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稀有变异关联分析研究进展及其在畜禽中的应用展望
被引量:
1
1
作者
苗健
常天鹏
+3 位作者
史新平
夏江威
高会江
李俊雅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第7期1173-1180,共8页
在过去十年里,全基因组关联分析成功鉴定了数以千计的常见变异与常见疾病(性状)的关联。尽管如此,缺失遗传力的问题逐渐引起了广泛关注。由于GWAS的目标是鉴定常见变异与表型的关联,稀有变异成为解释缺失遗传力的一个重要答案。随着测...
在过去十年里,全基因组关联分析成功鉴定了数以千计的常见变异与常见疾病(性状)的关联。尽管如此,缺失遗传力的问题逐渐引起了广泛关注。由于GWAS的目标是鉴定常见变异与表型的关联,稀有变异成为解释缺失遗传力的一个重要答案。随着测序技术的发展,人们得以研究稀有变异与复杂疾病(性状)的关联。一系列的稀有变异关联分析(RVAS)方法被提出并应用于人类复杂疾病中,然而在畜禽上鲜有研究。本文首先综述了RVAS中具有代表性的测序核关联检验(SKAT)及其家族;其后,总结了两种在稀有变异中常用的提高效力的方法:极端表型抽样和荟萃分析;然后,探讨了使用芯片数据研究RVAS的方法:基因型填充和稀有单倍型关联分析;最后展望了稀有变异关联分析在畜禽上的应用前景。
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关键词
稀有
变异关联分析
极端表
型
抽样
荟萃分析
基因
型
填充
稀有单倍型
下载PDF
职称材料
题名
稀有变异关联分析研究进展及其在畜禽中的应用展望
被引量:
1
1
作者
苗健
常天鹏
史新平
夏江威
高会江
李俊雅
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
福建农林大学动物科学学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第7期1173-1180,共8页
基金
国家自然科学基金(31472079)
文摘
在过去十年里,全基因组关联分析成功鉴定了数以千计的常见变异与常见疾病(性状)的关联。尽管如此,缺失遗传力的问题逐渐引起了广泛关注。由于GWAS的目标是鉴定常见变异与表型的关联,稀有变异成为解释缺失遗传力的一个重要答案。随着测序技术的发展,人们得以研究稀有变异与复杂疾病(性状)的关联。一系列的稀有变异关联分析(RVAS)方法被提出并应用于人类复杂疾病中,然而在畜禽上鲜有研究。本文首先综述了RVAS中具有代表性的测序核关联检验(SKAT)及其家族;其后,总结了两种在稀有变异中常用的提高效力的方法:极端表型抽样和荟萃分析;然后,探讨了使用芯片数据研究RVAS的方法:基因型填充和稀有单倍型关联分析;最后展望了稀有变异关联分析在畜禽上的应用前景。
关键词
稀有
变异关联分析
极端表
型
抽样
荟萃分析
基因
型
填充
稀有单倍型
Keywords
RVAS
extreme phenotype sample
meta-analysis
imputation
rare haplotype
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
稀有变异关联分析研究进展及其在畜禽中的应用展望
苗健
常天鹏
史新平
夏江威
高会江
李俊雅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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参考文献
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