侵染稀硷的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征

从云南红河稀硷上分离到病毒分离物Y6 4 ,全序列测定表明 ,Y6 4DNA_A全长 2 730个核苷酸。基因组比较发现 ,Y6 4DNA_A与中国番茄黄化曲叶病毒Y38分离物 (TYLCCNV_[Y38])同源性最高 (99% ) ,与中国番茄黄化曲叶病毒广西分离物 (TYLCCNV)的同源性次之 (96 % ) ,而与亚洲地区的其它双生病毒的同源性均在 83%以下 ,表明稀硷上的分离物Y6 4是TYLCCNV的 1个分离物。利用DNAβ的特异性引物beta0 1和beta0 2 ,在病毒分离物Y6 4中扩增到卫星DNA分子 (Y6 4 β)。序列分析表明 ,Y6 4 β全长 1 340个核苷酸 ,至少在其互补链上编码 1个有功能的ORF(C1 )。Y6 4 β的全序列与TYLCCNV的各个分离物的卫星分子 (Y38β、Y36 β和Y8β)的同源性最高 ,分别为 99 5 %、99 5 %和 99 3% ;与其它已报道的卫星DNAβ的同源性均低于 6 6 4 %。系统关系树研究表明 ,卫星DNAβ分子与其辅助病毒是共同进化的。