目的:观察mi R-409-3b对胃癌细胞侵袭转移的影响,探讨mi R-409-3b通过下调表皮生长因子蛋白7(epidermal growth factor like domain protein 7,EGFL7)调节胃癌侵袭和转移的具体机制.方法:通过基因芯片技术筛选出胃癌及癌旁组织差异性表...目的:观察mi R-409-3b对胃癌细胞侵袭转移的影响,探讨mi R-409-3b通过下调表皮生长因子蛋白7(epidermal growth factor like domain protein 7,EGFL7)调节胃癌侵袭和转移的具体机制.方法:通过基因芯片技术筛选出胃癌及癌旁组织差异性表达的微小RNA(micro RNA m i R N A);采用生物学信息学技术预测E G F L7调控相关m i R N A,通过对比上述结果,筛选出mi R-409-3b;进一步以mi R-4093b慢病毒及mi R-409-3b mimics过表达mi R-409-3b后,用Western blot检测胃癌细胞中的EGFL7的表达变化;采用Transwell侵袭实验及划痕实验检测mi R-409-3b慢病毒感染后细胞体外侵袭能力的变化;q RT-PCR检测80例胃癌患者癌组织和癌旁组织中mi R-409-3b的表达差异,并分析mi R-409-3b的表达与胃癌患者临床病理之间的关系.结果:基因芯片及生物信息学预测发现m i R-409-3b在胃癌组织中低表达,同时又可能调控E G F L7,双荧光素酶实验证实m i R-409-3b可以结合在E G F L7上,m i R-409-3b慢病毒及mi R-409-3b mimics过表达m i R-409-3b都能在蛋白水平下调E G F L7;m i R-409-3b家族3条m i R N A的q RT-P C R结果表明癌旁组织相对含量高于胃癌组织;Tr a n s w e l l侵袭实验结果表明:m i R-409-3b与感染空载慢病毒相比感染能显著降低胃癌细胞穿的能力.体外划痕实验的结果表明,经LV-mi R-409-3b感染空载慢病毒比BGC-823细胞的迁移能力明显升高.进一步统计结果表明,mi R-409-3b与淋巴结转移有关(P<0.05),mi R-409-3b的C/P值在无远处转移的病例组织比具有远处转移的病例组织中明显升高(P<0.05).结论:mi R-409-3b可以在转录后水平调控EGFL7的表达,从而抑制胃癌细胞的侵袭和转移.展开更多
文摘目的:观察mi R-409-3b对胃癌细胞侵袭转移的影响,探讨mi R-409-3b通过下调表皮生长因子蛋白7(epidermal growth factor like domain protein 7,EGFL7)调节胃癌侵袭和转移的具体机制.方法:通过基因芯片技术筛选出胃癌及癌旁组织差异性表达的微小RNA(micro RNA m i R N A);采用生物学信息学技术预测E G F L7调控相关m i R N A,通过对比上述结果,筛选出mi R-409-3b;进一步以mi R-4093b慢病毒及mi R-409-3b mimics过表达mi R-409-3b后,用Western blot检测胃癌细胞中的EGFL7的表达变化;采用Transwell侵袭实验及划痕实验检测mi R-409-3b慢病毒感染后细胞体外侵袭能力的变化;q RT-PCR检测80例胃癌患者癌组织和癌旁组织中mi R-409-3b的表达差异,并分析mi R-409-3b的表达与胃癌患者临床病理之间的关系.结果:基因芯片及生物信息学预测发现m i R-409-3b在胃癌组织中低表达,同时又可能调控E G F L7,双荧光素酶实验证实m i R-409-3b可以结合在E G F L7上,m i R-409-3b慢病毒及mi R-409-3b mimics过表达m i R-409-3b都能在蛋白水平下调E G F L7;m i R-409-3b家族3条m i R N A的q RT-P C R结果表明癌旁组织相对含量高于胃癌组织;Tr a n s w e l l侵袭实验结果表明:m i R-409-3b与感染空载慢病毒相比感染能显著降低胃癌细胞穿的能力.体外划痕实验的结果表明,经LV-mi R-409-3b感染空载慢病毒比BGC-823细胞的迁移能力明显升高.进一步统计结果表明,mi R-409-3b与淋巴结转移有关(P<0.05),mi R-409-3b的C/P值在无远处转移的病例组织比具有远处转移的病例组织中明显升高(P<0.05).结论:mi R-409-3b可以在转录后水平调控EGFL7的表达,从而抑制胃癌细胞的侵袭和转移.
文摘基于最近发展的分子碎片共轭帽(molecular fractionation with conjugate caps,MFCC)方法,表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)与其抑制剂的相互作用能得以用完整的量子力学来计算,主要包括上市的Iressa[第一代美国食品及药物管理局(Food and Drug Administration,FDA)通过的药物]和4-苯胺基喹唑啉类抑制剂Tarceva(已上市)、CI-1033与EKI-785。对EGFR的完整体系(超过5 000个原子)与4-苯胺基喹唑啉类抑制剂之间的结合作用采用了量子力学计算方法。结合体系的量子能量计算,用Hartree-Fock与密度泛函理论(density functional theory,DFT)2种方法,EGFR与Tarceva之间的相互作用能基于它们两者复合物的晶体结构得到,而其他抑制剂与EGFR的相互作用能则通过分子对接软件预测的构型进行计算。利用MFCC方法,获得了量子相互作用能谱,清楚地给出了EGFR每个氨基酸片段与4-苯胺基喹唑啉类抑制剂之间的单个相互作用能。量子研究发现,4-苯胺基喹唑啉类抑制剂与EGFR的结合通过1个氢键和静电相互作用。Iressa、Tarceva、CI-1033、EKI-785与EGFR的结合能计算值分别为-40.23、-53.09、-33.92、-31.47kcal/mol(1cal=4.184J)。研究表明,Tarceva比第一代FDA通过的药物Iressa有更强的结合能力,而CI-1033、EKI-785则表现出一般的结合作用,另外,与MFCC计算的相互作用能谱相比,有一些相互作用在力场作用能谱中被明显高估。