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题名利用小RNA深度测序技术检测灰飞虱病毒种类
被引量:1
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作者
朴君
张璐婕
朴敬爱
周益军
李硕
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机构
辽宁师范大学生命科学学院
江苏省农业科学院植物保护研究所
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期281-288,共8页
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基金
江苏省农业科技自主创新资金项目(CX[20]3135)。
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文摘
灰飞虱是一种重要农业害虫,作为病毒介体,可以传播多种植物病毒引起水稻、小麦和玉米等粮食作物病毒病害。目前对于灰飞虱体内昆虫病毒种类尚缺乏系统认识,难以开展利用昆虫病毒防治灰飞虱相关研究工作。为挖掘灰飞虱体内昆虫病毒资源,本文通过小RNA深度测序技术对灰飞虱所携带的病毒种类进行分析鉴定。结果显示,测序数据比对得到13种病毒,涉及8个病毒科和2种未分类病毒。除占据优势的水稻条纹病毒外,其余均为专性寄生的昆虫病毒,包括5种正链RNA病毒、2种单链DNA病毒和5种双链DNA病毒。在这些病毒中,发现了一种与果蝇A病毒较相似的新病毒,克隆出其依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)基因1-1 932位核酸序列,经Blast比对和系统进化分析,在氨基酸序列中发现RdRP掌型亚结构域保守区呈现复制酶置换四体病毒科(Permutotetraviridae)病毒所具有的"C-A-B"排列样式,确定该病毒是一种新的类复制酶置换四体病毒,暂命名为Laodelphax striatellus permutotetra-like virus(LsPLV)。这是首次在半翅目昆虫中发现类复制酶置换四体病毒。本研究表明灰飞虱体内昆虫病毒种类较为丰富,为今后利用昆虫病毒生物防治灰飞虱奠定了基础。
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关键词
灰飞虱
昆虫病毒
小RNA深度测序
类复制酶置换四体病毒
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Keywords
small brown planthopper
insect virus
small RNA deep sequencing
Laodelphax striatellus permutotetra-like virus
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分类号
S433
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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