ETL在科学标本数据规范化集成整编中的应用

在科学标本数据的规范化集成整编中,标准和规范是前提,资源数据的整合、集成是核心。ETL技术能够实现对数据的抽取、转换和装载。本文将其引入到科学标本数据规范化集成整编中,实现对多源的、异构的标本数据的汇集和整合,并以岩矿化石标本数据集成整编为例进行应用实践,取得了较好的应用效果,证明了应用ETL技术实现标本数据规范化集成整编的有效性。该方法具有一定的实践借鉴意义,可为其他资源数据的规范化集成整编提供一定的科学参考。

科学标本资源汇交整编规范与实践

科学标本资源是科技资源的重要组成部分,科学标本资源分为八大类:植物种质资源、动物种质资源、微生物菌种资源、人类遗传资源、生物标本资源、岩矿化石标本资源、实验材料资源及标准物质。本文在国家科技资源共享平台建设和科技基础性工作项目数据汇交过程管理实践经验的基础上,研究科学标本的汇交要素、基础性资料元数据标准,以及标本资源在名称标识、归类编码、原产地、来源、特征特性、图像、保存收藏信息、共享信息等8个方面的共性描述规范。进一步以"中国古人类遗址"为例,通过数据表设计、原始数据分析与导入、元数据编写和数据文档整理对标本数据进行整编,并探讨了标本数据库的应用前景,对国家科技计划项目执行过程中产生科学标本资源的汇交、数据集成与共享具有重要意义。

植物模式标本的考证与数字化:以中国国家植物标本馆为例

模式标本是最重要的植物标本,是确定植物学名的依据,是植物分类学家从事植物系统分类研究必不可少的科学材料,也是开展专科专属研究、编写国家或地方植物志、进行植物区系调查研究、开发利用和保护植物资源的重要基本资料。但模式标本的人为和自然毁损难以避免,模式标本及其标签信息的数字化使得模式标本的形态、地理分布、采集等主要信息得到最大限度的永久保存,可以极大地方便模式标本信息的共享,可以为科学研究人员或相关人员提供植物形态、地理分布、历史变迁等多方面的信息。本文以中国科学院植物研究所国家植物标本馆维管束植物模式标本数字化建设为例,详细介绍了规范化整理模式标本的方法、模式标本数字化的操作流程,并通过大量实例介绍了模式标本考订的过程、常见问题的处理方法等,以期为其他单位开展模式标本数字化建设提供经验。

基于中国馆藏标本数据分析全国植物标本采集现状及采集趋势预测

目的馆藏植物标本数字化和信息化适应了当代植物学研究的需要,为了解我国植物标本的采集状况,预测可能的采集空缺,我们对中国数字植物标本馆(NSII)和中国科学院植物研究所标本馆的植物的馆藏植物进行了统计和分析。方法采用ACESS对两大标本库植物标本信息进行整理,通过TNRS对植物标本信息进行核对,借助DIVA-GIS软件绘制植物标本区域分布图。结果截至到目前,馆藏植物标本共计216万份,采集地点覆盖全国34个行政区5883个县(包括县别名),采集植物种类涉及384个科,56188个种,涵盖了我国目前已鉴别的302个科。其中采集植物标本最多的科为蔷薇科(150152),占植物标本总数的6.95%,其次为菊科(130114),占总数的6.02%,而采集植物最多的种类为槭树科的青榨槭(6966),其次为樟科的山苍子(6839)。除此之外,还对植物标本的命名人、采集时间、采集地点等信息进行了统计和汇总。结论通过植物标本数据的统计和分析,我们发现,数字化植物标本馆记载的植物采集信息普遍存在异名及错误命名、信息不完整等问题。根据当前采集信息,预测新疆、西藏地区植物标本采集空间较大。