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基于系统药理学结合LC-MS/MS技术探讨温性经筋通贴膏治疗类风湿性关节炎的药效物质基础与作用特点 被引量:1
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作者 苏安宇 黄伟斌 +7 位作者 莫静媛 张梓煊 谢询 黄晓冰 钟碧莲 张永萍 王利胜 王春怡 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期706-718,共13页
目的通过液相色谱-质谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术结合系统药理学研究温性经筋通贴膏治疗类风湿性关节炎的药效物质基础与作用特点。方法通过LC-MS/MS技术结合文献检索获取温性经筋通贴膏活性成分信息,使用Swiss Target Prediction平台进... 目的通过液相色谱-质谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术结合系统药理学研究温性经筋通贴膏治疗类风湿性关节炎的药效物质基础与作用特点。方法通过LC-MS/MS技术结合文献检索获取温性经筋通贴膏活性成分信息,使用Swiss Target Prediction平台进行作用靶点预测;利用GeneCards、DrugBank和OMIM数据库检索与类风湿性关节炎相关的疾病靶点并与活性成分作用靶点进行映射取交集,通过Cytoscape软件构建“活性成分-有效靶点”网络;将共同靶点导入STRING数据库构建蛋白互作网络;应用Metascape数据库进行GO功能及KEGG通路富集分析;采用AutoDock软件进行关键成分与有效靶点的分子对接研究。结果通过应用LC-MS/MS技术从温性经筋通贴膏中共鉴别出142个活性成分,经检索相关文献补充活性成分至174个,与类风湿性关节炎交集靶点175个;预测温性经筋通贴膏可能通过小檗碱、新补骨脂异黄酮、盐酸巴马汀等主要成分,作用于TNF、IL6、AKT1等关键靶点,调控PI3K/Akt1、JAK/STAT、MAPK等信号通路发挥免疫调节与抗炎镇痛作用;在1152组分子对接验证中,结合能小于-5.0 kcal·mol^(-1)的占94%、小于-7.0 kcal·mol^(-1)的占51%,表明所筛选的潜在活性成分与核心靶点之间具有较好的结合亲和力。结论该研究预测了温性经筋通贴膏治疗类风湿性关节炎的药效物质基础与作用特点,为进一步启发其临床应用及质量控制提供了理论基础。 展开更多
关键词 温性经筋通贴膏 类风湿性关节炎 LC-MS/MS 系统药理 药效物质基础 作用特点
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基于系统药理学和分子对接探讨浙贝母-瓜蒌配伍调控慢性阻塞性肺病并发心脏衰竭的作用机制
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作者 方孟香 程成 +6 位作者 曹铭晨 任炜 杨智威 李文静 辛晓玮 刘月芬 徐龙 《山东科学》 CAS 2024年第4期45-55,共11页
基于GEO数据库挖掘慢性阻塞性肺疾病(COPD)和心力衰竭(HF)关联靶点,检索浙贝母、瓜蒌化学成分及靶点,以获得其调控COPD并发HF潜在靶点,挖掘靶点功能及通路注释分析,构建组织特异性蛋白相互作用(PPI)网络。浙贝母-瓜蒌影响COPD并发HF进... 基于GEO数据库挖掘慢性阻塞性肺疾病(COPD)和心力衰竭(HF)关联靶点,检索浙贝母、瓜蒌化学成分及靶点,以获得其调控COPD并发HF潜在靶点,挖掘靶点功能及通路注释分析,构建组织特异性蛋白相互作用(PPI)网络。浙贝母-瓜蒌影响COPD并发HF进展共涉及靶点227个,包括表达上调基因153个,表达下调基因74个;网络拓扑学分析显示PPI网络平均介数为0.4,平均度值为1.83,关键靶点包括RPS23、SNU13、NOL6、ELAVL1、NCL等;细胞组分定位于内膜系统、核内体和细胞外囊泡;生物学过程涉及囊泡介导的运输、基于微管的运动、细胞内蛋白质运输等;信号通路涉及MAPK信号传导途径;MCODE分析发现Cluster 1涉及TKT、ENO1、NCL、KIF1B等,参与调控驱动蛋白、雌激素的高尔基体运输;Cluster 2涉及SIN3B、PHF20、CTBP1、XPNPEP1等,参与调控组蛋白反应;心耳、左心室、肺的组织特异性PPI网络提示浙贝母-瓜蒌配伍可能通过调控ELAVL1-ENO1-NCL轴影响COPD并发HF进展;分子对接表明其“宽胸散结”主要活性成分瓜蒌酸、“化痰散结”主要成分贝母新碱与ELAVL1、ENO1、NCL蛋白质靶标的结合高度稳定,且贝母新碱与靶蛋白结合力强于瓜蒌酸,体现两者配伍后先治肺再调心,相须为用以实现心肺共治的作用特点。 展开更多
关键词 浙贝母 瓜蒌 慢性阻塞性肺病 心脏衰竭 系统药理
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基于系统药理学的柴胡防治非酒精性脂肪肝作用机制研究
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作者 祝亚梅 史艳 +3 位作者 蔡燕子 魏彦明 王桂荣 袁子文 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期19-28,共10页
【目的】探究柴胡对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的防治作用及机制。【方法】借助TCMSP数据库及查阅文献获取柴胡化学成分及其作用靶点,并利用Gene Cards、OMIM等数据库获取NAFLD疾病靶点。筛选二者间共有靶点进行蛋白质互作、KEGG、GO富... 【目的】探究柴胡对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的防治作用及机制。【方法】借助TCMSP数据库及查阅文献获取柴胡化学成分及其作用靶点,并利用Gene Cards、OMIM等数据库获取NAFLD疾病靶点。筛选二者间共有靶点进行蛋白质互作、KEGG、GO富集与分子对接分析,以挖掘柴胡防治NAFLD潜在活性成分及作用机制。最后,通过高脂饲料复合高糖饮水建立NAFLD小鼠模型,验证柴胡治疗效果及作用机制。【结果】柴胡可通过18个潜在活性成分直接作用于99个靶点来防治NAFLD,其中槲皮素、山奈酚、异鼠李素为其核心活性成分,AKT1、TNF、ESR1为其核心作用靶点。富集分析表明,柴胡可能通过干预PI3K-AKT、MAPK及TNF等信号通路来防治NAFLD。动物试验结果表明,柴胡治疗能显著降低NAFLD小鼠血清AST、ALT水平,改善NAFLD小鼠肝脏脂肪变性,并回调PI3K-AKT通路中AKT和MAPK通路中SREBP-1在肝脏组织中的表达。【结论】柴胡可有效的防治NAFLD,其作用机制与调控PI3K-AKT和MAPK信号通路密切相关。 展开更多
关键词 柴胡 系统药理 非酒精性脂肪肝 分子对接 PI3K-AKT信号通路
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基于系统药理学探索中药生脉饮有效成分的药理作用机制
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作者 王锻 杨红 《临床医学研究与实践》 2024年第13期44-47,共4页
目的基于系统药理学方法探究中药生脉饮活性成分、靶点及疾病之间的复杂关系。方法在中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)数据库,以口服生物利用度(OB)(人参和五味子OB≥60%,麦冬OB≥45%)和类药性(DL)≥0.1筛选生脉饮的活性成分、预测... 目的基于系统药理学方法探究中药生脉饮活性成分、靶点及疾病之间的复杂关系。方法在中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)数据库,以口服生物利用度(OB)(人参和五味子OB≥60%,麦冬OB≥45%)和类药性(DL)≥0.1筛选生脉饮的活性成分、预测作用靶点,构建活性成分-靶点-疾病网络。结果筛选出活性成分17个,其中人参11个成分,麦冬2个成分,五味子4个成分。共获得靶点79个,靶点作用的疾病13种。网络图中活性成分和靶点共有176条边相连,即平均每个活性成分对应约10.3个靶点,平均每个靶点与4.6个活性成分相关联。靶点和疾病共235条边相连。结论本研究直观地构建了生脉饮活性成分、靶点蛋白和疾病的相互作用,从而揭示生脉饮在多种临床疾病中的功效,为进一步研究生脉饮作用机制提供理论依据。 展开更多
关键词 生脉饮 系统药理 活性成分 活性成分-靶点-疾病网络
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基于代谢组学和系统药理学探究Q方治疗冠心病的作用机制
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作者 王萌 李翠华 曹朵 《齐齐哈尔医学院学报》 2024年第5期407-413,共7页
目的Q方(保密配方)由在心血管疾病方面均有治疗作用的七味中药组成。本研究旨在探讨其靶点及作用机制。方法本研究基于代谢组学和系统药理学,细胞实验和代谢组学探究Q方作用机制。结果Q方通过调节相关代谢通路从而缓解缺血缺氧诱导的心... 目的Q方(保密配方)由在心血管疾病方面均有治疗作用的七味中药组成。本研究旨在探讨其靶点及作用机制。方法本研究基于代谢组学和系统药理学,细胞实验和代谢组学探究Q方作用机制。结果Q方通过调节相关代谢通路从而缓解缺血缺氧诱导的心肌缺血;Q方中的活性靶点富集于PI3K/Akt、FoxO、HIF-1、TNF、NF-κB及VEGF通路,可以调节细胞增殖和细胞凋亡,也可以影响PPAR、Akt和NF-κB的活性以及氨基酸代谢和脂肪酸代谢,从而发挥治疗冠心病的作用。结论Q方可以缓解缺血缺氧诱导的H9C2细胞心肌缺血,Q方中的潜在活性物质通过调节PI3K/Akt、NF-κB和VEGF信号通路发挥治疗冠心病的作用。本研究为Q方治疗冠心病提供了依据,并且为Q方临床应用与治疗冠心病奠定了基础。 展开更多
关键词 冠心病 Q方 系统药理 代谢组学
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基于文献和系统药理学的黄连解毒汤治疗溃疡性结肠炎药效物质基础及其作用机制研究 被引量:1
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作者 史艳 祝亚梅 +4 位作者 蔡燕子 华永丽 纪鹏 魏彦明 袁子文 《中国野生植物资源》 CSCD 2023年第6期1-8,共8页
目的:探讨黄连解毒汤(HLJDD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的药效物质基础及其作用机制。方法:通过查阅文献,检索TCMSP、DrugBank、OMIM等数据库筛选HLJDD潜在活性成分及其作用靶点和UC疾病靶点,构建相关网络并借助拓扑学原理筛选HLJDD治疗UC的... 目的:探讨黄连解毒汤(HLJDD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的药效物质基础及其作用机制。方法:通过查阅文献,检索TCMSP、DrugBank、OMIM等数据库筛选HLJDD潜在活性成分及其作用靶点和UC疾病靶点,构建相关网络并借助拓扑学原理筛选HLJDD治疗UC的核心活性成分及核心作用靶点,并进行富集分析和分子对接验证。结果:获得HLJDD治疗UC核心活性成分6个(京尼平苷、小檗碱、巴马汀等),核心作用靶点360个。富集分析表明,HLJDD主要通过作用于NTRK1、CUL3、TP53等核心靶点,干预NF-κB、MAPK、Hippo等信号通路,进而调控细胞周期、DNA修复、细胞凋亡等生物过程来发挥治疗作用。结论:此研究从整体角度揭示了HLJDD治疗UC的潜在药效物质基础及其作用机制,可为HLJDD复方二次开发及抗溃疡新药研发奠定基础。 展开更多
关键词 黄连解毒汤 溃疡性结肠炎 文献研究 系统药理 药效物质基础 作用机制
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基于系统药理学探究玉屏风散治疗反复呼吸道感染的作用机制 被引量:3
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作者 邱玺瑞 许思妍 +3 位作者 晏扬天 卢阳 徐丁林 纪建建 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2023年第2期580-594,共15页
目的本文利用系统药理学方法结合体内实验探究玉屏风散治疗反复呼吸道感染(Recurrent respiratory tract infection,RRTI)的作用机制。方法通过多个数据库检索结合文献补充建立玉屏风散活性成分库,利用TCMSP数据库校正并筛选;利用已上... 目的本文利用系统药理学方法结合体内实验探究玉屏风散治疗反复呼吸道感染(Recurrent respiratory tract infection,RRTI)的作用机制。方法通过多个数据库检索结合文献补充建立玉屏风散活性成分库,利用TCMSP数据库校正并筛选;利用已上市药物在Swiss Target Prediction中预测治疗RRTI的潜在靶点;采用Schr?dinger软件将潜在活性成分与预测的疾病靶点进行分子对接研究,从而建立“药效分子-靶点蛋白”对应关系;利用Cytoscape软件构建“活性成分-疾病靶点”网络模型;借助CluoGO插件实行生物学通路(KEGG)富集分析;利用地塞米松结合呼吸道合胞病毒感染(Respiratory syncytial virus,RSV)构建RRTI小鼠模型,玉屏风散干预后,计算脾指数,流式检测脾脏免疫细胞亚群比例,评估肺组织炎症指征及肺部病理,RT-qPCR法检测TNF-αmRNA表达水平,免疫荧光法检测NOS2、HIF-1α、MMP1、TNF-α表达水平。结果共检索到529个活性化合物,筛选后得46个主要活性成分;预测结果表明,打分靠前的10种核心成分:异鼠李素、叶酸、5’-hydroxyiso-muronulatol-2’,5’-Di-O-glucoside等,主要作用于核心靶点HLA-DRB1、ERBB2、NOS2、MMP1和ALB,调控HIF-1信号通路(HIF-1 signaling pathway)、甲型流感病毒(Influenza A)等相关信号通路;体内实验显示,玉屏风散可有效减轻RRTI小鼠肺部病理损伤及炎症反应,下调NOS2、HIF-1α、TNF-α的表达,提高了CD4+T淋巴细胞比例;分子对接结果证实玉屏风散的核心成分与靶点蛋白MMP1、HLA-DRB1等具有较好的结合活性。结论玉屏风散治疗RRTI具有多成分、多靶点、多通路的特点,MMP1、HLA-DRB1、NOS2等可能为其核心治疗靶点。 展开更多
关键词 玉屏风散 反复呼吸道感染 系统药理 分子对接 体内实验
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基于系统药理学解析林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳的作用机制
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作者 赵晓昂 王云 +1 位作者 李友明 田纪祥 《中南药学》 2023年第9期2354-2361,共8页
目的初步探讨林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳的物质基础和作用机制。方法采用组合效应系数方法评估林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳协同增效作用;通过小鼠负重游泳实验评估林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳的功效,并测定与疲劳相关的多... 目的初步探讨林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳的物质基础和作用机制。方法采用组合效应系数方法评估林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳协同增效作用;通过小鼠负重游泳实验评估林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳的功效,并测定与疲劳相关的多个体内指标,探索抗疲劳可能的作用机制;通过液相-质谱联用主要成分和入血成分分析,结合网络药理学初步解析林下山参联合米糠脂肪烷醇抗疲劳的可能作用机制与药效物质基础。结果林下山参联合米糠脂肪烷醇的组合效应系数在0.6~0.8,具有中等协同增效作用;林下山参联合米糠脂肪烷醇可以延长小鼠力竭游泳的时间,降低血浆中尿素氮和乳酸的含量和脑组织中5-羟色胺的含量,升高肝糖原和肌糖原的储备水平。成分分析表明,共有9个主要原形成分吸收入血。进一步通过网络药理学分析发现,其主要通过干预Serotonergic synapse通路发挥抗疲劳功效,4个入血的人参皂苷及三十二碳脂肪烷醇、三十碳脂肪烷醇、二十八碳脂肪烷醇可能是抗疲劳的药效成分。结论林下山参联合米糠脂肪烷醇可以通过调控多靶点、多途径实现抗疲劳功效,为两者的进一步开发和应用提供依据。 展开更多
关键词 林下山参 米糠脂肪烷醇 抗疲劳 系统药理 作用机制
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基于系统药理学逍遥散治疗抑郁症的分子机制初探 被引量:6
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作者 沈霞 裴丽珊 +3 位作者 高静 张岗 许浚 彭亮 《中南药学》 CAS 2019年第9期1476-1484,共9页
目的从分子角度揭示逍遥散治疗抑郁症的分子机制,初步揭示中药复方治疗的科学内涵。方法运用系统药理学理论和方法,对中药成分、靶点等生物数据进行挖掘,构建"药物-靶点-疾病"网络,并对配伍机制进行分析。结果柴胡通过作用于... 目的从分子角度揭示逍遥散治疗抑郁症的分子机制,初步揭示中药复方治疗的科学内涵。方法运用系统药理学理论和方法,对中药成分、靶点等生物数据进行挖掘,构建"药物-靶点-疾病"网络,并对配伍机制进行分析。结果柴胡通过作用于MAO受体和SLC6A受体,治疗抑郁症主要症状;当归、白芍通过靶点CYP系列酶、AKRS超家族、ADORA受体,主要作用于食欲不振、全身乏力等兼症;茯苓、白术、甘草主要作用于AKRS超家族、ADORA受体,生姜、薄荷则作用于靶点SLC6A受体,它们协同治疗失眠等临床表现;甘草调和药性,作为使药之用。结论通过系统药理学模型的构建,从分子层面系统阐释逍遥散中诸药分别作用于抑郁症及其临床症状的机制,体现出中药复方协同发挥治疗抑郁症的作用。为中药复方分子机制的阐明及其质量标记物的遴选提供研究思路及方法。 展开更多
关键词 系统药理 抑郁症 逍遥散 分子机制 协同增效
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佛手散治疗血管性痴呆的系统药理学作用机制研究 被引量:6
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作者 陈苑 罗云霞 +3 位作者 代朝 蔡伟武 王奇 王宏 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期54-63,共10页
目的探索佛手散(当归、川考组成)治疗血管性痴呆(Vascular dementia,VaD)的药效物质基础及其作用机制。方法采用网络药理学策略与方法,首先构建佛手散化学成分数据库,经ADME筛选潜在的活性成分再应用计算机模型进行靶标预测,对预测的靶... 目的探索佛手散(当归、川考组成)治疗血管性痴呆(Vascular dementia,VaD)的药效物质基础及其作用机制。方法采用网络药理学策略与方法,首先构建佛手散化学成分数据库,经ADME筛选潜在的活性成分再应用计算机模型进行靶标预测,对预测的靶标进行基因本体论以及多层次数据整合网络分析,从而全面深入地揭示佛手散治疗VaD的作用机制。结果共收集了佛手散的296个化学成分,经过ADME筛选获得56个活性化合物。经靶标预测,得到222个蛋白靶标,基因本体论可知预测靶点主要在质膜、内质网等部位发挥氧化还原酶活性、催化活性等为代表的分子功能,从而参与能量代谢等生物过程。网络整合分析可知,佛手散主要作用于3个VaD相关的病理模块:突触可塑性调节模块、钙稳态调节模块以及G蛋白偶联受体模块。结论系统药理学方法可高效、全面地探索佛手散治疗血管性痴呆的作用机制。 展开更多
关键词 系统药理 佛手散 血管性痴呆 作用机制
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基于系统药理学的茵陈作用机制研究 被引量:36
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作者 陈国铭 汤顺莉 +7 位作者 邝梓君 黄雁 赵金龙 於菁雯 陈子茵 林洪荣 黄楚瑶 许华 《中国药房》 CAS 北大核心 2018年第10期1312-1319,共8页
目的:探讨茵陈可能的药理作用机制,为其进一步开发利用提供参考。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选茵陈的有效成分和相关靶标蛋白;运用Cytoscape 3.5.1软件构建茵陈有效化合物-靶标蛋白可视化网络,并进行拓扑学分析;借... 目的:探讨茵陈可能的药理作用机制,为其进一步开发利用提供参考。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选茵陈的有效成分和相关靶标蛋白;运用Cytoscape 3.5.1软件构建茵陈有效化合物-靶标蛋白可视化网络,并进行拓扑学分析;借助STRING数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析;通过DAVID生物信息学资源数据库对靶标蛋白编码基因进行KEGG通路富集分析。结果:共筛选出茵陈有效化合物13个,靶标蛋白189个,KEGG富集通路34条。槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素、Artepillin C等是主要有效化合物,前列腺素G/H合成酶2(PTGS2)、热休克蛋白90(HSP90)、二肽基肽酶Ⅳ、蛋白激酶A催化亚基Cα等是主要靶标蛋白;转录因子AP-1(JUN)、细胞肿瘤抗原p53在PPI网络中发挥了关键作用;靶标蛋白编码基因主要富集在肿瘤坏死因子α(TNF-α)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶(P13K/Akt)信号通路、T细胞受体信号通路、甲状腺激素信号通路、凋亡信号通路等通路上。结论:茵陈中的槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素等化合物可能通过TNF-α信号通路、HIF-1信号通路、PI3K/Akt信号通路等作用于PTGS2、HSP90、JUN等靶标蛋白,进而发挥其抗炎、抗肿瘤等药理作用。 展开更多
关键词 系统药理 茵陈 有效化合物 靶标蛋白 信号通路 药理作用
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基于系统药理学的骨碎补治疗骨质疏松的通路及靶标探讨 被引量:4
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作者 赵金龙 曾令烽 +5 位作者 赵第 潘建科 韩燕鸿 梁桂洪 李嘉晖 刘军 《天津中医药》 CAS 2019年第11期1126-1132,共7页
[目的]通过系统药理学相关生物信息学分析方法探讨中药材骨碎补治疗骨质疏松的的生物学通路及靶标。[方法]通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库提取骨碎补的活性成分和有关的靶标蛋白。通过运用软件Cytoscape 3.5.1构筑骨碎补有效... [目的]通过系统药理学相关生物信息学分析方法探讨中药材骨碎补治疗骨质疏松的的生物学通路及靶标。[方法]通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库提取骨碎补的活性成分和有关的靶标蛋白。通过运用软件Cytoscape 3.5.1构筑骨碎补有效成分与靶标关系网络进行拓扑学分析。使用STRING数据库进行蛋白之间相互作用(PPI)网络的构筑与分析。借助David数据库进行KEGG通路功能富集分析。[结果]表明骨碎补的核心化合物有柚皮苷、圣草酚、山奈酚等,重要的靶标有前列腺素G/H合成酶2(Prostaglandin G/H synthase 2)、Heat shock protein HSP 90、Caspase-3等,骨碎补发挥生物学效应作用于骨质疏松症的关键蛋白主要有JUN、TP53、MAPK1、白介素-6(IL-6)、雌激素受体1(ESR1)等。KEGG结果表明骨碎补主要作用于TNF signaling pathway、T cell receptor signaling pathway、HIF-1 signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway、Estrogen signaling pathway等相关信号通路。[结论]骨碎补主要通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥抗骨质疏松的生物学效用。 展开更多
关键词 骨碎补 骨质疏松 系统药理 通路 靶标 机制
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基于系统药理学探究新型冠状病毒肺炎中医病机 被引量:4
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作者 刘铁钢 白辰 +7 位作者 刘邵阳 黄羚 董斐 赵岩松 于河 刘果 林燕 谷晓红 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2020年第11期99-105,共7页
目的运用系统药理学的“症状网络映射”方法,对《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》中各证候的临床症状进行映射分析,探究新型冠状病毒肺炎的中医病机,为该病的中医防治提供思路和依据。方法提取新型冠状病毒肺炎各证候的最小单... 目的运用系统药理学的“症状网络映射”方法,对《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》中各证候的临床症状进行映射分析,探究新型冠状病毒肺炎的中医病机,为该病的中医防治提供思路和依据。方法提取新型冠状病毒肺炎各证候的最小单位症状,在SymMap数据库中检索对应的中药,构建“证候-症状-中药”数据库;对数据库中的高频中药进行分析,统计药物的性味归经,用Cytoscape3.7.2构建“证候-症状-中药-性味归经”网络图。结果寒湿郁肺证对应138味中药,以性温,味苦、辛,归肺、脾、胃经为主;湿热蕴肺证对应85味中药,以性温,味苦、甘,归肺、脾、胃经为主;湿毒郁肺证对应135味中药,以性温、寒,味苦、甘、辛,归肺、脾、胃经为主;寒湿阻肺证对应57味中药,以性温,味苦、甘、辛,归肺、脾、胃经为主;疫毒闭肺证对应155味中药,以性温、寒,味苦、甘、辛,归肺、脾、胃、心经为主;气营两燔证对应112味中药,以性寒,味苦、甘,归肺、胃、心、肝经为主;内闭外脱证对应25味中药,以性温、凉,味苦、甘,归肺、脾、心、肾、肝经为主;肺脾气虚证对应48味中药,以性温,味甘,归肺、脾经为主;气阴两虚证对应55味中药,以性温、平,味甘,归肺、脾、心、肾经为主。结论新型冠状病毒各证候的临床症状映射药物以性温,味辛、甘、苦,归肺、脾经为主,提示主要病位在肺、脾,湿邪阻滞病机存在于各阶段,其中轻型、普通型表现为湿兼寒,重型、危重型、恢复期表现为湿兼热。气虚病机见于疾病各阶段,治疗中应注意顾护正气,并根据邪实与正虚的对比情况立法用药。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 诊疗方案 病机 系统药理
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基于系统药理方法挖掘六君子汤的关键靶点与治疗疾病 被引量:9
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作者 孙亮 戴逸飞 +1 位作者 陆雪秋 张明明 《环球中医药》 CAS 2018年第2期216-222,共7页
目的通过系统药理学的方法挖掘六君子汤的关键靶标,为进一步研究六君子汤的作用机制提供新的方向。方法基于数据库及文献构建了六君子汤的成分组合库;通过口服生物利用度、药物相似度及半衰期三个参数对化学成分进行活性筛选,在此基础上... 目的通过系统药理学的方法挖掘六君子汤的关键靶标,为进一步研究六君子汤的作用机制提供新的方向。方法基于数据库及文献构建了六君子汤的成分组合库;通过口服生物利用度、药物相似度及半衰期三个参数对化学成分进行活性筛选,在此基础上,通过Sys DT靶点预测模型进行活性成分的靶点预测,然后通过Cytoscape软件构建活性成分-预测靶点网络;最后通过网络分析筛选出关键靶点,结合Uniprot数据库的靶点的疾病信息来构建靶点-疾病网络,并通过统计分析得出六君子汤的主治疾病。结果通过中心性算法进行计算分析得到六君子汤中最重要的四个靶点分别是环氧酶-2(PTGS2)、环氧酶-1(PTGS1)、γ-氨基丁酸受体α-1亚型(GARBRA1)、PKA催化剂C-α亚型的mRNA(PRKACA);结合Uniprot数据库获得与六君子汤的关键靶点相对应的疾病信息,统计发现该方对于溃疡性结肠炎和众多炎症可能具有治疗效果,同时对于前列腺癌、乳腺癌、实体瘤等癌症,以及心血管疾病、血栓症和阿兹海默症也显示出潜在的治疗作用,与部分已发表论文相互印证,其治疗癌症与阿兹海默症的效果还有待进一步研究。结论基于系统药理学的研究方法有助于寻找六君子汤的关键靶点和疾病网络,为深入研究六君子汤的作用机制提供新的研究方向和思路。 展开更多
关键词 六君子汤 系统药理 关键靶点 疾病网络 拓扑分析
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基于系统药理学的现代中药研究体系 被引量:76
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作者 王永华 杨凌 《世界中医药》 CAS 2013年第7期801-808,共8页
由于系统生物学的高速发展,以及系统生物学对现代药理学领域的深刻影响,近年来正在形成一个新兴的、跨学科分支,即系统药理学(Systems Pharmacology)。然而系统药理学无论在理论和方法上均不成熟。尤其是,如何将系统药理学的思想和理论... 由于系统生物学的高速发展,以及系统生物学对现代药理学领域的深刻影响,近年来正在形成一个新兴的、跨学科分支,即系统药理学(Systems Pharmacology)。然而系统药理学无论在理论和方法上均不成熟。尤其是,如何将系统药理学的思想和理论用于中药研究尚缺乏探索性工作。本文将综述当前系统药理学的最新进展,同时结合研究者的实践,重点介绍如何将药效学、药动学以及网络、组学以及系统分析综合起来,形成一个统一的完整的、可供开展中药药理学、药效学的预测和验证研究的系统模型。从而为从系统水平研究和分析中药和机体的相互作用,以及新药开发、靶点发现、新的治疗策略等提供新的研究方法。文章最后介绍了研究者最新开发的中药系统药理学数据库和分析平台软件。 展开更多
关键词 系统药理 网络药理 系统生物学 中药
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系统药理学原理、方法及在中医药中的应用 被引量:44
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作者 张文娟 王永华 《世界中医药》 CAS 2015年第2期280-286,共7页
目的:建立科学有效的现代中药研究体系,是中医药现代化进程中亟待解决的关键问题之一,然而目前从系统和整体水平研究中药的理论和方法均不成熟。方法:本文将综述当前系统药理学的最新进展,阐明如何整合药效学、药动学以及基因、蛋白、... 目的:建立科学有效的现代中药研究体系,是中医药现代化进程中亟待解决的关键问题之一,然而目前从系统和整体水平研究中药的理论和方法均不成熟。方法:本文将综述当前系统药理学的最新进展,阐明如何整合药效学、药动学以及基因、蛋白、药物网络分析等技术,形成一个完整的可供中药药理学、药效学预测和验证的技术体系。结果:重点从中药基础理论、复方解析、注射液的研究、老方优化和新药开发方面介绍系统药理学在中医药中的应用。结论:本文提出的系统药理学研究体系为中药的现代研究提供了新方法学,将有助于系统、深刻地从系统水平和分子水平揭示中药和机体的相互作用机制,从而指导中药新药研发。 展开更多
关键词 系统药理 系统生物学 生物信息学 中药
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基于系统药理学的麻黄细辛附子汤治疗缓慢型心律失常的作用机制研究 被引量:12
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作者 罗蔚 郑景辉 +2 位作者 徐文华 伍新诚 李建橡 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2019年第11期2338-2346,共9页
目的基于系统药理学方法探究麻黄细辛附子汤治疗缓慢型心律失常的作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和PharmMapper数据库筛选出麻黄细辛附子汤的有效成分和作用靶点,并构建成分-靶点网络,然后利用OMIM、GeneCards、CTD... 目的基于系统药理学方法探究麻黄细辛附子汤治疗缓慢型心律失常的作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和PharmMapper数据库筛选出麻黄细辛附子汤的有效成分和作用靶点,并构建成分-靶点网络,然后利用OMIM、GeneCards、CTD数据库筛选缓慢型心律失常的相关靶点,通过Draw Venn Diagram网站进行交集比对,获取麻黄细辛附子汤作用于缓慢型心律失常的相关靶点;然后利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用Cytoscape进行网络靶点特性分析,并在Systemsdock数据库进行系统分子对接。结果筛选出了51个满足条件的药物有效成分及其263个作用靶点,566个缓慢型心律失常相关的疾病靶点,交集靶点共14个。GO分析得到63个相关生物过程,6项分子功能,10类细胞组成;KEGG通路富集筛选得到5条重要的信号通路;各分子与靶点之间有较好的结合活性。结论麻黄细辛附子汤可能是通过唾腺分泌、心肌细胞的肾上腺素能、cGMP-pkg信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路来发挥对缓慢型心律失常的治疗作用。 展开更多
关键词 麻黄细辛附子汤 缓慢型心律失常 系统药理 信号通路
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银屑灵计算机系统药理学研究 被引量:3
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作者 朱伟 贺嵩敏 +1 位作者 袁小红 卢传坚 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期379-382,共4页
目的运用化学信息学和系统生物学技术对银屑灵5种主要化学成分(绿原酸、芍药苷、异秦皮啶、阿魏酸、落新妇苷)的生理活性进行预测。方法采用GeneGo公司Metadrug软件研究银屑灵主要化学成分的靶标与可能的分子作用机制。结果绿原酸、芍... 目的运用化学信息学和系统生物学技术对银屑灵5种主要化学成分(绿原酸、芍药苷、异秦皮啶、阿魏酸、落新妇苷)的生理活性进行预测。方法采用GeneGo公司Metadrug软件研究银屑灵主要化学成分的靶标与可能的分子作用机制。结果绿原酸、芍药苷、阿魏酸和落新妇苷的预测靶标与银屑病的发病机制没有直接关系;异秦皮啶的预测靶标环氧合酶-2(Cyclooxygenae-2,COX-2)和5-脂加氧酶(Lipoxygenase,5-LOX)是炎症反应的关键酶。落新妇苷的预测靶标ABCG2与细胞的药物分子转运有关。结论在银屑灵5种主要化学成分中,异秦皮啶与银屑病的发病机理相关,可能是活性成分;落新妇苷与细胞的药物分子转运有关,可能是辅助成分,其他3种成分可能是无效成分。 展开更多
关键词 银屑灵 系统药理 绿原酸 芍药苷 异秦皮啶 阿魏酸 落新妇苷
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基于系统药理学方法的四君子汤活性成分预测 被引量:5
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作者 叶蕾 孙喜灵 +2 位作者 崔利锐 宫健伟 滕佳林 《山东中医杂志》 2015年第3期200-203,共4页
目的:通过系统药理学方法预测四君子汤的活性成分。方法:利用系统药理学方法,构建四君子汤分子数据库,采用口服生物利用度和类药性评估对四君子汤的活性成分进行预测。结果:四君子汤中有52个化合物满足口服生物利用度(OB)≥30%,类药性指... 目的:通过系统药理学方法预测四君子汤的活性成分。方法:利用系统药理学方法,构建四君子汤分子数据库,采用口服生物利用度和类药性评估对四君子汤的活性成分进行预测。结果:四君子汤中有52个化合物满足口服生物利用度(OB)≥30%,类药性指数(DL)≥0.18。结论:四君子汤中有52个化合物具有较好的药理学活性,可进行下一步化合物-靶点-疾病(C-T-D)网络构建的研究。 展开更多
关键词 系统药理 四君子汤 活性成分预测
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基于系统药理学和分子对接解析湘NCP2方防治新冠肺炎的作用机制 被引量:3
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作者 张世鹰 李卫青 +1 位作者 李玲 卢芳国 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期255-263,共9页
目的基于系统药理学和分子对接解析湖南省预防新冠肺炎2号方(简称湘NCP2方)防治新冠肺炎的作用机制。方法基于SCIFINDER、TCM@Taiwan、TCMSP等药理学网络数据库检索湘NCP2方的化学成分和作用靶点;在Genecards和OMIM中检索SARS⁃CoV⁃2感... 目的基于系统药理学和分子对接解析湖南省预防新冠肺炎2号方(简称湘NCP2方)防治新冠肺炎的作用机制。方法基于SCIFINDER、TCM@Taiwan、TCMSP等药理学网络数据库检索湘NCP2方的化学成分和作用靶点;在Genecards和OMIM中检索SARS⁃CoV⁃2感染人体相关靶点,String 11.0等数据库收集靶点之间的蛋白质相互作用信息,Cytoscape3.7.2构建化合物⁃靶点网络,DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;选取核心有效成分,Autodock Vina软件将其与SARS⁃CoV⁃23CL水解酶和ACE2进行分子对接。结果有效成分⁃作用靶点网络包含267个作用靶点和121种有效成分,共同调控的靶点为CASP3、FOS、CREB1、CCL2、IL10、BCL2L1、IFNG、CXCL10、DPP4。生物过程的富集主要涉及炎症、免疫等,细胞组分富集主要与外泌体等有关,分子功能主要与酶结合、药物反应和病毒受体活性有关。KEGG通路富集筛选得到6条信号通路(P<0.05),涉及TNF信号通路、T细胞受体信号传导途径、Toll样受体信号通路、B细胞受体信号传导途径、NF⁃κB信号通路等。核心有效成分与SARS⁃CoV⁃23CL水解酶和ACE2展现了良好的对接活性。结论湘NCP2方可通过炎症、免疫等生物过程和信号通路,以及作用SARS⁃CoV⁃23CL水解酶、ACE2等SARS⁃CoV⁃2相关蛋白来防治新冠肺炎。 展开更多
关键词 湖南省预防新冠肺炎2号方(湘NCP2方) 新冠肺炎 系统药理 分子对接
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