沐川乌骨黑鸡LIPE基因第1外显子多态性及其与体重、肌内脂肪含量的关联分析

【目的】探究沐川乌骨黑鸡激素敏感脂酶(hormone-sensitive lipase,LIPE)基因第1外显子单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的遗传变异,并分析其与体重、肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的相关性。【方法】采集106只沐川乌骨黑鸡血液,利用PCR扩增和直接测序技术检测LIPE基因第1外显子SNP位点,采用SPSS 21.0软件分析LIPE基因第1外显子SNP位点多态性及其与沐川乌骨黑鸡体重、胸肌IMF含量的相关性;通过生物信息学在线工具分析LIPE基因第1外显子SNP位点对其编码氨基酸的影响;利用实时荧光定量PCR检测LIPE基因在沐川乌骨黑鸡不同组织和不同基因型个体胸肌中的相对表达量。【结果】沐川乌骨黑鸡LIPE基因第1外显子共检测到3个SNP位点,66 bp处SNP位点(SNP1:c.66 A>C)上发现AA、AC和CC 3种基因型;440 bp处SNP位点(SNP2:c.440 A>G)上发现AA和AG 2种基因型;462 bp处SNP位点(SNP3:c.462 G>A)上发现GG和GA 2种基因型。卡方适合性检验表明,沐川乌骨黑鸡LIPE基因第1外显子的SNP2、SNP3位点符号哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05),SNP1位点偏离哈迪-温伯格平衡状态(P<0.05)。关联分析表明,SNP2位点的AG基因型个体胸肌IMF含量显著高于AA基因型(P<0.05),各位点不同基因型个体体重均无显著差异(P>0.05)。氨基酸序列比对分析显示,SNP2为非同义突变,其导致赖氨酸变为精氨酸。实时荧光定量PCR结果显示,LIPE基因在脂肪组织中表达量较高,SNP2位点AA基因型个体胸肌中LIPE基因mRNA表达水平极显著高于AG基因型(P<0.01)。【结论】沐川乌骨黑鸡LIPE基因第1外显子存在3个SNP位点,其中SNP2位点对沐川乌骨鸡IMF含量具有显著影响,该位点可作为沐川乌骨黑鸡IMF含量选育的候选分子遗传标记。

肺癌患者支气管肺泡灌洗液中K-ras基因第1外显子点突变与吸烟的关系

[目的 ]探讨支气管肺泡灌洗液 (BALF)细胞中K ras原癌基因点突变与吸烟的关系及其在肺癌早期诊断中的意义。 [方法 ]应用聚合酶链反应结合限制性片段长度多态性分析法 (PCR RFLP) ,检测了 3 7例吸烟肺癌患者、2 5例非吸烟肺癌患者以及 2 0例肺良性疾病支气管肺泡灌洗液细胞中K ras基因第 12位密码子突变的情况。 [结果 ]肺癌患者K ras基因突变率为 3 5 5 % (2 2 / 62 ) ,肺良性疾病中未发现有K ras基因突变者。突变的发生与患者的年龄及吸烟史有关 ,与性别、TNM分期无关 ;另外 ,重度吸烟者突变率 (68 8% )高于轻度 (2 5 0 % )及中度吸烟者 (3 0 8% ) ,(P <0 0 5 ) ,更明显地高于非吸烟者 (2 0 0 % ) ,(P <0 0 1)。 [结论 ]①吸烟可能是导致K ras基因突变的重要因素之一 ;②BALF细胞中K ras基因突变的检测对肺癌有一定的早期诊断价值 。

黑龙江省东部地区汉族人群PCSK9基因第1外显子多态性与脂代谢的相关性

目的 研究黑龙江省东部地区汉族人群前蛋白转化酶枯草溶菌素(PCSK)9基因第1外显子多态性与脂代谢的相关性.方法 因心绞痛和(或)运动试验阳性及有冠脉管腔狭窄证据而需入院行冠状动脉造影者220例中,110例冠心病(CHD)者为病例组,110例非CHD者为对照组,检测PCSK9基因第1外显子基因多态性及血脂水平,并对基因多态性与血脂水平进行相关性分析.结果 共发现c.121C>G、c.299C>T、c.427-428insGCT、A53V、P56S和c.556A>G 6个突变位点,其中在A53V突变位点上发现CC和TC两种基因型,但未发现TT基因型.病例组和对照组各基因型间血清三酰甘油(TG)、总胆固醇(TC)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平差异具有统计学意义(P<0.05).病例组中TC基因型血清TG、TC和LDL-C水平均显著高于CC基因型(P<0.05);对照组中TC基因型血清TC水平显著高于CC基因型(P<0.05).结论 PCSK9基因第1外显子在黑龙江省东部地区汉族人群中存在多态性,且与CHD患者脂代谢有关.

中国人甘露糖结合蛋白基因第1外显子核苷酸序列的测定

目的为了阐明中国人甘露糖结合蛋白(MBP)的基因突变对健康的影响和与疾病的关联,须测定中国人MBP基因的第1外显子的基因序列。方法应用PCR产物直接经310型全自动遗传分析仪进行DNA序列分析。结果测定了中国人甘露糖结合蛋白基因第1外显子核苷酸序列,检测到密码子54的纯合和杂合的点突变,未检测到密码子52和57的点突变。结论我们检测出中国人MBP基因第1外显子的核苷酸序列,密码子54基因的突变。

牙鲆GH基因第1外显子区微卫星标记与幼鱼生长性状的相关分析

以牙鲆(Paralichthys olivaceus)一个养殖群体中的100个个体为研究材料,分析了其GH基因第1外显子区域中微卫星座位的多态性,同时对各基因型与其体重、体长等生长性状进行了关联性分析。结果表明,该外显子微卫星座位具有一定的多态性,共检测到3个等位基因(A、B、C)、5种基因型,这3个等位基因的频率分别为0.339、0.609和0.517;该座位的观测杂合度及预期杂合度分别是0.540 3和0.511 2,多态信息含量及有效等位基因数分别是0.423 8和2.045 8。One-way ANOVA统计结果显示,基因型为AC的个体体重、头长和体高明显大于其他基因型个体(P<0.05),C是一个对体重、头长和体高有利的等位基因。

核基因NDUFS6第1外显子纯合缺失致线粒体复合物I缺陷一例

患儿，女，2岁，以“间断抽搐2个月，抽搐加重1d”于2014年10月入院。患儿系第1胎第1产，足月剖宫产，无产前宫内窘迫及生后窒息病史，母孕期间定期产检，否认妊娠期间高血压、糖尿病史，否认肝炎、结核等传染病接触史，

德国牧羊犬FSHR基因第1外显子SNP T89C与产仔数关系研究

为了研究FSHR基因与产仔数的关系,试验以警用德国牧羊犬种母犬基因组为模板,应用PCR技术克隆FSHR基因第1外显子,测序检测单核苷酸多态性(SNP)T89C位点,并进一步分析基因型对产仔数的影响。结果表明:FSHR基因第1外显子SNP T89C CC基因型个体产仔数显著少于TT基因型个体产仔数(P<0.05),说明SNP T89C位点与德国牧羊犬产仔数存在相关性。

水牛前脑锌指蛋白(FEZL)基因外显子1多态性研究

试验根据已有的哺乳动物FEZL基因序列设计引物,采用PCR产物直接测序技术对河流型与沼泽型水牛共144头水牛(属于10个群体)的FEZL基因第1外显子进行了序列测定和比较分析。结果表明,水牛FEZL基因第1外显子长度为907bp,水牛群体中FEZL基因第1外显子存在1个SNP(c.165G>A),属于同义替换,其buffaloG等位基因在群体中已接近固定;河流型和沼泽型两类水牛群体中FEZL基因第1外显子多个连续的甘氨酸残基编码区都为13G类型;水牛与普通牛、人、小鼠、马、猪和狗的FEZL基因第1外显子序列差异较大,推测水牛的FEZL在功能上可能与普通牛等其他物种存在差异;尽管两类水牛连续的甘氨酸残基编码区都为13G类型,但其可能与水牛乳腺炎易感性无直接关联。研究结果可为水牛乳腺炎的抗病育种提供遗传背景资料。

德国牧羊犬FSHR基因第1外显子的克隆与序列分析

为了研究德国牧羊犬卵泡刺激素受体(FSHR)基因多态性,试验以警用德国牧羊犬的基因组为模板,根据GenBank报道的拳师犬FSHR基因第1外显子序列设计引物,应用PCR技术,克隆和测定FSHR基因第1外显子序列,并进行BLAST比对分析。结果表明:30只受试犬基因遗传同源性高达100%,6只受试犬基因遗传同源性达99.6%,存在1处有义突变(SNP T89C)。

绵羊MYF6基因多态性对胴体瘦肉性状的影响

【目的】研究绵羊生肌因子6(myogenic factor 6,MYF6)基因的多态性,分析其对羔羊胴体瘦肉性状的影响。【方法】以215只新西兰罗姆尼公羔为对象,采集其血样,屠宰后测定其后腿、腰部和肩部瘦肉量等胴体指标。提取血样基因组DNA,采用PCR-SSCP检测MYF6基因5′UTR和第1外显子2个区域的多态性,分析核苷酸序列变异对羔羊胴体瘦肉性状的影响。采集绵羊乳腺、肝脏、心脏、背最长肌、脾脏、肺脏、卵巢和肾脏组织,以β-actin为内参基因,用RT-qPCR等方法检测MYF6基因的相对表达量。【结果】在第1外显子区域,检测到1个SNP(c.129 C>T),有A和B 2种等位基因,存在AA和AB 2种基因型。在5′UTR区域检测到1个3 bp的碱基缺失(c.-589~-590 del ATA),有C和D 2种等位基因,存在CC和DD 2种基因型。2个区域的基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态。MYF6基因第1外显子的基因型极显著影响了羔羊后腿、腰部和肩部3个部位的瘦肉量,以及总瘦肉量和腰部瘦肉比例(P<0.01)。MYF6基因在绵羊乳腺、肝脏、心脏等8个组织中均有表达,但以背最长肌中的表达量最高(P<0.05)。【结论】绵羊MYF6基因具有丰富的多态性,其基因型对胴体瘦肉性状有显著影响。

影响细胞分化相关基因NDRG1作用的相关因素研究进展

N-myc下游调节基因（ N-myc downstream regulated gene ， NDRG）1属于NDRG家族，α／β水解酶超家族，但没有水解酶催化位点［1］。最初是在N-myc敲除的小鼠胚胎组织中发现的，受 N-myc 的抑制而得名。 NDRG1位于人类染色体8q24，全长约60 kb，包括16个外显子和15个内含子，含有一个与第1外显子和第1内含子5′端重叠的CpG岛，C末端包含有3段特有的10个亲水性氨基酸残基（ GTRSRSHTSE ）串联重复序列。 NDRG1含有磷酸泛酰巯基乙胺序列，在一些多酶复合物中，该序列提供辅基酰基载体蛋白，作为“摆动臂”活化氨基酸和脂肪酸［2］。

近亲结婚的遗传性凝血因子Ⅻ缺陷症家系分析

女儿和儿子均为Gly542Ser杂合型。先证者及家系成员F皿基因第1外显子启动子区第46位C—T多态性均为46T／T型。结论该遗传性凝血因子Ⅻ缺陷症家系先证者FⅫ基因第14外显子存在g．8699G〉A纯合型错义突变，导致Oly542Ser，推测与父母近亲结婚有关。Gly542Ser和46T／T与该遗传性凝血因子Ⅻ缺陷症家系FⅫ水平降低有关。