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变性高压液相色谱技术在检测结核分枝杆菌对链霉素耐药性中的应用
1
作者
孙照刚
张健源
+6 位作者
张旭霞
李妍
邱云青
田苗
聂理会
任卫聪
李传友
《结核病与胸部肿瘤》
2007年第3期165-170,共6页
目的利用变性高压液相色谱(DHPLC)技术快速检测结核分枝杆菌rpsL基因的突变,从而对结核分枝杆菌是否耐受链霉素类药物做出初步判断。方法体外药物敏感性试验,确定122株结核分枝杆菌临床分离株对链霉素的敏感程度。提取试验菌株基因...
目的利用变性高压液相色谱(DHPLC)技术快速检测结核分枝杆菌rpsL基因的突变,从而对结核分枝杆菌是否耐受链霉素类药物做出初步判断。方法体外药物敏感性试验,确定122株结核分枝杆菌临床分离株对链霉素的敏感程度。提取试验菌株基因组DNA。扩增rpsL基因片段;分别与H37Rv标准株的相应PCR产物混合、杂交后,利用WAVE核苷酸片段分析系统对各杂交产物进行DHPLC检测;序列测定结果与相应的DHPLC检测结果进行比较以验证DHPLC检测的准确性。通过比较药物敏感性和DHPLC检测结果。建立两者之间的对应关系。此外我们还检测了32株对链酶素敏感的临床分离株进行了DHPLC法检测。以明确该检测方法的特异性。结果结核分枝杆菌临床分离株对链霉素耐药性经体外实验证明,rpsL基因43位氨基酸突变通常会引起较高程度的链霉素耐药性。88位氨基酸突变菌株对链霉素的耐药性较低。链霉素耐药菌中发生rpsL基因突变的菌株约占78.69%(96/122)。其中以43位氨基酸突变为主(75.41%)。利用DHPLC技术检测rpsL基因突变,虽然不能检出缺失突变形式,但与直接测序法相比检出率为98.95%(95/96)。对所有耐受链霉素的结核分枝杆菌临床分离株而言。利用DHPLC技术可以达到77.87%(95/122)的耐药菌检出率,与序列测定法的检出率相近(96/122)。并且根据DHPLC检测图谱能够很好地判断rpsL基因的碱基突变形式。32株链酶素株的DHPLC检测图谱都与H37Rv标准株相同。结论DHPLC法是快速检测出结核分枝杆菌rpsL基因碱基突变的好方法.具有很高的特异性和敏感性。对链霉素耐药菌而言,碱基突变与结核分枝杆菌耐受链霉素类抗生素存在高度的相关关系,因此DHPLC技术用于临床早期检测结核病人对链霉素的耐药性具有良好的应用前景。
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关键词
分枝杆菌
结核rpsL基因
突变链霉素耐药性
变性高压液相色谱DHPLC
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职称材料
题名
变性高压液相色谱技术在检测结核分枝杆菌对链霉素耐药性中的应用
1
作者
孙照刚
张健源
张旭霞
李妍
邱云青
田苗
聂理会
任卫聪
李传友
机构
北京市结核病胸部肿瘤研究所细菌免疫研究室
出处
《结核病与胸部肿瘤》
2007年第3期165-170,共6页
基金
该项目获北京市科委2006年度国际合作项目和北京市优秀人才项目(20061D0301300096)资助
文摘
目的利用变性高压液相色谱(DHPLC)技术快速检测结核分枝杆菌rpsL基因的突变,从而对结核分枝杆菌是否耐受链霉素类药物做出初步判断。方法体外药物敏感性试验,确定122株结核分枝杆菌临床分离株对链霉素的敏感程度。提取试验菌株基因组DNA。扩增rpsL基因片段;分别与H37Rv标准株的相应PCR产物混合、杂交后,利用WAVE核苷酸片段分析系统对各杂交产物进行DHPLC检测;序列测定结果与相应的DHPLC检测结果进行比较以验证DHPLC检测的准确性。通过比较药物敏感性和DHPLC检测结果。建立两者之间的对应关系。此外我们还检测了32株对链酶素敏感的临床分离株进行了DHPLC法检测。以明确该检测方法的特异性。结果结核分枝杆菌临床分离株对链霉素耐药性经体外实验证明,rpsL基因43位氨基酸突变通常会引起较高程度的链霉素耐药性。88位氨基酸突变菌株对链霉素的耐药性较低。链霉素耐药菌中发生rpsL基因突变的菌株约占78.69%(96/122)。其中以43位氨基酸突变为主(75.41%)。利用DHPLC技术检测rpsL基因突变,虽然不能检出缺失突变形式,但与直接测序法相比检出率为98.95%(95/96)。对所有耐受链霉素的结核分枝杆菌临床分离株而言。利用DHPLC技术可以达到77.87%(95/122)的耐药菌检出率,与序列测定法的检出率相近(96/122)。并且根据DHPLC检测图谱能够很好地判断rpsL基因的碱基突变形式。32株链酶素株的DHPLC检测图谱都与H37Rv标准株相同。结论DHPLC法是快速检测出结核分枝杆菌rpsL基因碱基突变的好方法.具有很高的特异性和敏感性。对链霉素耐药菌而言,碱基突变与结核分枝杆菌耐受链霉素类抗生素存在高度的相关关系,因此DHPLC技术用于临床早期检测结核病人对链霉素的耐药性具有良好的应用前景。
关键词
分枝杆菌
结核rpsL基因
突变链霉素耐药性
变性高压液相色谱DHPLC
Keywords
Mycobacterium tuberculosis rpsL gene Mutation Streptomycin-resistance DHPLC
分类号
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
变性高压液相色谱技术在检测结核分枝杆菌对链霉素耐药性中的应用
孙照刚
张健源
张旭霞
李妍
邱云青
田苗
聂理会
任卫聪
李传友
《结核病与胸部肿瘤》
2007
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