基于甲流病毒突变度的疫情早期预警模型

通过比较每年与其上一年报道的甲流病毒HA蛋白质序列之间的差异,构建了突变度的算法。对所选的1916~2014年HA蛋白质序列利用此算法计算出每年的突变度,观察到这4次大型流感爆发年份的突变度值都比相邻的年份要高,并且突变度值越大,流感的范围和影响就越大。结果表明这种方法建立的比较合理,效果不错。这对流感爆发的研究、预警和防御有着重要的意义。

LNSST域灰度突变度的红外与可见光图像融合

对红外与可见光图像融合过程中出现的融合时间较长、细节信息提取不足的缺点,提出一种局部化非降采样剪切波变换(Local Non-subsampled Shearlet Transform,LNSST)的红外与可见光图像融合提升算法。对红外图像和可见光图像采用LNSST域算法进行多层次、多方向的分解,得到低频子带系数和各带通方向子带系数。低频部分使用基于灰度突变度的权值平均的融合规则;高频部分采用区域纹理平滑度和拉普拉斯能量和相结合的融合方法,然后对低频融合系数和高频融合系数进行LNSST逆变换得到融合后的图像。用不同的算法进行验证结果显示本文提出的融合算法生成的融合图像细节更多、更清晰,执行时间相对较短。

EGFR T790M突变丰度对阿美替尼治疗晚期非小细胞肺癌疗效的影响

目的分析阿美替尼治疗晚期非小细胞肺癌疗效,并探索EGFR T790M突变丰度与阿美替尼疗效之间的关系。方法回顾性分析52例接受阿美替尼治疗的经一/二代EGFR-TKIs耐药的Ⅲ期或Ⅳ期EGFR T790M突变的非小细胞肺癌患者,采用Kaplan-Meier法及Cox模型进行预后分析,并通过ROC曲线分析确定疗效相关的T790M突变丰度临界值。结果入组肺癌患者接受阿美替尼治疗的ORR为48.1%,DCR为94.2%。外周血T790M丰度中位值为1.94%。阿美替尼治疗患者的丰度最佳临界值为2.05%,将突变丰度≥2.05%的患者纳入高丰度组(25例),<2.05%的患者纳入低丰度组(27例),高丰度值和低丰度值的ORR分别为84.0%和14.8%,PFS分别为12.8个月和7.2个月,OS分别为22.2个月和18.3个月。Cox回归分析显示,基因类型、性别、吸烟史、是否脑转移均不是阿美替尼治疗患者PFS的影响因素,外周血EGFR T790M突变丰度是PFS的独立影响因素。结论EGFR T790M突变丰度可能可预测阿美替尼治疗的晚期EGFR T790M突变NSCLC患者的有效率和生存期。

弥漫大B细胞淋巴瘤^(18)F-FDG PET/CT代谢参数和循环肿瘤DNA突变丰度:相关性和生存分析

目的:探讨弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者18-氟-脱氧葡萄糖正电子发射断层显像/计算机断层扫描代谢参数与外周血循环肿瘤DNA(ctDNA)的相关性,以及这两类参数在预测无进展生存期(PFS)中的预后价值。方法:回顾性分析同期行外周血ctDNA检测及相应PET/CT扫描的DLBCL患者的临床、PET/CT及ctDNA资料。ctDNA取样及PET扫描时,根据疾病不同治疗及病情发展情况,将患者分为基线组和复发/难治性(R/R)组。ctDNA突变丰度以变异等位基因频率(VAF)表示,包括最大VAF(maxVAF)和平均VAF(meanVAF)。以41%最大标准化摄取值方法获得总代谢肿瘤体积(TMTV)和糖酵解总量(TLG),并获得两最远病灶距离(Dmax),采用Spearman相关分析评估PET参数与ctDNA突变丰度的相关性。在基线及R/R组中分别采用受试者工作特征(ROC)曲线获得这些参数和预测PFS的最佳截断值。采用Kaplan-Meier法勾画生存曲线并行log-rank检验比较生存差异。结果:共纳入67例DLBCL患者,男性33例,女性34例,中位年龄为56.0(46.0,67.0)岁,基线组29例,R/R组38例。PET参数中,除最大标准化摄取值(SUVmax)外,基线TMTV、TLG、Dmax均与基线ctDNA突变丰度显著相关(maxVAFvsTMTV:r=0.711;maxVAFvsTLG:r=0.709;maxVAFvsDmax:r=0.672;meanVAFvsTMTV:r=0.682;meanVAFvsTLG:r=0.677;meanVAFvsDmax:r=0.646),而在全部患者中,以上相关性明显减弱。在R/R患者中,仅TMTV与meanVAF具有较弱的相关性(r=0.376)。对各参数进行ROC分析结果表明,TMTV、TLG和Dmax预测PFS的特异性优于突变丰度,而ctDNA突变丰度的敏感性更好。除R/R患者外,在基线患者和全体患者中可观察到在不同乳酸脱氢酶水平下,TMTV、TLG、Dmax、VAF均具有显著差异(均P<0.05)。生存曲线表明,基线患者中,高TMTV(> 109.5 cm3)、高TLG(> 2 141.3)、高Dmax(> 33.1 cm)及高VAF(maxVAF> 7.74%、meanVAF> 4.39%)均是不良PFS的危险因素,而在R/R患者中仅高VAF(maxVAF和meanVAF均> 0.61%)是影响PFS的危险因素。结论:PET衍生参数与ctDNA突变丰度相关性良好,尤其是在基线患者中。ctDNA的VAF预测PFS较PET代谢参数更敏感,而PET代谢肿瘤负荷具有更好的特异性。TMTV、TLG和VAF均对PFS有良好的预后价值。PET/CT联合ctDNA在预后评估和个性化治疗方面有进一步研究的潜力。

细针穿刺检测BRAF^(V600E)突变丰度与甲状腺乳头状癌临床病理特征的相关性

目的:探讨术前细针穿刺基因检测BRAF^(V600E)突变丰度与甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)临床病理特征的关系。方法:回顾性统计2021年1月30日至2022年2月28日就诊于南京中医药大学附属中西医结合医院的301例患者临床资料,术前细针穿刺基因检测示BRAF^(V600E)突变(含突变丰度检测),所有患者完成甲状腺癌根治术,术后病理证实为甲状腺乳头状癌,分析BRAF^(V600E)基因突变丰度与临床病理特征的关系。结果:纳入301例患者,男91例,女210例,年龄42(33~51)岁,范围18~69岁。肿瘤直径>1 cm的患者BRAF^(V600E)基因突变丰度高于肿瘤直径≤1 cm者[29.05(18.03~37.56)vs.18.35(6.74~29.61),P<0.001],颈部淋巴结转移患者BRAF^(V600E)基因突变丰度高于无颈部淋巴结转移者[24.72(8.08~34.32)vs.18(8.68~28.54),P=0.040]。男女分开统计,女性颈部淋巴结转移患者BRAF^(V600E)基因突变丰度高于无颈部淋巴结转移者[25.75(9.62~34.30)vs.17.47(7.27~26.86),P=0.007],男性患者BRAF^(V600E)基因突变丰度与颈部淋巴结转移无明显相关性(P=0.654)。通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析BRAF^(V600E)突变丰度诊断女性PTC患者颈部淋巴结转移的效能,曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.609(95%CI=0.532~0.686),取截断值25.68%。多因素分析显示,年龄<55岁(OR=0.138~0.735,P=0.007)、BRAF^(V600E)突变丰度≥25.68%(OR=1.271~4.65,P=0.007)、多灶(OR=1.282~4.623,P=0.007)、肿瘤直径>1 cm(OR=2.257~11.927,P<0.001)与女性PTC患者颈部淋巴结转移有明显相关性(P<0.05)。结论:BRAF^(V600E)突变丰度与PTC患者肿瘤直径、颈部淋巴结转移明显相关。BRAF^(V600E)突变丰度≥25.68%的女性PTC患者颈部淋巴结转移率明显升高。

基于突变检测的中外图情领域健康信息研究热点对比分析

文章分析中外图情领域健康信息研究现状,利用突变检测法对比相关研究中的高突变权重关键词及突变文献,从持续型热点主题、激增型热点主题、创新型热点主题三方面发掘中外图情领域健康信息研究的异同,并预测中外图情领域健康信息研究前沿趋势,即制定及实施健康信息战略规划、强化图情机构健康信息服务的社会责任、构建健康信息应急体系、应用智能技术处理健康信息数据、监管及治理虚假健康信息等,以期为我国图情领域服务创新和健康中国战略的可持续发展提供参考。

温湿度突变对人体热反应的影响

在中性-热和中性-冷工况下,对30名湿热地区受试者开展了温湿度突变对人体热反应影响的实验研究,从生理、心理反应的变化及其相互关系等方面分析了实验现象。研究发现心理超前和热感超越现象,发现突变条件下的热感觉与皮肤温度呈二次多项式关系,与皮肤温度变化率呈线性关系,得到了突变环境下人体热反应的预测模型。

钢桁架结构损伤检测的柔度曲率幅值突变系数法

为了对钢桁架结构的损伤情况进行比较准确的检测,应用了柔度曲率幅值突变系数法.首先应用ANSYS对钢桁架结构的单个或多个损伤同时出现的情况进行了数值模拟,然后用一个钢桁架模型对ANSYS的计算结构进行实验验证.数值模拟的结果表明:用柔度曲率幅值突变系数法可以对钢桁架结构单个或多个结构同时出现的情况进行比较准确的判定.实验结果与数值模拟结果基本吻合.

肺癌中EGFR外显子突变丰度的荧光偏振检测

目的:建立一种基于荧光偏振技术快速、特异的检测体系,并将该体系用于检测肺癌标本中EGFR基因19、21外显子的突变丰度,以便更加全面、准确地预测靶向药物疗效以及指导临床靶向药物选择。方法:应用Primer premier 5.0软件在EGFR基因19、21号外显子突变区域上下游处设计19、21外显子各自的通用PCR引物,并设计覆盖各自突变区域的两对荧光标记探针(突变型和野生型)。以包含野生型(19、21)和突变型(19、21)的质粒分别为4种阳性标准品,空载体为阴性标准品,分别作为模板进行PCR扩增反应,将扩增结果应用荧光偏振仪进行检测,以建立突变丰度测量体系。最后,对51例肺腺癌标本进行检测,并计算出各自的突变丰度。结果:荧光偏振检测EGFR基因19、21外显子突变结果与直接测序法结果无统计学差异,且最低检测浓度为40拷贝/μl,最低检测含量可达10%。本法可提供更全面的瘤内基因变异丰度分析,有利于指导临床用药。结论:荧光偏振检测EGFR基因19、21外显子突变结果不仅灵敏度与特异性高,还能提供全面的瘤内异质性分析指标,可为临床肺癌个体化治疗效果提供预测依据。

表皮生长因子受体19、21外显子突变丰度与NSCLC患者临床特征及吉非替尼疗效的关系

靶向治疗是目前非小细胞肺癌(non small cell lung cancer,NSCLC)的重要治疗方法,其中吉非替尼是临床应用最广的NSCLC靶向治疗药物[1]。吉非替尼是表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂(epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI),能够竞争性地与表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶结合,通过抑制其活性而阻断EGFR下游信号传导通路,发挥抑制肿瘤恶性增殖、转移等作用。多项临床研究已证实,EGFR基因突变状态是EGFR-TKI疗效的重要预测指标。

弹性细杆弯扭度有突变时的Lagrange方程

根据弹性细杆静力学的Kirchhoff动力学比拟方法,将弹性细杆截面的弯扭度和形心应变矢有突变的弹性变形比拟为动力学中的打击运动现象.分别从精确Cosserat弹性细杆和Kirchhoff弹性细杆静力学的Lagrange方程出发,导出了弯扭度和形心应变矢有突变时的Lagrange方程,其形式与打击运动的Lagrange方程形式相同.分析了弯扭度和形心应变矢的突变对挠曲线光滑性的影响.为弹性细杆弯扭度有突变时的平衡分析提供分析力学方法.

非小细胞肺癌血浆EGFR基因突变丰度对吉非替尼治疗效果的影响

目的 分析非小细胞肺癌表皮生长因子受体(EGFR)基因突变情况,并探讨血浆EGFR基因突变状态对吉非替尼治疗效果及预后的影响。方法 选取2017年1月—2019年6月收治的非小细胞肺癌135例,收集患者治疗前肿瘤组织及血浆标本,检测血浆及肿瘤组织EGFR基因状态。根据EGFR基因是否突变以及突变丰度将40例EGFR敏感型非小细胞肺癌患者分为EGFR基因突变低丰度组22例和EGFR基因突变高丰度组18例,分析EGFR基因突变丰度与EGFR敏感型非小细胞肺癌患者经吉非替尼治疗效果的相关性,采用Kaplan-Meier生存曲线分析EGFR基因突变丰度对EGFR敏感型非小细胞肺癌患者预后的影响。通过Cox回归分析判断EGFR敏感型非小细胞肺癌患者吉非替尼治疗预后影响因素。结果 135例肿瘤组织EGFR基因突变率为34.8%,血浆EGFR基因突变率为29.6%,二者检测结果高度一致(P<0.01)。EGFR基因突变高丰度组疗效优于低丰度组(P<0.01);EGFR基因突变高丰度组总生存时间长于低丰度组(P<0.05)。EGFR基因突变高丰度是EGFR敏感型非小细胞肺癌患者吉非替尼治疗预后不良的保护因素(P<0.01)。结论 血浆EGFR基因突变丰度与EGFR敏感型非小细胞肺癌吉非替尼临床疗效及预后密切相关,可作为预测EGFR敏感型非小细胞肺癌吉非替尼治疗获益的有效手段。

突变量表的数学定义及应用

突变现象普遍存在。为了描述突变现象,提出了包括突变点和突变特征函数等概念的突变量表的数学定义。通过以不同水平的偏序集(Aa,≤)、(Ab,≤)和(Ac,≤)表达广西各市石漠化程度的差异,阐述其应用。突变量表的提出,使传统的包括定名量表,顺序量表和其他两种量表的系统得到了理论上的发展和完善。

基于改进突变级数法的矿山地质灾害危险性评价——以潞安矿区为例

为避免矿山地质灾害危险性的传统评价方法对于评价指标权重的计算以及主观赋权所存在的不足,以潞安矿区为例,提出了一种基于熵值法的改进突变级数法并用于对矿山地质灾害危险性进行评价。在系统分析该矿区主要地质灾害类型及特征的基础上,以该矿区5个典型生产矿井为例,首先根据矿山地质灾害类型及特点,构建了矿山地质灾害危险性评价指标体系,其次利用熵值法确定同层评价指标的相对重要程度,然后利用突变级数法中的归一化公式计算出不同矿井的总突变隶属度值,最后运用转化后的等级标准对该矿区地质灾害危险性进行评价。结果表明:该方法不仅避免了人为确定权重的主观性,而且能够定量区分出同一层次指标的重要程度;该方法的评价结果与实地野外调查结果基本一致,可为矿山地质灾害危险性评价和有效防治提供科学依据。

基于突变理论与BP神经网络的建筑施工安全综合评价

为了减少建筑施工中人员伤亡问题,提出一种综合评价模型。在构建建筑施工安全评价指标体系的基础上,从事故突发性角度入手,引入突变理论进行安全评价,在得到底层指标评分后,将其标准化处理为原始数据,由突变理论中的低维突变模型推导出高维突变模型,应用于评价过程,将原始数据经过层次化突变模型得到系统总突变隶属度后,考虑到底层指标评分具有安全意义,得到底层指标与系统总突变隶属度对应关系,并由对应关系得到综合评价值。为了便于对若干施工地进行安全评价,将BP神经网络与突变理论相结合,将原始数据和综合评价值输入BP神经网络训练,得到综合评价模型。将此综合模型应用到实例,得出的评价结果与实例实际安全情况一致,认为此综合评价模型可适用于建筑施工安全评价。

一种模拟游离DNA阳性质控品的制备方法及表征

通过优化一种新型的机理未明确的类酶解作用体系(reaction system, RS),直接作用带有KRAS G12C,KRAS G12D,EGFR L858R和EGFR T790M突变的肿瘤细胞系SW1573,SNU-C2B和NCI-H1975,通过对RS体系作用时间及作用的细胞数量的优化,可以裂解细胞基因组DNA制备得到一种可以高度模拟人体血浆游离DNA(cfDNA)阳性质控品。经芯片电泳检测获得的模拟cfDNA片段长度集中于(166±16) BP,与正常人体血浆cfDNA大小一致;通过微滴数字PCR检测显示RS制备的DNA片段和gDNA在目标突变位点处具有一致的突变丰度。表明经RS体系制备得到的DNA片段可以作为一种cfDNA的阳性质控品。

基于优化组合隶属函数的火箭炮作战效能评估

针对单一隶属度函数会发生隶属度突变问题,提出基于优化组合隶属函数的方法。利用各种隶属函数的评价信息,对多种单一隶属函数的评价信息进行优化组合;以某型火箭炮的作战效能评估需求作为研究背景,建立效能底层指标体系,并运用优化组合隶属函数方法进行定性分析和定量计算,实现对火箭炮作战效能的模糊综合评判。结果表明:该方法能够提高评价结果的准确性,对部队开展实战化训练具有重要参考价值。

动态WNMF及在图像融合中的应用研究

标准非负矩阵分解图像融合算法全局特征提取能力有限,造成融合图像的对比度不高,视觉效果不好,针对这一问题,对加权非负矩阵分解算法进行了深入研究,提出了动态加权非负矩阵分解思想并将之应用于红外与可见光图像融合。动态加权非负矩阵分解算法首先通过加权系数的设计指定重要特征,并在迭代过程中根据各区域相对重要程度的变化对加权系数进行动态调整,与标准非负矩阵分解算法相比较,动态加权非负矩阵分解算法全局特征提取能力得到了显著提升。对比实验表明,相对于目前常见标准非负矩阵分解图像融合算法,采用区域突变度作为目标函数的动态加权非负矩阵分解算法平均梯度提高了36%以上,标准差提高了17%以上。

基于概率幅编码的混合量子演化算法

个体基于量子概率幅进行编码,并将经典遗传算法的杂交算子用于量子演化算法中演化目标的优化,提出了混合量子演化算法。算法中对量子旋转角自适应更新,并首次引入了突变度的概念定义了自适应的变异算子,对量子个体的演化目标定期实施杂交,有效地交换并利用了演化信息,避免了未成熟收敛,提高了算法效率。数值优化问题的实验结果表明该算法优于QEA和CGA,并能以极大概率成功地解决“大海捞针”问题,且计算效率高,优化速度与CGA相当。

基于人居环境视角的城市居住用地集约利用效率研究--以大连市中山区为例

从人居环境系统视角出发,以2015年大连中山区年鉴和Land Sat8卫星图像解译的居住用地数据为基础,通过ArcGIS 10.2技术和突变模糊隶属度,实证探索了大连市中山区城市居住用地集约利用效率。研究结果表明:中山区居住用地集约利用水平整体较高但各区域内空间差异显著;研究区域内的居住用地集约利用效率分为三个等级,高度集约利用、中度集约利用、低度集约利用分别占居住用地总面积的29.54%,30.54%,39.92%;中山区居住用地集约利用分布格局,形成以中部为中心向四周逐步递减的集约利用分布格局。最后,以期为大连市城市相关规划与编制提供依据。