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雨生红球藻UVR8的基因克隆和生物信息学分析 被引量:7
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作者 张宏江 杭伟 +3 位作者 马浩天 王晓丹 李润植 崔红利 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第9期2025-2032,共8页
【目的】获得雨生红球藻中紫外抗性蛋白(Uvresistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全长,并进行生物信息分析。【方法】以雨生红球藻为研究对象,通过同源克隆方法获得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全长,并通过生物信息手段对其理化性质、蛋白... 【目的】获得雨生红球藻中紫外抗性蛋白(Uvresistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全长,并进行生物信息分析。【方法】以雨生红球藻为研究对象,通过同源克隆方法获得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全长,并通过生物信息手段对其理化性质、蛋白结构及系统进化进行分析。【结果】序列分析表明,HaeUVR8的编码区全长为1554 bp,共编码517个氨基酸,预测理论等电点为5.56,理论分子量为54.31 kD。通过BLASTp分析,与拟南芥中UVR8的相似性达到51%,与莱菌衣藻中UVR8的相似性达到59%。通过蛋白保守结构域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型结构域,包括7个叶片螺旋结构和保守的色氨酸残基。系统进化分析表明,高等植物和真核绿藻来源UVR8s有共同祖先。【结论】本研究首次获得雨生红球藻中编码UVR8的基因序列,发现其结构与高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用机制,为雨生红球藻中UVR8的表达、功能研究奠定基础,同时为解析雨生红球藻适应紫外光的分子机制提供线索。 展开更多
关键词 紫外抗性蛋白 CDNA全长 结构域 系统进化 雨生红球藻
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饥饿诱导的细胞自噬可以引起UVRAG的降解
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作者 李梅 王宝栋 +1 位作者 刘荣臻 张晓延 《医学分子生物学杂志》 CAS 2014年第5期249-251,共3页
目的:观察细胞发生自噬后UVRAG水平的改变及其与自噬发生的关系。方法用Western印迹检测饥饿诱导细胞自噬后UVRAG分子的水平改变,然后分别应用自噬起始阶段与效应阶段的抑制剂抑制自噬,检测自噬不同阶段UVRAG分子的水平变化;结果饥... 目的:观察细胞发生自噬后UVRAG水平的改变及其与自噬发生的关系。方法用Western印迹检测饥饿诱导细胞自噬后UVRAG分子的水平改变,然后分别应用自噬起始阶段与效应阶段的抑制剂抑制自噬,检测自噬不同阶段UVRAG分子的水平变化;结果饥饿促进了细胞LC3的型别转换和P62的降解,诱导细胞发生自噬;3-MA抑制细胞自噬及E64d和pepstatin抑制自噬溶酶体活性后,UVRAG的降解减少;结论饥饿诱导细胞自噬在形成自噬溶酶体后引起了UVRAG的降解。 展开更多
关键词 饥饿 自噬 紫外辐射相关蛋白 自噬抑制剂
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