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副溶血弧菌海产品分离株tdh基因及其临近区域结构分析
被引量:
5
1
作者
王淑娜
Khamphouth VONGXAY
+4 位作者
沈飚
周向阳
金培婕
陈健舜
方维焕
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1576-1583,共8页
【目的】初步探索副溶血弧菌海产品分离株tdh基因区域的结构特征。【方法】采用长距离PCR和基因步移技术进行tdh基因侧翼序列扩增,测序验证后拼接成疑似毒力基因片段,将所获序列与NCBI数据库进行比较,初步明确tdh基因侧翼序列的结构与...
【目的】初步探索副溶血弧菌海产品分离株tdh基因区域的结构特征。【方法】采用长距离PCR和基因步移技术进行tdh基因侧翼序列扩增,测序验证后拼接成疑似毒力基因片段,将所获序列与NCBI数据库进行比较,初步明确tdh基因侧翼序列的结构与功能。【结果】海产品分离株ZS34与参考菌株RIMD2210633的tdh基因区域(VPA1310-VPA1327)结构基本一致,核苷酸同源性达98.3%;而FJ14与WZ64株基因组中的tdh基因均与tdh3的同源性最高,在基因组中的位置也不同于ZS34株和参考菌株。FJ14基因组中的tdh与trh-ure基因簇相连,tdh与trh基因间的距离约为15kb,中间分散着类插入序列;菌株WZ64没有trh基因,但tdh基因上游也有类插入序列。【结论】副溶血弧菌海产品分离株tdh基因区域具有多态性且存在类插入序列,是毒力基因水平转移的佐证。
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关键词
副溶血弧菌
tdh基因
类插入序列
基因水平转移
原文传递
题名
副溶血弧菌海产品分离株tdh基因及其临近区域结构分析
被引量:
5
1
作者
王淑娜
Khamphouth VONGXAY
沈飚
周向阳
金培婕
陈健舜
方维焕
机构
浙江大学动物预防医学研究所
舟山出入境检验检疫局综合技术服务中心
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1576-1583,共8页
基金
国家自然科学基金(30571436)~~
文摘
【目的】初步探索副溶血弧菌海产品分离株tdh基因区域的结构特征。【方法】采用长距离PCR和基因步移技术进行tdh基因侧翼序列扩增,测序验证后拼接成疑似毒力基因片段,将所获序列与NCBI数据库进行比较,初步明确tdh基因侧翼序列的结构与功能。【结果】海产品分离株ZS34与参考菌株RIMD2210633的tdh基因区域(VPA1310-VPA1327)结构基本一致,核苷酸同源性达98.3%;而FJ14与WZ64株基因组中的tdh基因均与tdh3的同源性最高,在基因组中的位置也不同于ZS34株和参考菌株。FJ14基因组中的tdh与trh-ure基因簇相连,tdh与trh基因间的距离约为15kb,中间分散着类插入序列;菌株WZ64没有trh基因,但tdh基因上游也有类插入序列。【结论】副溶血弧菌海产品分离株tdh基因区域具有多态性且存在类插入序列,是毒力基因水平转移的佐证。
关键词
副溶血弧菌
tdh基因
类插入序列
基因水平转移
Keywords
Vibrio parahaemolyticus
tdh gene
IS-like elements
Lateral gene transfer
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
副溶血弧菌海产品分离株tdh基因及其临近区域结构分析
王淑娜
Khamphouth VONGXAY
沈飚
周向阳
金培婕
陈健舜
方维焕
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
原文传递
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