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山药块茎生长膨大相关基因的筛选与分析
1
作者
梁任繁
黄皓
+4 位作者
周生茂
王爱勤
詹洁
文俊丽
何龙飞
《中国蔬菜》
北大核心
2024年第9期61-67,共7页
为筛选山药块茎生长膨大相关基因,采用生物信息学方法,对山药块茎发育前期和中期构建的不同发育阶段抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)文库进行分析。结果表明:山药块茎发育前期与中期差异表达基因(differenti...
为筛选山药块茎生长膨大相关基因,采用生物信息学方法,对山药块茎发育前期和中期构建的不同发育阶段抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)文库进行分析。结果表明:山药块茎发育前期与中期差异表达基因(differential expression genes,DEGs)序列主要涉及九大类,其中发育调控占比最大(27.1%),其他依次为细胞组织结构(14.0%)、物质代谢(11.2%)、生物合成(4.7%)等。初步筛选出泛素-连接酶体(F-box associated,F-box)、碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CAs)、核苷二磷酸激酶(nucleoside diphosphate kinase,NDPK)、氨基酸透性酶(amino acid permease)、糖基转移酶(glycosyl transferase)、α-淀粉酶(α-amylase,AMY)等候选基因,它们可能与细胞增殖、细胞伸长、激素代谢、酸碱环境调节及功能物质代谢物等功能有关,参与调控山药块茎的生长膨大。
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关键词
山药
块茎
生长膨大
相关基因
筛选和分析
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题名
山药块茎生长膨大相关基因的筛选与分析
1
作者
梁任繁
黄皓
周生茂
王爱勤
詹洁
文俊丽
何龙飞
机构
广西大学农学院
广西农业科学院
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2024年第9期61-67,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2023YFD1200201)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系项目(CARS-21)。
文摘
为筛选山药块茎生长膨大相关基因,采用生物信息学方法,对山药块茎发育前期和中期构建的不同发育阶段抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)文库进行分析。结果表明:山药块茎发育前期与中期差异表达基因(differential expression genes,DEGs)序列主要涉及九大类,其中发育调控占比最大(27.1%),其他依次为细胞组织结构(14.0%)、物质代谢(11.2%)、生物合成(4.7%)等。初步筛选出泛素-连接酶体(F-box associated,F-box)、碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CAs)、核苷二磷酸激酶(nucleoside diphosphate kinase,NDPK)、氨基酸透性酶(amino acid permease)、糖基转移酶(glycosyl transferase)、α-淀粉酶(α-amylase,AMY)等候选基因,它们可能与细胞增殖、细胞伸长、激素代谢、酸碱环境调节及功能物质代谢物等功能有关,参与调控山药块茎的生长膨大。
关键词
山药
块茎
生长膨大
相关基因
筛选和分析
Keywords
yam(Dioscorea alata L.)
tuber
growth and expansion
related genes
screening and analysis
分类号
S63 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
山药块茎生长膨大相关基因的筛选与分析
梁任繁
黄皓
周生茂
王爱勤
詹洁
文俊丽
何龙飞
《中国蔬菜》
北大核心
2024
0
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