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基于残基位置特异性改进二级结构预测精度
1
作者
段谟杰
朱伟
黄慧艳
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期129-132,共4页
利用二级结构端点附近残基的特异性分布特征,应用支持向量机(SVM)预测二级结构端点并得出蛋白质上各位置为端点的可能性分值.根据预测出的端点可能性分值对目前的二级结构预测工具进行端点校正.对psiSVM和PSIPRED这两种工具进行了校正...
利用二级结构端点附近残基的特异性分布特征,应用支持向量机(SVM)预测二级结构端点并得出蛋白质上各位置为端点的可能性分值.根据预测出的端点可能性分值对目前的二级结构预测工具进行端点校正.对psiSVM和PSIPRED这两种工具进行了校正和测试,结果表明校正后端点预测精度相对于psiSVM提高约10%,相对于PSIPRED提高近5%,同时整体预测精度也有一定程度的提高.
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关键词
蛋白质
二级结构预测
预测精度
残基位置特异性
端点结果校正
原文传递
题名
基于残基位置特异性改进二级结构预测精度
1
作者
段谟杰
朱伟
黄慧艳
机构
华中科技大学生命科学与技术学院
出处
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期129-132,共4页
基金
国家自然科学基金重大研究计划资助项目(90608020)
文摘
利用二级结构端点附近残基的特异性分布特征,应用支持向量机(SVM)预测二级结构端点并得出蛋白质上各位置为端点的可能性分值.根据预测出的端点可能性分值对目前的二级结构预测工具进行端点校正.对psiSVM和PSIPRED这两种工具进行了校正和测试,结果表明校正后端点预测精度相对于psiSVM提高约10%,相对于PSIPRED提高近5%,同时整体预测精度也有一定程度的提高.
关键词
蛋白质
二级结构预测
预测精度
残基位置特异性
端点结果校正
Keywords
protein secondary structure prediction prediction accuracy residue position-specific performance prediction result modification
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于残基位置特异性改进二级结构预测精度
段谟杰
朱伟
黄慧艳
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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