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基于生物信息学的小麦ALAD基因的鉴定和分析
被引量:
1
1
作者
蒋宏宝
王娜
+6 位作者
简俊涛
张震
许喜棠
张小燕
魏红升
王成社
谢彦周
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1281-1287,共7页
5-氨基乙酰丙酸脱水酶(δ-aminoaevulinic acid dehydratase,ALAD)是生物体所有四吡咯化合物生物合成所必需的酶。为了给ALAD基因功能研究奠定基础,本研究根据模式植物拟南芥和水稻的ALAD基因序列,利用生物信息学手段对普通小麦ALAD基...
5-氨基乙酰丙酸脱水酶(δ-aminoaevulinic acid dehydratase,ALAD)是生物体所有四吡咯化合物生物合成所必需的酶。为了给ALAD基因功能研究奠定基础,本研究根据模式植物拟南芥和水稻的ALAD基因序列,利用生物信息学手段对普通小麦ALAD基因进行鉴定和分析。结果表明,普通小麦有6个ALAD基因,其中TaALAD-A1、TaALAD-B1和TaALAD-D1基因位于第七同源群染色体长臂,而TaALAD-A2、TaALAD-B2和TaALAD-D2基因位于第六同源群染色体短臂。6个ALAD基因均含有保守的ALAD结构域,但系统发育分析中可分为2组。转录组数据表达分析结果显示,TaALAD-1基因在各个组织中的表达量均高于TaALAD-2,但两者在叶片中的表达量均最高。干旱胁迫对小麦TaALAD-1和TaALAD-2的表达几乎无影响;TaALAD-1的表达量在热胁迫1h下调,而在热胁迫6h时上调;热胁迫1h和6h对TaALAD-2的表达几乎无影响。通过小麦TILLING数据库分析,6个TaALAD基因都找到了数量不同的突变位点,其中一些突变位点为起始位点突变、无义突变、转录终止位点突变和剪切位点突变,可能影响该基因的功能。
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关键词
普通小麦
ALAD基因
表达
分析
突变体分析
下载PDF
职称材料
斑马鱼生物钟分子遗传学和基因组学研究进展
被引量:
2
2
作者
仲兆民
张淑青
王晗
《生命科学》
CSCD
2015年第11期1364-1371,共8页
生物钟是生物长期适应地球昼夜循环变化而演化的内在自持的计时机制。生物钟对分子、生化、细胞、生理和行为等基本生命过程起到重要的调节作用。生物钟紊乱会导致机体失调而引发各类疾病。斑马鱼作为一种重要的脊椎动物模型在研究生物...
生物钟是生物长期适应地球昼夜循环变化而演化的内在自持的计时机制。生物钟对分子、生化、细胞、生理和行为等基本生命过程起到重要的调节作用。生物钟紊乱会导致机体失调而引发各类疾病。斑马鱼作为一种重要的脊椎动物模型在研究生物钟方面有其独特的特点与优势。现主要综述利用转基因技术、突变体分析和转录组手段等解析斑马鱼生物钟调节机制的最新进展。
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关键词
斑马鱼
生物钟
突变体分析
反向遗传学
基因组学
原文传递
题名
基于生物信息学的小麦ALAD基因的鉴定和分析
被引量:
1
1
作者
蒋宏宝
王娜
简俊涛
张震
许喜棠
张小燕
魏红升
王成社
谢彦周
机构
西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室
南阳市农业科学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1281-1287,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0102101)
陕西省科技统筹创新工程计划项目(2015KTZDNY01-01-02)
+1 种基金
西北农林科技大学南阳小麦试验示范站建设项目
西北农林科技大学唐仲英育种基金项目
文摘
5-氨基乙酰丙酸脱水酶(δ-aminoaevulinic acid dehydratase,ALAD)是生物体所有四吡咯化合物生物合成所必需的酶。为了给ALAD基因功能研究奠定基础,本研究根据模式植物拟南芥和水稻的ALAD基因序列,利用生物信息学手段对普通小麦ALAD基因进行鉴定和分析。结果表明,普通小麦有6个ALAD基因,其中TaALAD-A1、TaALAD-B1和TaALAD-D1基因位于第七同源群染色体长臂,而TaALAD-A2、TaALAD-B2和TaALAD-D2基因位于第六同源群染色体短臂。6个ALAD基因均含有保守的ALAD结构域,但系统发育分析中可分为2组。转录组数据表达分析结果显示,TaALAD-1基因在各个组织中的表达量均高于TaALAD-2,但两者在叶片中的表达量均最高。干旱胁迫对小麦TaALAD-1和TaALAD-2的表达几乎无影响;TaALAD-1的表达量在热胁迫1h下调,而在热胁迫6h时上调;热胁迫1h和6h对TaALAD-2的表达几乎无影响。通过小麦TILLING数据库分析,6个TaALAD基因都找到了数量不同的突变位点,其中一些突变位点为起始位点突变、无义突变、转录终止位点突变和剪切位点突变,可能影响该基因的功能。
关键词
普通小麦
ALAD基因
表达
分析
突变体分析
Keywords
Triticum aestivum L.ALAD genes
Expression analysis
Mutation analysis
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
斑马鱼生物钟分子遗传学和基因组学研究进展
被引量:
2
2
作者
仲兆民
张淑青
王晗
机构
苏州大学生物钟研究中心
出处
《生命科学》
CSCD
2015年第11期1364-1371,共8页
基金
国家重大科学研究计划(2012CB947600)
国家自然科学基金重点项目(31030062)
文摘
生物钟是生物长期适应地球昼夜循环变化而演化的内在自持的计时机制。生物钟对分子、生化、细胞、生理和行为等基本生命过程起到重要的调节作用。生物钟紊乱会导致机体失调而引发各类疾病。斑马鱼作为一种重要的脊椎动物模型在研究生物钟方面有其独特的特点与优势。现主要综述利用转基因技术、突变体分析和转录组手段等解析斑马鱼生物钟调节机制的最新进展。
关键词
斑马鱼
生物钟
突变体分析
反向遗传学
基因组学
Keywords
zebrafish
circadian clocks
mutational analysis
reverse genetics
genomics
分类号
Q41 [生物学—生理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学的小麦ALAD基因的鉴定和分析
蒋宏宝
王娜
简俊涛
张震
许喜棠
张小燕
魏红升
王成社
谢彦周
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
2
斑马鱼生物钟分子遗传学和基因组学研究进展
仲兆民
张淑青
王晗
《生命科学》
CSCD
2015
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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