猪繁殖与呼吸综合征病毒TJxq1701株全基因组序列分析

为了解天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,2017年从天津某发病猪场采集的疑似PRRSV感染病料,接种Marc-145细胞分离到1株PRRSV毒株,将其命名为TJxq1701株;应用RT-PCR分段扩增出各基因片段,分别克隆到pMD-18T载体鉴定后测序。序列分析结果表明,TJxq1701株基因组全长15321 nt(不包括polyA尾),在分子遗传演化上与HP-PRRSV参考毒株JXA1和JXA1-P80的核酸同源性分别为99.2%和99.7%,与CH-la和VR2332的同源性为95.1%和89.5%,与NADC30同源性为84.4%,而与欧洲型Lelystad virus(LV)株的同源性仅为61.0%。Nsp2基因存在与HP-PRRSV参考毒株位置相同的90个碱基缺失;氨基酸位点分析表明在Nsp1-3、Nsp9-11、Gp2-Gp5存在至少10处以上与JXA1-P80相同的特征性位点突变,推测该分离毒株为JXA1-P80遗传演化毒株(类JXA1-P80毒株)。