近缘物种筛选法是获取微卫星引物的主要方法之一。利用松属植物EST-SSRs的种间通用性,从马尾松微卫星引物中筛选出红松EST-SSR标记,并与已有的红松基因组SSR标记进行对比分析。采集长白山露水河红松母树林4个种群的248个样本,分析种群遗传多样性。结果表明:马尾松与红松的种间通用率为27.27%,松属内不同亚属物种间的种间通用性偏低;与红松基因组SSRs相比,EST-SSRs的单位点等位基因数(N a)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)等遗传多样性参数均较低;用2组引物分析4个种群的遗传多样性,发现有效等位基因均能反映出不同种群遗传变异的趋势,基因多样性均能反映出遗传同一性的差异,说明两组引物都能准确地反映红松种群的遗传多态性水平,新筛选的EST-SSRs可以用于红松种群遗传多样性研究。
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关键词
表达序列标签
基因组微卫星
种间通用性
种群遗传学分析
松属植物
长白山
原文传递
题名
从松属相关物种筛选红松微卫星标记及其种群遗传多样性分析
被引量:
6
1
作者
张悦
易雪梅
姬兰柱
机构
中国科学院沈阳应用生态研究所
中国科学院大学
出处
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期2307-2313,共7页
基金
国家"十二五"科技支撑项目(2012BAD22B040101)资助
文摘
近缘物种筛选法是获取微卫星引物的主要方法之一。利用松属植物EST-SSRs的种间通用性,从马尾松微卫星引物中筛选出红松EST-SSR标记,并与已有的红松基因组SSR标记进行对比分析。采集长白山露水河红松母树林4个种群的248个样本,分析种群遗传多样性。结果表明:马尾松与红松的种间通用率为27.27%,松属内不同亚属物种间的种间通用性偏低;与红松基因组SSRs相比,EST-SSRs的单位点等位基因数(N a)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)等遗传多样性参数均较低;用2组引物分析4个种群的遗传多样性,发现有效等位基因均能反映出不同种群遗传变异的趋势,基因多样性均能反映出遗传同一性的差异,说明两组引物都能准确地反映红松种群的遗传多态性水平,新筛选的EST-SSRs可以用于红松种群遗传多样性研究。
关键词
表达序列标签
基因组微卫星
种间通用性
种群遗传学分析
松属植物
长白山
Keywords
expressed sequence Taq(EST)
genomic SSR
interspecific transferability
population genetics analysis
Pinus species
Changbai Mountains
分类号
S791.247 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
从松属相关物种筛选红松微卫星标记及其种群遗传多样性分析
张悦
易雪梅
姬兰柱
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
6
原文传递
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