不同操作平台、染料间高分辨率熔解曲线分析技术检测粪便基因突变的性能差异

目的探讨在不同操作平台、染料间高分辨率熔解曲线分析(HRM)技术检测粪便基因突变的性能差异。方法收集合格的粪便125份,其中大肠癌40份,晚期腺瘤35份,正常对照50份,在LightCycler 480与Rotor-Gene 6000平台设备上,分别使用Resolight或Eva Green染料,检测K-ras基因突变率的差异,所有样品均行测序。结果测序发现,大肠癌组、晚期腺瘤组、正常对照组K-ras基因突变率分别是40%、31.4%、0%。在LightCycler 480平台,用Resolight/Eva Green染料突变检出率分别为40%/45%、31.4%/34.2%、0%/0%。在Rotor-Gene 6000平台,用Resolight/Eva Green染料突变检出率分别为42.5%/47.5%、34.2%/37.1%、0%/0%。在各组中,不同操作平台、染料间突变检出率差异无统计学意义(P>0.05)。HRM检测粪便基因突变敏感度达100%。结论 HRM在不同操作平台、染料间的突变检出率差异无显著性。