水稻矮缩病毒基因组第五号片段编码区的cDNA克隆及序列分析

水稻矮病毒(RDV)基因组第五号片段S5编码病毒的外层外壳蛋白(outer layer coatprotein)。从RDV中国福建分离物中分离出S5的双链RNA,反转录成cDNA,再利用PCR扩增了编码区cDNA,将扩增产物克隆到载体pBluescript上。经限制性内切酶分析,进而进行亚克隆和序列测定。结果表明,克隆片段全长2449bp,包含一个编码801个氨基酸的完整开放阅读框架。与RDV日本分离物S5相比,核苷酸和由此推出的氨基酸的同源率分别为94.5％和97.5％。与同组伤瘤病毒(WTV)相比,核苷酸和氨基酸的同源性分别高达58.1％和51.1％,S5是RDV与WTV基因组中同源性最高的片段。