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一个常染色体显性遗传视网膜色素变性家系突变基因筛查
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作者 王飞 周新 +2 位作者 宋贵波 丁锋 王春芳 《现代检验医学杂志》 CAS 2010年第3期50-54,共5页
目的对一个四代常染色体显性遗传视网膜色素变性家系进行突变基因的筛查。方法选取了常见的11个视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)相关致病基因:视紫红质(rhodopsin,RHO,RP4)基因、视网膜变性慢蛋白(peripherin 2/reti... 目的对一个四代常染色体显性遗传视网膜色素变性家系进行突变基因的筛查。方法选取了常见的11个视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)相关致病基因:视紫红质(rhodopsin,RHO,RP4)基因、视网膜变性慢蛋白(peripherin 2/retinal degeneration slow PRPH2/RDS,RP7)基因、视网膜色素变性1(retinitis pigmentosa 1,RP1)基因、前体mRNA处理因子31(pre—mRNA processing factor31,PRPF31,RP11)基因、次黄苷单磷酸脱氢酶1型(inosine monophosphate dehydrogenase 1,IMPDH1,RP10)基因、视杆外节蛋白1(rod outer segment protein 1,ROM1)基因、神经视网膜亮氨酸拉链(neural retina leucine zipper,NRL,RP27)基因、Pim1激酶相关蛋白1(piml—kinase associated protein1,PAP1,RP9)基因、视锥-视杆同源盒(cone—rod homeobox—containing,CRX)基因、前体mRNA处理因子3(pre—mRNA processing factor3,PRPF3,RP18)基因、前体mRNA处理因子8(pre—mRNA processing factor 8,PRPF8,RP13)基因。通过聚合酶链式反应扩增这11个RP相关致病基因的外显子和邻近拼接位点,扩增产物进行正、反双向测序。结果①对常见的11个RP相关致病基因的64个片段的研究显示,除了基因多态性和内含子的变异外,未发现与疾病有关的外显子或邻近拼接住点的突变。②首次在中国人种中发现RP9基因的c.629A→G,(Lys210Arg)变异。结论该文设计研究的突变基因未被检测到,表明此家系在11个RP相关致病基因的外显子和邻近拼接位点无基因突变。 展开更多
关键词 视网膜色素变性 常染色体显性遗传 突变基因筛查
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筛查基因突变的新技术──循环双脱氧指纹图谱法及其应用 被引量:3
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作者 刘敬忠 向华 +6 位作者 张纪平 毛燕玲 赵离钟 张鹏 朱章菱 翁心植 卢圣栋 《高技术通讯》 CAS CSCD 1996年第1期37-41,共5页
建立了适用于大批量标本基因突变筛查的双脱氧指纹图谱法即ddF。该技术集测定DNA序列的%脱氧末端终止法及SSCP二者长处于一身,即只作一个(例如用ddA)双脱氧末端终止反应,然后将反应产物在与SSCP相同的电泳条件下... 建立了适用于大批量标本基因突变筛查的双脱氧指纹图谱法即ddF。该技术集测定DNA序列的%脱氧末端终止法及SSCP二者长处于一身,即只作一个(例如用ddA)双脱氧末端终止反应,然后将反应产物在与SSCP相同的电泳条件下进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,这样有突变的样品不会漏检,阳性检出率高达100%。简化了原方法中RNA转录及逆转录等步骤,直接以PCR产物为模板,将双链DNA循环测序的反应用作ddF反应,称之为Cycle-ddF,省去了T7RNA聚合酶及MMV逆转录酶二种酶。这样,Cycle-ddF既保持了阳性检出率高的优点,又降低了成本,简化了步骤,使之便于在大多数实验室推广开展。运用Cyele-ddF技术进行了乙型血友病(HB)患者九因子基因(F Ⅸ)及β地中海贫血患者β珠蛋白基因突变的筛查。对筛查出的有异常指纹图谱的片段,进而用ABD373A-01型DNA自动测序仪有针对性地测出了具体突变点。 展开更多
关键词 指纹图谱法 基因突变筛查 DNA测序
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听力正常孕妇非综合征性耳聋基因GJB2、GJB3、SLC26A4和线粒体12S rRNA突变分析
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作者 孙洁 李丹丹 聂小丽 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第2期280-283,共4页
目的:分析听力正常孕妇非综合征性耳聋基因GJB2、GJB3、SLC26A4和线粒体12S rRNA突变特点。方法:利用基因芯片技术,对2 000例听力正常孕妇(22~43岁)进行GJB2、GJB3、SLC26A4和线粒体12S rRNA突变筛查;对携带突变的孕妇配偶(24~46岁)进... 目的:分析听力正常孕妇非综合征性耳聋基因GJB2、GJB3、SLC26A4和线粒体12S rRNA突变特点。方法:利用基因芯片技术,对2 000例听力正常孕妇(22~43岁)进行GJB2、GJB3、SLC26A4和线粒体12S rRNA突变筛查;对携带突变的孕妇配偶(24~46岁)进行基因测序;对夫妻携带同一突变的孕妇行羊水穿刺产前诊断,分娩3个月后门诊随访。结果:2 000例听力正常孕妇中,94例携带突变(其中3例为GJB2和SLC26A4双杂合突变),GJB2、SLC26A4、GJB3和线粒体12S rRNA突变检出率分别为2.40%、1.90%、0.30%和0.25%。GJB2基因235delC与SLC26A4基因IVS7-2A>G最为常见,检出率分别为1.45%、1.25%。94例孕妇的配偶中检出9例(9.57%)突变携带者。夫妻携带同一突变的家庭有6组:其中1例产前诊断未检出突变,1例确诊为GJB2基因杂合突变,新生儿均无听力异常;2例产前确诊为GJB2基因纯合突变,新生儿计划植入人工耳蜗;2例为SLC26A4基因复合杂合突变,其中1例自然流产,另1例计划植入人工耳蜗。结论:GJB2基因235delC和SLC26A4基因IVS7-2A>G是导致新生儿耳聋的重要突变。 展开更多
关键词 非综合征性耳聋 基因突变筛查 产前诊断
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主动脉瓣上狭窄患者的弹力蛋白基因突变筛查 被引量:2
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作者 刘洋 徐丽娟 孙锟 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期237-242,共6页
目的对综合征型和单纯型主动脉瓣上狭窄(SVAS)患者,进行弹力蛋白基因的突变筛查,分析综合征型患者心血管疾病表型差异性的原因及单纯型患者发病的遗传学基础。方法收集8例威廉姆斯综合征(WS)患者,6例单纯型SVAS患者。采用MLPA技术... 目的对综合征型和单纯型主动脉瓣上狭窄(SVAS)患者,进行弹力蛋白基因的突变筛查,分析综合征型患者心血管疾病表型差异性的原因及单纯型患者发病的遗传学基础。方法收集8例威廉姆斯综合征(WS)患者,6例单纯型SVAS患者。采用MLPA技术进行微缺失检测,并应用PCR技术扩增弹力蛋白基因的全部外显子序列。对所有扩增片段均进行测序,将测序结果与Gen Bank中的弹力蛋白基因序列通过BLAST程序比对以检出可能存在的突变。结果 8例综合征型SVAS患者均有位于7q11.23区域内的杂合性缺失,长度1.04-1.61 Mb;未在单纯型SVAS患者中检测到微缺失。共检测到7个单核苷酸多态性(SNPs)位点,其中5个位于内含子区并且不涉及剪切位点;另外2个位于外显子:01号患者的第5号外显子有一突变c.212 C〉T,07号患者的第25号外显子有一同义突变c.1674G〉A。结论 WS患者心血管畸形表型差异性的原因及单纯型SVAS患者发病的遗传学基础,是一个复杂而又亟需解决的难题,尚需更广泛的基因筛查。 展开更多
关键词 威廉姆斯综合征 主动脉瓣上狭窄 弹力蛋白基因 基因突变筛查
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PKHD1基因突变筛查可用于诊断常染色体隐性遗传多囊性肾病
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作者 樊晶 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2009年第2期49-50,共2页
关键词 常染色体隐性遗传 多囊性 肾病学 基因突变筛查 患者 诊断 家庭 被调查者 变性高效液相色谱法 错义突变
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高分辨率熔解曲线分析:一种新的用于遗传病基因突变筛查的技术 被引量:6
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作者 李东至 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2011年第2期1-3,共3页
目前,DNA碱基变异如突变或单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的检测方法有2种:一是针对特定的位点合成序列特异性探针,如Taqman探针法、位点特异寡核苷酸分析、反向斑点杂交及基因芯片等。
关键词 遗传病 高分辨率 基因突变筛查 基因分型 曲线分析 熔解曲线 荧光染料 单核苷酸多态性 探针法 变性梯度凝胶电泳
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6060例新生儿遗传性耳聋基因筛查结果分析 被引量:7
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作者 王雪超 李雨雨 +2 位作者 崔玉晗 郭志华 王盛 《山东医药》 CAS 2020年第20期76-79,共4页
目的通过遗传性耳聋基因筛查了解临淄地区新生儿常见的遗传性耳聋基因突变类型、突变率。方法采集6060例出生3~7 d充分哺乳的新生儿足底血血斑,提取基因组DNA,使用高通量测序技术检测18个耳聋基因的100个位点。结果共发现404例耳聋基因... 目的通过遗传性耳聋基因筛查了解临淄地区新生儿常见的遗传性耳聋基因突变类型、突变率。方法采集6060例出生3~7 d充分哺乳的新生儿足底血血斑,提取基因组DNA,使用高通量测序技术检测18个耳聋基因的100个位点。结果共发现404例耳聋基因突变,突变携带率为6.67%。单基因杂合突变391例,其中GJB2突变携带者157例,携带率为2.59%;SLC26A4突变携带者169例,携带率为2.79%;GJB3突变携带者18例,携带率为0.30%;线粒体耳聋相关基因突变携带者46例,携带率为0.76%;MYO7A突变携带者1例,携带率为0.02%。两个及以上位点突变者13例,携带率为0.21%,其中,GJB2基因c.299-300delAT纯合突变1例,GJB2基因c.235delC/c.299-300delAT复合杂合突变1例、双杂合突变10例,以及罕见的GJB2/SLC26A4 c.235delC/c.299-300delAT/c.2168A>G三个位点突变1例;GJB2基因c.299-300delAT纯合突变、GJB2基因c.235delC/c.299-300delAT复合杂合突变、c.235delC/c.299-300delAT/c.2168A>G三个位点突变均来自新生儿父母双方。6060例新生儿中,56例未通过听力筛查;生后6个月确诊听力异常12例,携带耳聋基因8例,其中GJB3基因突变3例、GJB2基因突变4例、SLC26A4基因突变1例。结论临淄地区6060例新生儿耳聋基因突变携带率为6.67%,以4个常见耳聋基因(GJB2、SLC26A4、GJB3、线粒体基因)单基因杂合突变为主,两个及以上基因位点突变较少。随访证实听力异常患儿耳聋基因携带者占66.67%;对于耳聋基因突变携带者建议健康用耳、预防为主。 展开更多
关键词 新生儿 耳聋基因 基因突变筛查 高通量测序 淄博市临淄区
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遗传性β地中海贫血病CD17点突变的快速简便检测
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作者 孟祥贤 栾瑞波 +2 位作者 王柯敏 羊小海 郭秋平 《生命科学研究》 CAS CSCD 2007年第4期295-300,共6页
利用聚合酶延伸技术及双链特异性嵌入染料的特性,建立了一种快速简便的基因点突变的检测方法.在特定引物聚合过程中,不同基因型的聚合反应进程被实时转换为荧光信号,通过监测荧光信号的变化实现基因点突变的快速检测,不需要复杂的凝胶... 利用聚合酶延伸技术及双链特异性嵌入染料的特性,建立了一种快速简便的基因点突变的检测方法.在特定引物聚合过程中,不同基因型的聚合反应进程被实时转换为荧光信号,通过监测荧光信号的变化实现基因点突变的快速检测,不需要复杂的凝胶电泳、荧光和同位素标记等操作.通过对β珠蛋白基因CD17点突变的检测,证实该方法是一种廉价、简便、快速的筛查遗传性地中海贫血病β珠蛋白基因CD17点突变的方法,该方法可扩展到各种基因的点突变检测. 展开更多
关键词 突变 聚合酶 遗传性地中海贫血病 基因突变筛查
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环介导等温扩增技术及其在基因突变筛查中的应用研究 被引量:1
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作者 王雯雯 张小雨 +2 位作者 马臣杰 邓光存 吴晓玲 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第4期492-496,F0003,共6页
基因突变筛查是疾病临床诊断和确定治疗方案的有效方法之一。环介导等温扩增(LAMP)是一种新颖的恒温核酸扩增技术,由于其在灵敏度,特异性和快速性等方面具有显著优势,现已被广泛应用于各种研究领域,如食品检测和疾病诊断等。但是,LAMP... 基因突变筛查是疾病临床诊断和确定治疗方案的有效方法之一。环介导等温扩增(LAMP)是一种新颖的恒温核酸扩增技术,由于其在灵敏度,特异性和快速性等方面具有显著优势,现已被广泛应用于各种研究领域,如食品检测和疾病诊断等。但是,LAMP技术在基因突变筛查中的应用研究报道相对较少。因此,本文就LAMP技术及以LAMP为基础衍生的新方法在基因突变筛查的应用进行重点阐述,旨在为以此技术平台为基础的推广及应用提供新的思路。 展开更多
关键词 环介导等温扩增(LAMP) 基因突变筛查 应用 综述
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孕前常见耳聋基因突变筛查对于预防和干预先天性耳聋的价值 被引量:7
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作者 孙雪晶 邢新丽 +5 位作者 何清清 周林 张静 赵青 侯慧丽 席作明 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期722-725,共4页
目的探讨孕前耳聋基因突变筛查对于预防和干预先天性耳聋的价值。方法应用实时荧光定量PCR技术,对2168对行孕前检查且听力正常的夫妇共4336人进行GJB2(c.235delC、c.299—300delAT)、线粒体DNA12SrRNA(c.1494C〉T、C.1555A〉G)... 目的探讨孕前耳聋基因突变筛查对于预防和干预先天性耳聋的价值。方法应用实时荧光定量PCR技术,对2168对行孕前检查且听力正常的夫妇共4336人进行GJB2(c.235delC、c.299—300delAT)、线粒体DNA12SrRNA(c.1494C〉T、C.1555A〉G)和SLC26A4(C.2168A〉G、c.IVS7~2A〉G)基因的6个致聋突变进行筛查,对双方均携带杂合突变的6对夫妻进行孕中期产前诊断。结果在4336人中,共检测出176例突变携带者,总携带率为4.06%,其中GJB2基因C.235del C位点突变率为0.91%、C.299—300delAT位点突变率为0.20%;SLC26A4基因c.IVS7—2A〉G位点突变率为0.68%、C.2168A〉G位点突变率为0.11%;线粒~4I;DNA12SrRNA基因c.1555A〉G位点突变率为0.1%、C.1494C〉T位点突变率为0.01%。6对双方携带同一基因杂合突变夫妇的产前诊断结果提示6例胎儿染色体核型均正常,测序结果显示2例胎儿携带GJB2基因C.235delC纯合突变,1例携带GJB2基因C.235delC杂合突变,1例携带GJB2基因C.299—300delAT杂合突变,2例携带SLC26A4基因12.IVs7—2A〉G杂合突变。结论孕前耳聋基因突变筛查能够对先天性耳聋进行产前诊断和早期预防,有效降低遗传性耳聋的发病率。 展开更多
关键词 耳聋基因突变筛查 耳聋预防 出生缺陷干预
原文传递
霍夫变换在PCR-反向点杂交检测结果自动化判读中的应用
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作者 王刚 李岭 《生物医学工程研究》 北大核心 2015年第3期158-163,173,共7页
探讨霍夫变换(Hough transform)在聚合酶链反应-反向点杂交(polymerase chain reaction-reverse dot blotting,PCR-RDB)检测基因突变结果的自动化判读中的应用。以凯普HMM-2I医用核酸分子快速杂交仪检测基因突变为例,建立一种通过霍夫... 探讨霍夫变换(Hough transform)在聚合酶链反应-反向点杂交(polymerase chain reaction-reverse dot blotting,PCR-RDB)检测基因突变结果的自动化判读中的应用。以凯普HMM-2I医用核酸分子快速杂交仪检测基因突变为例,建立一种通过霍夫变换进行图像识别的方法,以快速判读PCR-RDB的检测结果,并提出一套基于移动终端的检测结果后处理方案。利用开发的软件,对113份地中海贫血常见突变以及86份人乳头瘤病毒分型的PCR-RDB检测结果进行了自动读取,并同人工判读结果进行了比较,二者的符合率均达100%。将霍夫变换应用于PCR-RDB检测图像的自动化判读符合实际需求,无需人工干预,可以降低肉眼判读的错误率并提高工作效率。 展开更多
关键词 聚合酶链反应-反向点杂交 霍夫变换 二值化图像 中值滤波 基因突变筛查 无线移动终端
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Screening for tetrahydrobiopterin deficiency among hyperphenylalaninemia patients in Southern China 被引量:4
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作者 叶军 刘哓青 +4 位作者 马燮琴 张雅芬 黄哓东 陈瑞冠 顾学范 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2002年第2期57-61,151-152,共7页
Abstract Objectives To assess the incidence of tetrahydrobiopterin (BH4)deficiency among patients with hyperphenylalaninemia (HPA) in southern Chinese and evaluate clinical outcome and gene mutations in tetrahydrobi... Abstract Objectives To assess the incidence of tetrahydrobiopterin (BH4)deficiency among patients with hyperphenylalaninemia (HPA) in southern Chinese and evaluate clinical outcome and gene mutations in tetrahydrobiopterin deficient patients.Methods Urinary neopterin (N) and biopterin (B) was analyzed in 87 patients with hyperphenylalaninemia by high-performance liquid chromatography. Further combined loading tests with phenylalanine(Phe) (100*!mg/kg) and tetrahydrobiopterin (BH4) (7.5*!mg/kg) were performed in suspected patients with abnormal urinary pterin profiles. Gene mutation analysis was performed for patients with BH4 deficiency and their parents. BH4 deficient patients were treated with BH4 and neurotransmitter precursors after diagnosis. Blood phenylalanine levels, clinical symptoms and mental development were followed up.Results Eleven patients were diagnosed as having BH4 deficiency caused by 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase (PTPS) deficiency. The incidence of tetrahydrobiopterin (BH4) deficiency among patients with hyperphenylalaninemia (HPA) in southern Chinese was 10%. Combined loading tests with phenylalanine and oral BH4 were done in 4 of 11 patients and their phenylalanine levels were decreased to normal 4-6h after BH4 administration. Four different mutations (P87S, N52S, D96N and G144R) in the PTPS gene were detected in 5 families. Five PTPS-deficient patients were treated with synthetic BH4, neurotransmitter precursors (L-dopa plus carbidopa, and 5-hydroxytryptophan). They had satisfactory physical and mental development after treatment. One patient with partial PTPS deficiency had normal growth and mental development without treatment. Conclusions Our results emphasize that screening for BH4 deficiency should be carried out in all patients with hyperphenylalaninemia in order to minimize the misdiagnosis. Patients with BH4 deficiency should be treated early with BH4 and a combination of neurotransmitter precursors. 展开更多
关键词 phenylketonuria · gene mutation · neonatal screening · tetrahydrobiopterin deficiency
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