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1999~2013年山东H9N2亚型禽流感病毒HA基因的演化和HI抗原性差异分析
被引量:
9
1
作者
张伟
徐怀英
+6 位作者
孟芳
马秀丽
刘霞
黄迪海
秦卓明
刘金华
赵鹏
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2015年第2期190-199,共10页
利用生物信息学方法和血凝交叉抑制(HI)试验比较研究了山东地区低致病性禽流感H9N2亚型病毒的分子遗传变异和抗原性变化.对1999~2013年在山东地区分离并鉴定的35株H9N2病毒进行了HA基因测序和同源性分析,绘制了系统发育树.同源性比较...
利用生物信息学方法和血凝交叉抑制(HI)试验比较研究了山东地区低致病性禽流感H9N2亚型病毒的分子遗传变异和抗原性变化.对1999~2013年在山东地区分离并鉴定的35株H9N2病毒进行了HA基因测序和同源性分析,绘制了系统发育树.同源性比较显示,同一时期的毒株同源性较高,而不同年代的H9N2流行毒相差较大,如2010~2013年的H9N2流行毒之间核苷酸(氨基酸)同源性为94.5%~100%(96.1%~100%),但与疫苗株SD-6的核苷酸(氨基酸)同源性已降至90.0%~92.5%(91.8%~95.0%).系统发育树显示,35株H9N2病毒均属欧亚谱系,其中28株属于S2-like亚群,表明该类型毒株是山东地区最主要的流行株.重要氨基酸位点分析表明,2010年以后的H9N2流行毒,其HA蛋白裂解位点基序为PSRSSR↓GL,334位点均由原来的A变为S;与受体结合位点相关的234位点,则由Q变为L.选择不同亚群的H9N2代表毒株制备单因子血清,进行HI交叉抑制实验,结果发现,H9N2不同毒株之间均可发生一定的交叉反应,但相关指数最低已降至0.31,表明病毒已出现明显的抗原性变化.本研究证实,山东H9N2亚型禽流感病毒在分子和抗原水平上均已发生一定程度的变异.
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关键词
H9N2
HA基因
系谱分群
HI交叉抑制
相关性
原文传递
题名
1999~2013年山东H9N2亚型禽流感病毒HA基因的演化和HI抗原性差异分析
被引量:
9
1
作者
张伟
徐怀英
孟芳
马秀丽
刘霞
黄迪海
秦卓明
刘金华
赵鹏
机构
中国农业大学动物医学院
山东省农业科学院畜牧兽医研究所
山东省农业科学院家禽研究所
山东农业大学动物科技学院
山东省健牧生物药业有限公司
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2015年第2期190-199,共10页
基金
国家自然科学基金(批准号:30599431)
国家重点基础研究发展计划(批准号:2011CB504702)
+1 种基金
国家农业科技成果转化资金(批准号:2013GB2C600273)
山东省科技发展计划(批准号:2009GG10009006)资助项目
文摘
利用生物信息学方法和血凝交叉抑制(HI)试验比较研究了山东地区低致病性禽流感H9N2亚型病毒的分子遗传变异和抗原性变化.对1999~2013年在山东地区分离并鉴定的35株H9N2病毒进行了HA基因测序和同源性分析,绘制了系统发育树.同源性比较显示,同一时期的毒株同源性较高,而不同年代的H9N2流行毒相差较大,如2010~2013年的H9N2流行毒之间核苷酸(氨基酸)同源性为94.5%~100%(96.1%~100%),但与疫苗株SD-6的核苷酸(氨基酸)同源性已降至90.0%~92.5%(91.8%~95.0%).系统发育树显示,35株H9N2病毒均属欧亚谱系,其中28株属于S2-like亚群,表明该类型毒株是山东地区最主要的流行株.重要氨基酸位点分析表明,2010年以后的H9N2流行毒,其HA蛋白裂解位点基序为PSRSSR↓GL,334位点均由原来的A变为S;与受体结合位点相关的234位点,则由Q变为L.选择不同亚群的H9N2代表毒株制备单因子血清,进行HI交叉抑制实验,结果发现,H9N2不同毒株之间均可发生一定的交叉反应,但相关指数最低已降至0.31,表明病毒已出现明显的抗原性变化.本研究证实,山东H9N2亚型禽流感病毒在分子和抗原水平上均已发生一定程度的变异.
关键词
H9N2
HA基因
系谱分群
HI交叉抑制
相关性
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1999~2013年山东H9N2亚型禽流感病毒HA基因的演化和HI抗原性差异分析
张伟
徐怀英
孟芳
马秀丽
刘霞
黄迪海
秦卓明
刘金华
赵鹏
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2015
9
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