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小麦类硫素基因家族鉴定及表达分析
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作者 李晶晶 李闯 +1 位作者 路亚南 郑文明 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期729-737,共9页
类硫素(thionin-like,Thil)在植物应对病原微生物侵染的防御反应中具有重要生物学功能。本研究通过拟南芥(Arabidopsis thaliana)的Thil基因序列,利用同源搜寻及生物信息学方法初步鉴定到普通小麦(Triticum aestivum L.)的Thil基因家族... 类硫素(thionin-like,Thil)在植物应对病原微生物侵染的防御反应中具有重要生物学功能。本研究通过拟南芥(Arabidopsis thaliana)的Thil基因序列,利用同源搜寻及生物信息学方法初步鉴定到普通小麦(Triticum aestivum L.)的Thil基因家族。结果表明,Thil基因家族在普通小麦中包含26个成员。基因序列结构分析得到Thil家族存在保守的基序结构,家族各成员基因编码的蛋白质序列包含79~196个氨基酸,大部分蛋白质的氨基酸数量少于140,其中20个蛋白质包含信号肽。顺式作用元件预测分析结果显示,小麦Thil基因的启动子调控元件受到脱落酸等逆境胁迫相应激素的影响,同时基因表达谱呈现出受到病原菌胁迫诱导后的多样性表达。通过进一步qRT-PCR验证分析表明,普通小麦的TaThil-4A、TaThil-4B和TaThil-4D等3个基因在叶锈病菌早期侵染中被诱导表达。本研究结果可为小麦抗病育种及Thil基因家族的功能鉴定与应用提供参考。 展开更多
关键词 小麦 类硫素 抗病 叶锈菌
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推定第四类羊毛硫素合成酶生物信息学分析 被引量:3
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作者 胡彦婷 安丽康 +4 位作者 尹淑丽 程辉彩 张根伟 张丽萍 刘洪伟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2464-2472,共9页
【目的】获得更多关于第四类羊毛硫素合成酶的序列及蛋白结构特征信息,并为研究其作用机制及生物学功能奠定基础。【方法】应用多种软件分析和预测了山丘链霉菌、枯草芽孢杆菌、肺炎双球菌、惰性乳杆菌、德氏乳杆菌、长双歧杆菌、拟无... 【目的】获得更多关于第四类羊毛硫素合成酶的序列及蛋白结构特征信息,并为研究其作用机制及生物学功能奠定基础。【方法】应用多种软件分析和预测了山丘链霉菌、枯草芽孢杆菌、肺炎双球菌、惰性乳杆菌、德氏乳杆菌、长双歧杆菌、拟无枝酸菌、大芬戈尔德菌中此类蛋白质的理化性质、结构域、二级结构等,同时采用邻位连接法对这8种蛋白及其结构域进行了进化树的构建。【结果】所研究的这8种蛋白均为亲水性蛋白,均无信号肽;山丘链霉菌、枯草芽孢杆菌、肺炎双球菌、德氏乳杆菌、长双歧杆菌、拟无枝酸菌、大芬戈尔德菌的此类合成酶属于酸性蛋白,惰性乳杆菌的类第四类羊毛硫素合成酶属于碱性蛋白;除山丘链霉菌、枯草芽孢杆菌、肺炎双球菌的此类合成酶不稳定外,其它菌株的合成酶均稳定;进化结果表明枯草芽孢杆菌和肺炎链球菌同源性最高,LANC-like结构域与合成酶的进化关系保持了高度的一致,而STYKc/S_TKc结构域的进化关系表现出了一定的差异;二级结构主要以α螺旋和无规卷曲为主;所有的蛋白均有LANC-like结构域。【结论】类第四类羊毛硫素合成酶在不同的菌种中具有一定的保守性,因此能够发挥相似的生物学功能。研究结果对进一步研究第四类羊毛硫素合成酶具有一定的参考价值,尤其是为通过该途径进一步提高枯草芽孢杆菌生防价值提供基础。 展开更多
关键词 第四羊毛硫素合成酶 生物信息学 枯草芽孢杆菌
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大麦Thionin-like基因家族基因表达谱分析 被引量:1
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作者 杨宏亮 袁桢 +1 位作者 钱徐佳志 徐大伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期140-147,共8页
类硫素基因Thil(Thionin-like)在植物防御系统中具有抗病原微生物的活性,然而对它的功能却不清楚。通过对Thil基因家族在大麦中的序列组成及基因结构、染色体分布、蛋白保守结构域、系统进化树、基因启动子元件、亚细胞定位和表达谱分析... 类硫素基因Thil(Thionin-like)在植物防御系统中具有抗病原微生物的活性,然而对它的功能却不清楚。通过对Thil基因家族在大麦中的序列组成及基因结构、染色体分布、蛋白保守结构域、系统进化树、基因启动子元件、亚细胞定位和表达谱分析,为其生物学功能研究提供借鉴。共鉴定出7个大麦Thil基因,这些基因分布于1、2、4、5和6号染色体上;基因结构分析均表明,除Thil4存在一定的差异外,其它家族成员序列都较为保守;通过系统进化树可以看出大麦Thil基因分为4个亚家族;表达谱分析结果显示,在大麦不同组织中,Thil基因的表达量有所不同,总体来看,Thil基因在根和种子中的表达量极低,在幼叶中表达量最高。Thil家族不同成员之间的蛋白亚细胞定位结果也不一样,Thil1和Thil2主要定位于细胞膜、细胞核和细胞质上,Thil3和Thil7定位于细胞膜上,Thil6定位于叶绿体。Thil基因与植物的保护和防御机制有关,在幼叶中能够激发植物保护机制的元件响应最多,荧光定量PCR实验结果显示,Thil基因在幼叶中的表达量最高,在亚细胞定位中可以发现不同的成员之间在进化过程中分别参与了不同的发育学过程。 展开更多
关键词 大麦 类硫素 基因结构 基因表达谱
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Treatment of severe steroid refractory ulcerative colitis 被引量:1
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作者 Gert Van Assche Séverine Vermeire Paul Rutgeerts 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2008年第36期5508-5511,共4页
Although systemic steroids are highly efficacious in ulcerative colitis (UC), failure to respond to steroids still poses an important challenge to the surgeon and physician alike. Even if the life time risk of a fulmi... Although systemic steroids are highly efficacious in ulcerative colitis (UC), failure to respond to steroids still poses an important challenge to the surgeon and physician alike. Even if the life time risk of a fulminant UC flare is only 20%, this condition is potentially life threatening and should be managed in hospital. If patients fail 3 to 5 d of intravenous corticosteroids and optimal supportive care, they should be considered for any of three options: intravenous cyclosporine (2 mg/kg for 7 d, and serum level controlled), infliximab (5 mg/kg Ⅳ, 0-2-6 wk) or total colectomy. The choice between these three options is a medical- surgical decision based on clinical signs, radiological and endoscopic findings and blood analysis (CRP, serum albumin). Between 65 and 85% of patients will initially respond to cyclosporine and avoid colectomy on the short term. Over 5 years only 50% of initial responders avoid colectomy and outcomes are better in patients naive to azathioprine (bridging strategy). The data on infliximab as a medical rescue in fulminant colitis are more limited although the efficacy of this anti tumor necrosis factor (TNF) monoclonal antibody has been demonstrated in a controlled trial. Controlled data on the comparative efficacy of cyclosporine and infliximab are not available at this moment. Both drugs are immunosuppressants and are used in combination with steroids and azathioprine, which infers a risk of serious, even fatal, opportunistic infections. Therefore, patients not responding to these agents within 5-7 d should be considered for colectomy and responders should be closely monitored for infections. 展开更多
关键词 Ulcerative colitis STEROIDS CORTICOSTEROIDS AZATHIOPRINE CYCLOSPORINE INFLIXIMAB Imrnunosuppressants
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Detection of the expression of heat shock protein 70 using quantum dots as fluorescence probe in human renal carcinoma
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作者 Cai Lv Jie Zhang +2 位作者 Zhiming Bai Huan Yang Xiaobin Zhang 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2009年第3期164-167,共4页
Objective: To detect the expression of heat shock protein 70 (HSP70) in human renal carcinoma tissues and cultured ACHN cells by using quantum dots-tagged fluorescence technology and its significance. Methods: Usi... Objective: To detect the expression of heat shock protein 70 (HSP70) in human renal carcinoma tissues and cultured ACHN cells by using quantum dots-tagged fluorescence technology and its significance. Methods: Using the fluorescence property of quantum dots, indirect immunofluorescence method and immunocytochemical method were used to detect the expression of HSP70 tagged by quantum dots in renal carcinoma tissues and ACHN cells cultured in vitro. Results: Confocal fluorescence microscopy showed that HSP70 were significantly expressed in renal carcinoma tissues and ACHN cells cultured in vitro characterized by homogeneous distribution of intensive salmon pink fluorescence. Compared with FITC tagging, quantum dots tagged fluorescence had good specificity and signal to background. There was no notable quenching after excitation by quantum dots for 30 rain. Conclusion: Quantum dots can be used to label subcellular proteins and have obvious advantages compared with the traditional fluorescence methods. The quantum dots-tagged fluorescence could be applied as a new method for clinical labeling detection. 展开更多
关键词 kidney neoplasms quantum dots HSP70 heat-shock proteins ACHN cells
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