一步等位基因特异扩增法检测中国人N-乙酰化酶基因型

目的建立简化的一步等位基因特异扩增法(ASA),研究中国人N-乙酰化酶(NAT2)多态性等位基因的分布。方法用一步法直接检测215名中国健康人NAT2 *5,*6,*7等位基因。结果一步法测定结果与两步法一致。215名健康中国人NAT2 *5,*6,*7 3种突变型等位基因的基因频率分别为3.3％,24.6％和10.0％。基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。野生型纯合子、杂合子和突变型纯合子分别为85,96和34人,分别占39.5％,44.7％和15.8％。结论一步法测定NAT2基因准确、方便,为临床个体化合理用药提供理论基础。

等位基因特异扩增法研究中国人CYP2D6中速代谢的相关基因

目的 建立CYP2D6 10B的等位基因特异扩增法 (ASA PCR) ,以探讨中国人CYP2D6中速代谢的基因分型。方法 采用两步扩增法得到CYP2D6 10B等位基因特异片段 ,分析健康中国汉族人CYP2D6 10B等位基因 ,并探讨基因分型结果与右美沙芬表型分型结果的相关性。结果 35名表型为极快代谢受试者 (VEMs)中 ,CYP2D6 10B以杂合子 (wt/m)为主占 5 7% ;2 9名中速代谢受试者 (IMs)以突变型纯合子 (m/m)为主占 6 9% ;慢代谢受试者 (PM)基因型为m/m。CYP2D6 10Bm/m组的MR明显大于wt/m组和野生型组 (wt/wt)。结论 ASA PCR法有快速、准确的优点 。

应用等位函数法模拟溃坝流动

采用等位函数法配合三维不可压缩纳维叶-斯托克斯方程式的计算方法求解溃坝流场。控制方程式采用有限差分法求解,并利用投影法导出压力的波松方程,使得能自动满足连续方程式。此外,利用了WENO法求解等位函数方程的空间离散项。最后以三维溃坝问题做计算,发现数值计算结果与试验数据相当吻合,显示出数值模式的成功。

采用等位函数法求解自由液面流场

文章采用等位函数法求解二维自由液面流动问题。通过导出压力方程,使得连续方程式能自动满足。当压力解出后,即可由运动方程式求解出速度场并以自由跌水流进行了验证。数值结果表明:对于破碎或合并界面的捕捉良好。

等位基因特异扩增法检测移植患者多药耐药基因多态性

目的:建立等位基因特异扩增法(Allele-Specific Amplification,ASA-PCR)研究移植患者多药耐药基因(multi-drug re- sistance gene,MDR1)多态性。方法:用ASA-PCR对177位肝、肾移植患者的MDR1第26外显子C3435T、第21外显子G2677T/A位点和第12外显子C1236T位点进行基因分型。结果:ASA-PCR测定结果与聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性方法(Polymerase chain reaction-Restriction Fragment Analysis,PCR-RFLP)的测定结果一致。177例移植患者DNA标本中,C3435T:CC型69例(39.0%),CT型92例(52.0%),TT型16例(9.0%);G2677T/A:GG型39例(22.0%),GT型48例(27.1%),TT型32例(18.1%),GA型30例(16.9%),AT型24例(13.6%),AA型4例(2.3%);C1236T:CC型23例(13.0%),CT型88例(49.7%),TT型66例(37.3%)。结论:采用ASA-PCR检测移植患者MDR1多态性准确、方便,可为临床个体化用药提供理论依据。

系谱追踪等位变异法分析籼粳交亲本对衍生后代的遗传贡献

利用16个亲本及特异种质92gk729的39个衍生品系为材料,采用221对SSR标记和系谱追踪等位变异法分析祖先亲本在籼粳杂交各衍生世代的遗传贡献。结果表明:(1)在92gk729中有10对SSR引物位点上出现4个祖先亲本杂交重组的特异条带,有5个重组后的特异位点能稳定传递到衍生后代中,有1个重组后的特异位点在亲本及衍生品系中都没有出现;(2)ketan Nangka、嘉南粳、02428、明恢72对92gk729的遗传贡献率分别为15.09%、21.32%、22.78%和34.64%。4个亲本杂交染色体片段重组后能产生新的特异位点,其遗传贡献率是6.17%;(3)4个祖先亲本在每条染色体上对衍生后代遗传贡献的趋势都是随着衍生代数的递增,遗传贡献率逐渐下降。亲本对各世代衍生品系的遗传贡献率为明恢72>02428>嘉南粳>Kenta Nangka;(4)采用系谱追踪等位变异法进行数据分析,然后对数据进行聚类,发现同一杂交组合的品系、同一系谱分支存在衍生关系的大部分品系聚为一类,后代亲缘关系相近的高代材料聚为一类。说明该法能够较好地反映祖先亲本对后代的遗传贡献。

ABO基因分型的等位基因特异性引物消耗法

目的建立一种新的ABO基因型分型的等位基因特异性引物消耗法(CASPA)。方法根据ABO基因碱基序列中的第261、297、803nt3处多态性位点设计6条特异性引物及1条公用引物,采用CASPA法鉴定146名中国汉族无关个体血液斑样品的ABO基因型。结果146名中国汉族无关个体血液斑样品中检出AAb、AB、AO1、BOv、O1Ov、AA、BB、O1O1、BO1等9种基因型,结果明确,其基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论ABO基因型CASPA分型方法为ABO血型的鉴定提供了一个新的检测方法。

两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用比较

目的比较TaqTMHotStarDNA聚合酶和TspTMPlatinum DNA聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用效果。方法取120例抗血栓治疗患者全血进行DNA提取、多重PCR扩增,将产物分2份,1份用TaqTMHotStarDNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,1份用TspTMPlatinum DNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,然后进行杂交反应,用Luminex 200系统检测CYP2C19基因多态性,同时将所有样本送第三方进行基因测序。结果TaqTMHotStarDNA聚合酶组检测结果与测序结果完全一致,TspTMPlatinum DNA聚合酶则会出现一些偏差,说明TaqTMHotStarDNA聚合酶参与的检测结果分辨率明显高于TspTMPlatinum DNA聚合酶参与的检测结果。结论两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中均可以取得一定的检测结果,但是为了结果的可靠性建议在检测过程中使用TaqTMHotStarDNA聚合酶。

逃逸人工势场法局部极小值策略的研究

人工势场法由于其算法的简洁性和有效性在实际问题中获得了应用,但其存在容易陷入局部极小值、在障碍附近震荡现象的缺点,如何解决这些问题是人工势场法研究的主要热点。论文将作为势场模型的Gaussian函数进行了适当变形,使其能更准确地反映势场环境。通过分析震荡现象产生的原因,以及局部极小值点的特点,将粒子群算法引入到势场的探测过程中,在此基础上提出了等位线法用于逃逸局部极小值。仿真结果表明本文方法能有效消除运动路径的震荡现象,极大地降低了陷入局部极小值的概率。

鳜胰蛋白酶基因外显子3上SNP G169A位点鉴定和四种不同检测方法的比较

采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G和A的基因频率分别为0.53和0.47。用创造限制性酶切位点法PCR(CRS-PCR)、单管双向等位基因专一性扩增(SB-ASA)和单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对该SNP位点进行验证。结果表明,CRS-PCR法不能对该SNP位点分型,PCR-SSCP和SB-ASA法可以且准确度分别为100%和96.67%。

基于SAP2000的超大型厂房类项目大跨度连跨屋面双层钢网架不等位提升仿真分析控制

某项目屋面为大跨度双层网架结构,网架安装需确保其变形及应力均在规范允许范围内。考虑到网架覆盖面积较大,构件数量繁多,为确保工期,通过大量的施工模拟验算确定采用“分区地面拼装,整体不等位提升”的施工方法完成结构整体提升,满足了设计要求,保证了结构安全。

试论领导班子的离心现象与协调机制

在社会政治生活中,常常见到这样一种情况,一些领导班子开始是团结和睦的,后来随着时间的推移,工作的开展,相互的磨擦,渐渐地产生了矛盾,出现了离心现象;又有些班子旧的矛盾解决了,新的矛盾又抬头。这是什么原因?能否用一种机制来消除和克服此种离心倾向,本文想就此问题作一初步探讨。

一道数学竞赛题的一般形式

介绍浙江省2008年高等数学竞赛一道二重积分的一般形式,分别利用化累次积分法、变数替换法、等值线法给出不同的证明.

药物代谢酶CYP3A在中国肾移植人群的遗传多态性

目的:建立药物代谢酶CYP3A4、CYP3A5的多个等位基因分型方法,为进一步从基因水平研究CYP3A与机 体对药物反应的个体差异本质及其与药物代谢的相关性提供分子生物学实验方法;探讨药物代谢酶CYP3A在中 国肾移植人群的遗传多态性。 方法:用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)法及特异性等位基因 扩增(PCR ASA)法分别建立了CYP3A的CYP3A4亚型三个新突变点(CYP3A4 4、 5、 6)及CYP3A5亚型的 CYP3A5 3基因分型方法,并对中国肾移植人群进行基因分型。 结果:CYP3A4 4、 5、 6、CYP3A5 3在中 国肾移植人群的基因频率分别为0.75%、0.76%、0.75%和27.83%;个体突变率分别为2/133、3/197、3/200和 55/115。 结论:研究结果提示,中国肾移植人群中CYP3A4 4、 5、 6、CYP3A5 3的存在可能使其表达的药 物代谢酶活性改变,从而影响药物在体内的代谢过程。

关于一个二重积分计算公式

约定f为连续函数,分别利用交换积分次序、变量替换、等位线法等三种方法证明二重积分计算公式∫a0∫a0f(x+y)dxdy=∫a0(a-t)f(t+a)dt+∫a0tf(t)dt,并得到一个类似公式∫a0∫a0f(x-y)dxdy=∫a0tf(t-a)dt+∫a0(a-t)f(t)dt.

电阻率层析成像技术的回顾与展望

电阻率层析成像作为物探技术的前缘课题之一,具有广泛的应用前景,近几年得到迅速发展,出现许多新方法。对电阻率层析成像的几种实现方法,如佐迪法、电阻率反投影法、电流线追踪法、积分法、共轭梯度法、等位线追踪法等的现状、进展作了系统介绍,论述了各种方法的优缺点及最新进展情况,提出了进一步研究的方向。

人工修饰双等位基因特异性引物扩增法测定人ABC1基因突变点I823M

目的 建立一种简单、快速测定三磷酸腺苷结合盒转运子 1(ATP binding- cassettetransporter 1,ABC1)基因突变点 I82 3M的方法。方法 设计两种等位基因特异性引物 ,分别与 DNA双链的两条单链互补 ,其 3′端正好与单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism ,SNP)位点重合 ,由引物的 3′端控制着引物的延伸反应 ,根据延伸反应的长度确定等位基因的类型 ,并通过在引物的 3′端区域引入一个人为不匹配碱基来提高延伸反应的特异性。结果 人为引入错配碱能提高单核苷酸多态性分析的特异性 ;通过优化实验条件 ,用本室建立的双等位基因特异性扩增法 ,可测定人 ABCA1基因突变点 I82 3M的不同 SNP类型。结论 人工修饰双等位基因特异性引物扩增法可用于人基因组中单核苷酸多态性的快速测定 ,不需使用复杂仪器设备 ,便于推广使用。

CYP1A1基因多态性与宫颈鳞癌的关系

目的:检测宫颈鳞癌组织中CYP1A1等位基因的表达,探讨CYP1A1基因多态性在宫颈鳞癌发生中的作用。方法:收集宫颈鳞癌组织标本50例,以正常宫颈组织61例为阴性对照。采用等位基因特异性PCR法(ASA-PCR)和PCR扩增限制酶切法(RFLP-PCR)检测宫颈鳞癌组织中CYP1A1等位基因Exon7位点和MspⅠ位点多态性;用SPSS13.0软件建立数据库,进行χ2检验、logistic回归分析。结果:(1)CYP1A1Exon73种多态基因型在宫颈鳞癌组和对照组分布差异有统计学意义(P<0.005),宫颈鳞癌组Ile/Val、Val/Val基因型的分布频率明显高于对照组。Ile/Val和Val/Val基因型的个体发生宫颈鳞癌的OR值分别是Ile/Ile基因型个体的1.969倍和3.15倍,差异有统计学意义(P<0.05);(2)CYP1A1MspⅠ位点多态性分析:将MspⅠ位点的PCR产物行酶切分析,显示m1/m2杂合型、m2/m2突变型在宫颈鳞癌组和对照组表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论:宫颈鳞癌组织中CYP1A1基因Exon7位点突变率升高,Ile/Val和Val/Val基因突变型个体发生宫颈鳞癌的危险性明显升高;CYP1A1基因MspⅠ位点的多态性可能与宫颈鳞癌易感性无关。