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多方法集成预测短柄草核心启动子模体
1
作者
陈艳楠
张甜
张少强
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2017年第6期50-54,共5页
为了解决真核生物启动子调控元件注释难题,以短柄草为研究对象,进行全基因组范围内的核心启动子模体预测.基于系统进化足迹技术,集成多种模体发现算法寻找启动子模体,并结合模体聚类算法筛选出真实模体.结果发现,在前10个最优的核心启...
为了解决真核生物启动子调控元件注释难题,以短柄草为研究对象,进行全基因组范围内的核心启动子模体预测.基于系统进化足迹技术,集成多种模体发现算法寻找启动子模体,并结合模体聚类算法筛选出真实模体.结果发现,在前10个最优的核心启动子模体中,有6个与已知的拟南芥模体一致,表明该方法的有效性.
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关键词
模体
系统进化足迹
短柄草
核心启动子
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职称材料
题名
多方法集成预测短柄草核心启动子模体
1
作者
陈艳楠
张甜
张少强
机构
天津师范大学计算机与信息工程学院
出处
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2017年第6期50-54,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(61572358)
天津市自然科学基金资助项目(16JCYBJC23600)
文摘
为了解决真核生物启动子调控元件注释难题,以短柄草为研究对象,进行全基因组范围内的核心启动子模体预测.基于系统进化足迹技术,集成多种模体发现算法寻找启动子模体,并结合模体聚类算法筛选出真实模体.结果发现,在前10个最优的核心启动子模体中,有6个与已知的拟南芥模体一致,表明该方法的有效性.
关键词
模体
系统进化足迹
短柄草
核心启动子
Keywords
motif
phylogenetic footprinting
Brachypodium distachyon
core promoter
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多方法集成预测短柄草核心启动子模体
陈艳楠
张甜
张少强
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2017
0
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