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ETL在科学标本数据规范化集成整编中的应用
1
作者
吴志远
杨眉
+1 位作者
何明跃
施爽
《中国科技资源导刊》
2017年第5期68-73,81,共7页
在科学标本数据的规范化集成整编中,标准和规范是前提,资源数据的整合、集成是核心。ETL技术能够实现对数据的抽取、转换和装载。本文将其引入到科学标本数据规范化集成整编中,实现对多源的、异构的标本数据的汇集和整合,并以岩矿化石...
在科学标本数据的规范化集成整编中,标准和规范是前提,资源数据的整合、集成是核心。ETL技术能够实现对数据的抽取、转换和装载。本文将其引入到科学标本数据规范化集成整编中,实现对多源的、异构的标本数据的汇集和整合,并以岩矿化石标本数据集成整编为例进行应用实践,取得了较好的应用效果,证明了应用ETL技术实现标本数据规范化集成整编的有效性。该方法具有一定的实践借鉴意义,可为其他资源数据的规范化集成整编提供一定的科学参考。
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关键词
ETL
科学标本
数据集成整编
数据整合
KETTLE
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职称材料
科学标本资源汇交整编规范与实践
被引量:
3
2
作者
谢园
杨眉
+1 位作者
何明跃
吴志远
《中国科技资源导刊》
2017年第5期21-29,共9页
科学标本资源是科技资源的重要组成部分,科学标本资源分为八大类:植物种质资源、动物种质资源、微生物菌种资源、人类遗传资源、生物标本资源、岩矿化石标本资源、实验材料资源及标准物质。本文在国家科技资源共享平台建设和科技基础性...
科学标本资源是科技资源的重要组成部分,科学标本资源分为八大类:植物种质资源、动物种质资源、微生物菌种资源、人类遗传资源、生物标本资源、岩矿化石标本资源、实验材料资源及标准物质。本文在国家科技资源共享平台建设和科技基础性工作项目数据汇交过程管理实践经验的基础上,研究科学标本的汇交要素、基础性资料元数据标准,以及标本资源在名称标识、归类编码、原产地、来源、特征特性、图像、保存收藏信息、共享信息等8个方面的共性描述规范。进一步以"中国古人类遗址"为例,通过数据表设计、原始数据分析与导入、元数据编写和数据文档整理对标本数据进行整编,并探讨了标本数据库的应用前景,对国家科技计划项目执行过程中产生科学标本资源的汇交、数据集成与共享具有重要意义。
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关键词
科学标本
描述规范
数据规范
标本
数据库
数据共享
整编
下载PDF
职称材料
科学研究和科普教育的重要基地——记中国科学院南京土壤研究所标本馆
被引量:
4
3
作者
陈冬峰
《土壤》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期86-88,共3页
关键词
科学
研究
科普教育
中国
科学
院南京土壤研究所
标本
馆
下载PDF
职称材料
植物模式标本的考证与数字化:以中国国家植物标本馆为例
被引量:
19
4
作者
林祁
杨志荣
+31 位作者
包伯坚
林云
张小冰
班勤
秘树青
曹子余
陈淑荣
陈雅丽
杜青
杜玉芬
傅连中
高玳
何东东
何珊珊
敬璇
李安仁
李红丽
李敏
李倩云
刘文群
马欣堂
石青春
宋莉
孙苗
孙茜
王明琼
王忠涛
吴慧冰
吴佳丽
吴婷婷
云映霞
赵慧娟
《科研信息化技术与应用》
2017年第4期63-76,共14页
模式标本是最重要的植物标本,是确定植物学名的依据,是植物分类学家从事植物系统分类研究必不可少的科学材料,也是开展专科专属研究、编写国家或地方植物志、进行植物区系调查研究、开发利用和保护植物资源的重要基本资料。但模式标本...
模式标本是最重要的植物标本,是确定植物学名的依据,是植物分类学家从事植物系统分类研究必不可少的科学材料,也是开展专科专属研究、编写国家或地方植物志、进行植物区系调查研究、开发利用和保护植物资源的重要基本资料。但模式标本的人为和自然毁损难以避免,模式标本及其标签信息的数字化使得模式标本的形态、地理分布、采集等主要信息得到最大限度的永久保存,可以极大地方便模式标本信息的共享,可以为科学研究人员或相关人员提供植物形态、地理分布、历史变迁等多方面的信息。本文以中国科学院植物研究所国家植物标本馆维管束植物模式标本数字化建设为例,详细介绍了规范化整理模式标本的方法、模式标本数字化的操作流程,并通过大量实例介绍了模式标本考订的过程、常见问题的处理方法等,以期为其他单位开展模式标本数字化建设提供经验。
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关键词
中国
科学
院植物研究所国家植物
标本
馆
分类学
模式
标本
模式
标本
数字化
原文传递
基于中国馆藏标本数据分析全国植物标本采集现状及采集趋势预测
被引量:
4
5
作者
姜承勇
余卫星
+3 位作者
杨婷
简进龙
左静
刘博
《科研信息化技术与应用》
2018年第5期94-101,共8页
目的馆藏植物标本数字化和信息化适应了当代植物学研究的需要,为了解我国植物标本的采集状况,预测可能的采集空缺,我们对中国数字植物标本馆(NSII)和中国科学院植物研究所标本馆的植物的馆藏植物进行了统计和分析。方法采用ACESS对两大...
目的馆藏植物标本数字化和信息化适应了当代植物学研究的需要,为了解我国植物标本的采集状况,预测可能的采集空缺,我们对中国数字植物标本馆(NSII)和中国科学院植物研究所标本馆的植物的馆藏植物进行了统计和分析。方法采用ACESS对两大标本库植物标本信息进行整理,通过TNRS对植物标本信息进行核对,借助DIVA-GIS软件绘制植物标本区域分布图。结果截至到目前,馆藏植物标本共计216万份,采集地点覆盖全国34个行政区5883个县(包括县别名),采集植物种类涉及384个科,56188个种,涵盖了我国目前已鉴别的302个科。其中采集植物标本最多的科为蔷薇科(150152),占植物标本总数的6.95%,其次为菊科(130114),占总数的6.02%,而采集植物最多的种类为槭树科的青榨槭(6966),其次为樟科的山苍子(6839)。除此之外,还对植物标本的命名人、采集时间、采集地点等信息进行了统计和汇总。结论通过植物标本数据的统计和分析,我们发现,数字化植物标本馆记载的植物采集信息普遍存在异名及错误命名、信息不完整等问题。根据当前采集信息,预测新疆、西藏地区植物标本采集空间较大。
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关键词
中国数字植物
标本
馆
中国
科学
院植物研究所
标本
馆
DIVA-GIS
中国植物志
原文传递
题名
ETL在科学标本数据规范化集成整编中的应用
1
作者
吴志远
杨眉
何明跃
施爽
机构
中国地质大学(北京)
出处
《中国科技资源导刊》
2017年第5期68-73,81,共7页
基金
科技基础性工作专项重点项目"科技基础性工作数据资料集成与规范化整编"(2013FY110900)
国家科技基础条件平台项目"国家岩矿化石标本资源共享平台"
文摘
在科学标本数据的规范化集成整编中,标准和规范是前提,资源数据的整合、集成是核心。ETL技术能够实现对数据的抽取、转换和装载。本文将其引入到科学标本数据规范化集成整编中,实现对多源的、异构的标本数据的汇集和整合,并以岩矿化石标本数据集成整编为例进行应用实践,取得了较好的应用效果,证明了应用ETL技术实现标本数据规范化集成整编的有效性。该方法具有一定的实践借鉴意义,可为其他资源数据的规范化集成整编提供一定的科学参考。
关键词
ETL
科学标本
数据集成整编
数据整合
KETTLE
Keywords
ETL
scientific specimen
integrated reorganization of data
data integration
Kettle
分类号
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
下载PDF
职称材料
题名
科学标本资源汇交整编规范与实践
被引量:
3
2
作者
谢园
杨眉
何明跃
吴志远
机构
中国地质大学(北京)
出处
《中国科技资源导刊》
2017年第5期21-29,共9页
基金
科技基础性工作专项重点项目"科技基础性工作数据资料集成与规范化整编"(2013FY110900)
国家科技基础条件平台项目"国家岩矿化石标本资源共享平台"
文摘
科学标本资源是科技资源的重要组成部分,科学标本资源分为八大类:植物种质资源、动物种质资源、微生物菌种资源、人类遗传资源、生物标本资源、岩矿化石标本资源、实验材料资源及标准物质。本文在国家科技资源共享平台建设和科技基础性工作项目数据汇交过程管理实践经验的基础上,研究科学标本的汇交要素、基础性资料元数据标准,以及标本资源在名称标识、归类编码、原产地、来源、特征特性、图像、保存收藏信息、共享信息等8个方面的共性描述规范。进一步以"中国古人类遗址"为例,通过数据表设计、原始数据分析与导入、元数据编写和数据文档整理对标本数据进行整编,并探讨了标本数据库的应用前景,对国家科技计划项目执行过程中产生科学标本资源的汇交、数据集成与共享具有重要意义。
关键词
科学标本
描述规范
数据规范
标本
数据库
数据共享
整编
Keywords
scientific specimen
description specification
data specification
specimen database
date sharing
reorganize
分类号
G312 [文化科学]
下载PDF
职称材料
题名
科学研究和科普教育的重要基地——记中国科学院南京土壤研究所标本馆
被引量:
4
3
作者
陈冬峰
机构
中国科学院南京土壤研究所
出处
《土壤》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期86-88,共3页
关键词
科学
研究
科普教育
中国
科学
院南京土壤研究所
标本
馆
分类号
S15-24 [农业科学—土壤学]
下载PDF
职称材料
题名
植物模式标本的考证与数字化:以中国国家植物标本馆为例
被引量:
19
4
作者
林祁
杨志荣
包伯坚
林云
张小冰
班勤
秘树青
曹子余
陈淑荣
陈雅丽
杜青
杜玉芬
傅连中
高玳
何东东
何珊珊
敬璇
李安仁
李红丽
李敏
李倩云
刘文群
马欣堂
石青春
宋莉
孙苗
孙茜
王明琼
王忠涛
吴慧冰
吴佳丽
吴婷婷
云映霞
赵慧娟
机构
中国科学院植物研究所国家植物标本馆
湖南省医药技工学校
太原师范学院生物系
河北师范大学生命科学学院
海淀区农业科学研究所
出处
《科研信息化技术与应用》
2017年第4期63-76,共14页
基金
国家科技基础条件平台(标本资源共享平台建设)项目(2005DKA21401)
文摘
模式标本是最重要的植物标本,是确定植物学名的依据,是植物分类学家从事植物系统分类研究必不可少的科学材料,也是开展专科专属研究、编写国家或地方植物志、进行植物区系调查研究、开发利用和保护植物资源的重要基本资料。但模式标本的人为和自然毁损难以避免,模式标本及其标签信息的数字化使得模式标本的形态、地理分布、采集等主要信息得到最大限度的永久保存,可以极大地方便模式标本信息的共享,可以为科学研究人员或相关人员提供植物形态、地理分布、历史变迁等多方面的信息。本文以中国科学院植物研究所国家植物标本馆维管束植物模式标本数字化建设为例,详细介绍了规范化整理模式标本的方法、模式标本数字化的操作流程,并通过大量实例介绍了模式标本考订的过程、常见问题的处理方法等,以期为其他单位开展模式标本数字化建设提供经验。
关键词
中国
科学
院植物研究所国家植物
标本
馆
分类学
模式
标本
模式
标本
数字化
Keywords
PE
taxonomy
type specimen
type specimen database
分类号
G269.2 [历史地理—考古学及博物馆学]
原文传递
题名
基于中国馆藏标本数据分析全国植物标本采集现状及采集趋势预测
被引量:
4
5
作者
姜承勇
余卫星
杨婷
简进龙
左静
刘博
机构
中央民族大学生命与环境科学学院
广西防金花茶国家级自然保护区
出处
《科研信息化技术与应用》
2018年第5期94-101,共8页
基金
中国科学院战略性先导科技专项(A类)(XDA19050404)
国家标本资源共享平台(2005DKA21400)
+1 种基金
中国博士后科学基金资助项目(2017M611041)
国家自然科学基金青年基金项目(31400182)
文摘
目的馆藏植物标本数字化和信息化适应了当代植物学研究的需要,为了解我国植物标本的采集状况,预测可能的采集空缺,我们对中国数字植物标本馆(NSII)和中国科学院植物研究所标本馆的植物的馆藏植物进行了统计和分析。方法采用ACESS对两大标本库植物标本信息进行整理,通过TNRS对植物标本信息进行核对,借助DIVA-GIS软件绘制植物标本区域分布图。结果截至到目前,馆藏植物标本共计216万份,采集地点覆盖全国34个行政区5883个县(包括县别名),采集植物种类涉及384个科,56188个种,涵盖了我国目前已鉴别的302个科。其中采集植物标本最多的科为蔷薇科(150152),占植物标本总数的6.95%,其次为菊科(130114),占总数的6.02%,而采集植物最多的种类为槭树科的青榨槭(6966),其次为樟科的山苍子(6839)。除此之外,还对植物标本的命名人、采集时间、采集地点等信息进行了统计和汇总。结论通过植物标本数据的统计和分析,我们发现,数字化植物标本馆记载的植物采集信息普遍存在异名及错误命名、信息不完整等问题。根据当前采集信息,预测新疆、西藏地区植物标本采集空间较大。
关键词
中国数字植物
标本
馆
中国
科学
院植物研究所
标本
馆
DIVA-GIS
中国植物志
Keywords
CVH
PE herbarium
TNRS
DIVA-GIS
flora of China
分类号
Q94-341 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ETL在科学标本数据规范化集成整编中的应用
吴志远
杨眉
何明跃
施爽
《中国科技资源导刊》
2017
0
下载PDF
职称材料
2
科学标本资源汇交整编规范与实践
谢园
杨眉
何明跃
吴志远
《中国科技资源导刊》
2017
3
下载PDF
职称材料
3
科学研究和科普教育的重要基地——记中国科学院南京土壤研究所标本馆
陈冬峰
《土壤》
CAS
CSCD
北大核心
2003
4
下载PDF
职称材料
4
植物模式标本的考证与数字化:以中国国家植物标本馆为例
林祁
杨志荣
包伯坚
林云
张小冰
班勤
秘树青
曹子余
陈淑荣
陈雅丽
杜青
杜玉芬
傅连中
高玳
何东东
何珊珊
敬璇
李安仁
李红丽
李敏
李倩云
刘文群
马欣堂
石青春
宋莉
孙苗
孙茜
王明琼
王忠涛
吴慧冰
吴佳丽
吴婷婷
云映霞
赵慧娟
《科研信息化技术与应用》
2017
19
原文传递
5
基于中国馆藏标本数据分析全国植物标本采集现状及采集趋势预测
姜承勇
余卫星
杨婷
简进龙
左静
刘博
《科研信息化技术与应用》
2018
4
原文传递
已选择
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