全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL

以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响。全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(q MRR9、q GL2、q GL10、q GW1、q GLWR1和q GLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL。此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效。结合前人研究结果,我们推论q SW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色。研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息。

滇一型粳稻雄性不育系细胞质基因组的溯源分析

滇一型和BT型是杂交粳稻生产应用中仅有的两类不育系,到目前为止,对滇一型粳稻雄性不育细胞质的来源并不清楚。为明确滇一型粳稻细胞质雄性不育基因的来源,本研究从滇一型不育系中克隆了细胞质雄性不育基因orf79D1,发现它与BT型不育系中orf79基因序列完全一致;诱导ORF79D1蛋白在大肠杆菌中表达,发现其对细菌的生长繁殖有明显的抑制作用。利用我们开发的滇一型细胞质雄性不育基因特异的功能分子标记,对来源于云南不同地域的53份云南地方籼稻种质资源的分析发现,有22份资源具有滇一型细胞质雄性不育基因,经测序分析发现22份种质中的orf79D1基因序列完全一致。说明具有orf79D1不育基因的细胞质广泛存在于云南的地方籼稻种质资源中,滇一型粳稻雄性不育细胞质应来源于云南地方籼稻种质。本研究为进一步探究滇一型粳稻雄性不育细胞质特性奠定了基础。