白色类诺卡氏菌的分离鉴定及其抗菌活性初探

该研究对白色类诺卡氏菌(Nocardioides albus)进行分离鉴定,并通过温度、紫外、酸碱处理,以绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、枯草杆菌(Bacillus subtilis)、暗黑微绿链霉菌(Streptomyces atrovirens)为指示菌,用琼脂打孔法进行抑菌实验;用药敏片法进行药敏实验,初步探讨分离菌株的药物敏感性以及抑菌性。结果表明,紫外作用30 min及温度对其抑菌性影响不大;强酸、强碱环境中白色类诺卡氏菌基本没有抑菌活性。白色类诺卡氏菌对抗生素较为敏感,药敏性较高。

来自南极洲类诺卡氏菌(Nocardioides sp.)InS609-2的全基因组序列分析

【背景】类诺卡氏菌(Nocardioides sp.)InS609-2是一株分离自南极洲罗斯海特拉诺瓦湾的恩克斯堡岛土壤中潜在的极地放线菌新种。尚无研究报道Nocardioides sp.InS609-2的全基因组序列,缺少对其功能基因、代谢产物合成途径及比较基因组学等的研究。【目的】解析Nocardioides sp.InS609-2的基因组序列信息,以深入挖掘次级代谢产物基因资源。【方法】利用Illumina HiSeq高通量测序平台对菌株InS609-2进行全基因组完成图测序,使用相关软件对测序数据进行基因组组装、基因预测和功能注释、预测次级代谢产物合成基因簇和共线性分析等。【结果】基因组最后得到的总长度为4524052 bp,G+C含量为69.42%,预测到4656个基因、56个tRNA和6个rRNA。根据Nocardioides sp.InS609-2的全基因组测序结果,分别有3761、3052、1767、4134和2725个基因在COG、GO、KEGG、NR和Swiss-Prot数据库中提取到注释信息。同时,还预测得到19个次级代谢产物合成基因簇。基因组测序数据提交至NCBI获得GenBank登录号为CP060034。Nocardioides sp.InS609-2与N.dokdonensis CP015079、N.yefusunii CP034929、N.euryhalodurans CP038267、N.seonyuensis CP038436、N.daphniae CP038462和N.okcheonensis CP087710这6株基因组同源性比较高的类诺卡氏菌进行共线性分析和蛋白聚类分类分析,得到的结果是7个基因组间既有保守性又各自有独特性。七个基因组共有44个蛋白聚类簇。最后进行16S rRNA基因系统发育树、泛基因组、core基因组和基因组进化树分析,进一步挖掘了Nocardioidessp.InS609-2的基因组信息。【结论】从基因组层面上预测了Nocardioides sp.InS609-2的次级代谢产物的生物合成基因簇,为InS609-2的后续相关研究提供了参考信息,具有重要意义。

一种由白色类诺卡放线菌产生的新的巴卡亭ⅢC—10脱乙酰酶

紫杉醇及多烯紫杉醇是目前临床上最重要的抗癌药物，而10-DAB是半合成紫杉醇及多烯紫杉醇的前体。通过TLC监测及HPLC-MS证实，发现了一种由白色类诺卡氏菌产生的、新的巴卡亭ⅢC-10脱乙酰酶，该酶能催化巴卡亭Ⅲ生成10-DAB，酶的最适pH值和对甲醇的耐受性方面不同于已报道的巴卡亭ⅢC-10脱乙酰酶，它具有更强的底物专一性和更强的耐甲醇能力，酶的Km值为1．52mmol／L，Vmax为2．59×10^-7mmol／L·s。

大麻微生物脱胶特异放线菌菌株的筛选与鉴定

为探讨大麻根部土壤中是否存在具有脱胶功能的放线菌,采用高氏一号培养基分离纯化大麻根部土壤中的放线菌,利用平板透明圈法筛选具有脱胶功能的菌株,通过形态特征、生理生化特性及分子生物手段鉴定菌种。结果表明:共分离纯化得到41株放线菌,其中菌株DM182具有较强的脱胶能力,其透明圈直径可达3.78 cm,根据菌株DM182的形态、生理生化特性与16S rDNA序列分析将其初步鉴定为白色类诺卡氏菌(Nocardioides albus)。因此,类诺卡氏属(Nocardioides)放线菌具有广阔的应用前景,而白色类诺卡氏菌N.albus在本地区首次筛选得到,具有进一步研究开发的价值。

施用猪粪日光温室土壤抗生素风险及微生物群落特征——以河北永清县日光温室为例

随着设施种植业的迅速发展,畜禽粪污有机肥在设施种植中得到广泛应用,畜禽粪污是设施种植土壤中抗生素的主要来源之一。土壤中的抗生素可被农作物吸收,并通过食物链传递,最终威胁人类健康。以设施蔬菜种植大县河北省永清县施用猪粪有机肥的日光温室为研究对象,研究畜禽粪污有机肥抗生素残留对日光温室土壤抗生素生态风险和生物多样性的影响。通过测定猪粪、日光温室土壤中抗生素的种类及含量,采用风险商值法评价各种抗生素的生态风险;采用宏基因组方法测定微生物群落特征,探究抗生素残留对土壤微生物多样性的影响。结果表明:(1)猪粪和日光温室土壤样品中共检出7种典型兽用抗生素分别为磺胺二甲基嘧啶(SM2)、诺氟沙星(NOR)、环丙沙星(CIP)、恩诺沙星(ENR)、四环素(TC)、土霉素(OTC)、金霉素(CTC)。(2)猪粪中恩诺沙星和金霉素的浓度最大,风险商值(RQ)分别为28.26和1.23,均大于1.0,都存在生态高风险。施用猪粪日光温室土壤中恩诺沙星、土霉素和金霉素的浓度最大,RQ值均在0.1~1.0之间,均存在中等生态风险。(3)施用猪粪有机肥对于日光温室土壤中微生物群落结构具有一定影响,改变了微生物优势菌群的丰度排名,施用猪粪的土壤中相对丰度排名第四的优势菌门由奇古菌门变为绿弯菌门。研究显示,施用猪粪引起可产生抗生素的类诺卡氏菌属(Nocardioides)相对丰度增加,达到空白对照的2倍以上。