碳水化合物的网络工具和数据库

生物信息学在生命科学领域发挥着很大的作用,但是生物信息学的工具不完全适用于糖生物学,糖生物学的网络工具和数据库应运而生。作者依据糖生物学的生物信息资源和数据库,搜集了用于解析碳水化合物结构常用的网络工具和数据库,按分类进行了分析。分析结果表明:将碳水化合物命名工具及数据库、构型分析工具及数据库、三维结构模型数据库整合起来用于解析碳水化合物,可以简化分析工作,并可获得可靠的数据信息。

糖类的生物信息学资源

生物信息学在推动遗传学和蛋白质科学的研究领域中,已发挥了举足轻重的作用.相比较而言,糖科学产生的信息还比较有限,随着人们对糖类分子的关注,糖生物学的发展也出现新的契机,其信息正在飞速地增长.对已经获得的糖类相关知识进行系统整合就显得越来越有必要,许多研究型数据库和免费工具已应运而生,并且数目在不断扩大,正成为科学工作者非常便利的工具.但到目前为止,许多数据库或者网络预测工具在文献中很少提及或难以找到,给研究者带来了不少的麻烦.部分原因是数据库资源本身数据不断在更新,人机界面也变得越方便和人性化,另外就是人们对于这些新型的研究工具了解较少.这篇综述介绍了目前网络上最常用的糖类生物信息学资源,包括糖的一级结构,分析测试数据、构象,酶,凝集素,糖蛋白等方面的各种数据库.