长牡蛎糖原磷酸化酶基因SNPs与生长性状和糖原含量的相关性分析

为研究糖原磷酸化酶基因多态性与长牡蛎(Crassostrea gigas)生长和糖原含量的相关性,本研究对长牡蛎糖原磷酸化酶基因(Cg-GPH)编码区单核苷酸多态性(SNPs)与来自5个家系322个长牡蛎个体的生长性状(包括壳高、壳长、壳宽、总体质量以及软体部质量)和糖原含量进行了关联分析。结果表明,在1 940 bp的长牡蛎糖原磷酸化酶基因中共检测到82个SNPs位点,其中63个SNPs位点位于外显子区域,1个SNPs位点位于5′-UTR区,18个SNPs位点位于3′-UTR区,编码区SNPs平均密度为1/25 bp;5个SNPs位点与生长性状存在显著相关(P<0.05),未检测到与糖原含量相关SNPs。根据以上5个SNPs位点共构建得到6个SNP单倍型,其中,Cg-GPH基因的H6(CTGAT)单倍型在总体质量性状方面均显著高于其他5种单倍型(P<0.05),表明H6单倍型可能是对长牡蛎体质量增加最有利的单倍型。研究结果为今后长牡蛎生长性状的遗传改良提供了基础资料。

低温胁迫对草菇菌丝体糖原磷酸化酶基因表达的影响

在0℃低温胁迫下比较低温敏感型草菇(Volvariella volvacea)菌株V23和耐低温型菌株VH3糖原磷酸化酶(glycogen phosphorylase)pyg基因的表达情况。以α-微管蛋白为内参基因,采用实时荧光定量PCR技术测定pyg基因的表达,结果表明:低温处理4h时,V23的pyg基因相对表达量仅为0h的0.49倍,低温处理6h时有所回升,但仍低于处理0h的水平。VH3的pyg基因相对表达量从低温处理2h时急剧下降,至低温处理8h时达到最低值,仅为0h的0.28倍。随着低温处理时间的延长,pyg基因的相对表达量在V23和VH3中均呈下降趋势,相同的低温处理时间下,该基因在菌株V23中的下降幅度小于VH3中。