香蕉栽培品种基因组类型的分子标记鉴定体系建立

常见的栽培香蕉品种资源的基因组类型有AA、BB、AB、AAA、AAB、ABB、AAAA、AAAB等,一般依赖于外部植物学特征性状鉴定,耗时长、易出错。为建立一个快速、准确的香蕉基因组类型鉴定体系。本研究以已知基因组类型的香蕉品种资源为材料,利用流式细胞术与分子标记,建立了该体系:(1)首先使用流式细胞术鉴定倍性;(2)提取基因组DNA后,使用ITS-PCR-RFLP或BanActin分子标记鉴定是否含有A、B基因组;若只含有A或只含B基因组,结合倍性结果即可鉴定出类型为AA、BB、AAA、AAAA等;若同时含有A和B,倍性结果为二倍体,即可鉴定出类型为AB;(3)若同时含有A和B,且倍性结果为三倍体或四倍体时,则需下一步copia-IRAP分子标记鉴定。copia-IRAP分子标记结果在200 bp处有两条特异条带且倍性结果为三倍体,则鉴定为ABB类型,若为四倍体则鉴定为ABBB类型;若在300 bp和100 bp处有特异条带,如倍性结果为三倍体则鉴定为AAB类型,如果为四倍体则鉴定为AAAB或AABB类型。此外,本研究还使用该体系对8份未明确基因组类型的香蕉种质进行了鉴定,测得‘鸡蕉’、‘Vellapalayan kodan’为AAB类型,‘Dwarf French Plantain’、‘MY3’、‘YN5’、‘佳丽蕉’和‘佛手蕉’为AA类型,‘贵妃蕉’为AAA类型。本研究建立的体系可基本满足常见香蕉栽培品种的基因组类型鉴定,可为种质资源精准评价和杂交种质鉴定奠定基础。