不同品种马驹粪便菌群多样性及丰度的分析研究

本试验旨在研究3个品种(伊犁马、哈萨克马和纯血马)断奶马驹粪便菌群多样性及丰度的差异,为不同品种断奶马驹肠道微生物多样性的深入研究提供基础数据。试验选择伊犁马、哈萨克马和纯血马断奶马驹15匹,平均体重分别为(145.28±1.69)、(126.75±5.58) kg和(184.65±9.54) kg,以品种为单位,分为3个组进行试验。断奶前同一品种马驹与母马一起饲养,通过直肠采样法采集马驹粪便样品,采用高通量测序技术测定分析马驹粪便菌群多样性。结果显示:(1)哈萨克马粪便细菌observed_species、goods_coverage、PD_whole_tree、ACE和Chao1结果极显著高于伊犁马和纯血马马驹(P <0.01),纯血马马驹PD_whole_tree指标极显著高于伊犁马马驹,提高了3.99%(P <0.01);(2)门水平前10的物种中3个品种相同的菌有7种,分别是厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、疣微菌门、放线菌门、软壁菌门和螺旋体门,伊犁马和纯血马马驹粪便厚壁菌门丰度比哈萨克马提高63.50%和70.37%,差异极显著(P <0.01);拟杆菌门丰度各品种之间差异极显著(P <0.01),哈萨克马>纯血马>伊犁马;(3)科水平马驹粪便前10的物种中,相同的菌有瘤胃球菌科、毛螺旋菌科和克里斯滕森菌科;(4)属水平前10的物种中3个品种相同的细菌有链球菌属。因此,在本研究条件下,3个品种马驹中哈萨克马粪便细菌多样性显著性最高;厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、疣微菌门、放线菌门等是3个品种门水平相同的优势菌;在科水平和属水平3个品种马驹细菌组成和丰度差异较大。