将荧光定量PCR技术与等位基因特异性扩增(Allele specific amplification,ASA)方法相结合,发展了一种可以快速检测基因点突变的实时荧光等位基因特异性扩增(Real-time ASA)方法.将该法用于检测K-ras癌基因第12位密码子发生的点突变,分...将荧光定量PCR技术与等位基因特异性扩增(Allele specific amplification,ASA)方法相结合,发展了一种可以快速检测基因点突变的实时荧光等位基因特异性扩增(Real-time ASA)方法.将该法用于检测K-ras癌基因第12位密码子发生的点突变,分别采用针对其不同点突变方式(GAT,GTT,CGT)设计的突变型引物对待测样品进行ASA,只有突变型样品能被顺利扩增出双链DNA产物,该产物才能与双链DNA染料SYBR GreenⅠ结合,发出荧光信号从而被检测到.用该法检测31例结肠癌组织中的K-ras癌基因点突变,其中有15例样品检出为突变型.Real-time ASA法可检测到样品中含量为1/1000的突变型基因,具有灵敏、快速、简便、安全、高通量和低成本等优点,可望用于大量临床样本的点突变筛查.展开更多
针对传统电泳检测方法存在操作复杂、费时等缺点,提出一种用于检测K-ras癌基因点突变的实时荧光等位基因特异性扩增(Allele specific amplification,ASA)方法。该法采用突变型引物对结肠癌基因组中的K-ras基因进行等位基因特异性扩增,...针对传统电泳检测方法存在操作复杂、费时等缺点,提出一种用于检测K-ras癌基因点突变的实时荧光等位基因特异性扩增(Allele specific amplification,ASA)方法。该法采用突变型引物对结肠癌基因组中的K-ras基因进行等位基因特异性扩增,只有突变型样品能被顺利扩增出双链DNA产物,该产物能与双链DNA染料SYBR GreenⅠ结合,产生荧光信号从而被检测到。通过对荧光域值和溶解曲线分析来区分不同的基因突变类型。该法可以检测到野生型DNA中含量为1/1 000的突变型DNA,整个检测时间小于1 h。我们用该法检测31例结肠癌样品中K-ras基因密码子12发生的点突变,其中有15例检出为阳性。此外,还采用等位基因特异性扩增结合电泳分析对样品进行了检测,并对两种方法进行了比较。结果显示:实时荧光等位基因特异性扩增方法具有操作简便、快速、检测成本低等优点,为临床诊断基因突变引起的疾病提供了一种可行的手段。展开更多
根据外源插入序列与大豆内源基因边界序列,用设计软件Primer Explorer Version 3设计并筛选了转基因大豆GTS 40-3-2品系的环介导等温扩增引物,并进行了反应体系和反应条件的优化,建立了转基因大豆GTS 40-3-2品系特异性环介导等温扩增检...根据外源插入序列与大豆内源基因边界序列,用设计软件Primer Explorer Version 3设计并筛选了转基因大豆GTS 40-3-2品系的环介导等温扩增引物,并进行了反应体系和反应条件的优化,建立了转基因大豆GTS 40-3-2品系特异性环介导等温扩增检测方法。对该方法进行了特异性、灵敏度、稳定性评价,结果显示:该方法能够特异、稳定、灵敏地检测大豆及其制品中的转基因大豆GTS 40-3-2成分,检测低限达到0.5%。此外,对12份实际样品的检测结果表明,该方法与实时荧光PCR方法的检测性能相当,结果吻合率为100%,假阳性率和假阴性率均为0。展开更多
针对烟草属特异性基因Ntsp151序列保守区设计环介导等温扩增(LAMP)引物,基于SYBR Green I荧光染料对烟草材料进行可视化LAMP检测,对检测过程中的DNA提取方法和反应条件进行优化,并对LAMP反应体系的特异性和灵敏度进行评价。结果表明:使...针对烟草属特异性基因Ntsp151序列保守区设计环介导等温扩增(LAMP)引物,基于SYBR Green I荧光染料对烟草材料进行可视化LAMP检测,对检测过程中的DNA提取方法和反应条件进行优化,并对LAMP反应体系的特异性和灵敏度进行评价。结果表明:使用Chelex-100提取的DNA可以直接进行LAMP扩增反应,显色效果较好;LAMP最适反应条件为扩增温度63℃、反应时间60 min、Mg^(2+)浓度6 mmol/L;LAMP对17份非烟草材料和1份烟草材料基因组DNA的扩增显色结果与荧光值的检测结果一致,具有较好的特异性,其最低检测限为10^(2) copies/μL。基于烟草属特异性基因Ntsp151的LAMP检测结果可视化强,且灵敏度高、特异性强,适用于现场抽检。展开更多
基金supported by the National Natural Science Foundation of China(81071790,30600128,81102159)The Key Project of Chinese Ministry of Education(211131)+2 种基金The Natural Science Foundation of Guangdong Province(7005825,S2011040003622)The Science and Technology Project of Guangzhou Nansha District(RG201001003)The Foundation for Distinguished Young Talents in Higher Education of Guangdong(2009)
文摘针对传统电泳检测方法存在操作复杂、费时等缺点,提出一种用于检测K-ras癌基因点突变的实时荧光等位基因特异性扩增(Allele specific amplification,ASA)方法。该法采用突变型引物对结肠癌基因组中的K-ras基因进行等位基因特异性扩增,只有突变型样品能被顺利扩增出双链DNA产物,该产物能与双链DNA染料SYBR GreenⅠ结合,产生荧光信号从而被检测到。通过对荧光域值和溶解曲线分析来区分不同的基因突变类型。该法可以检测到野生型DNA中含量为1/1 000的突变型DNA,整个检测时间小于1 h。我们用该法检测31例结肠癌样品中K-ras基因密码子12发生的点突变,其中有15例检出为阳性。此外,还采用等位基因特异性扩增结合电泳分析对样品进行了检测,并对两种方法进行了比较。结果显示:实时荧光等位基因特异性扩增方法具有操作简便、快速、检测成本低等优点,为临床诊断基因突变引起的疾病提供了一种可行的手段。
文摘根据外源插入序列与大豆内源基因边界序列,用设计软件Primer Explorer Version 3设计并筛选了转基因大豆GTS 40-3-2品系的环介导等温扩增引物,并进行了反应体系和反应条件的优化,建立了转基因大豆GTS 40-3-2品系特异性环介导等温扩增检测方法。对该方法进行了特异性、灵敏度、稳定性评价,结果显示:该方法能够特异、稳定、灵敏地检测大豆及其制品中的转基因大豆GTS 40-3-2成分,检测低限达到0.5%。此外,对12份实际样品的检测结果表明,该方法与实时荧光PCR方法的检测性能相当,结果吻合率为100%,假阳性率和假阴性率均为0。
