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紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的转录组分析
被引量:
2
1
作者
孟凡来
白磊
+5 位作者
郭华春
赵大伟
余兴华
王应梅
李玉祥
滕娟
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第5期135-142,共8页
为了研究紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的分子机理,以滇紫甘薯24(DZS24)的叶片为试验材料,通过高通量测序技术对自然光照与人工增补UV-B辐射(T=7.2 kJ/(m 2·d))下DZS24的叶片进行转录组测序分析。结果表明,477个基因表达发生显著变化...
为了研究紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的分子机理,以滇紫甘薯24(DZS24)的叶片为试验材料,通过高通量测序技术对自然光照与人工增补UV-B辐射(T=7.2 kJ/(m 2·d))下DZS24的叶片进行转录组测序分析。结果表明,477个基因表达发生显著变化,其中382个上调表达,95个下调表达,GO功能分析显示,差异表达基因主要显著富集在生物过程的氧化还原过程和分子功能的氧化还原酶活性中,KEGG代谢通路分析共富集到9条显著差异通路,其中次生代谢产物生物合成通路所包含的差异表达基因数量最多。紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的差异表达基因主要为类黄酮合成通路中的CHS(Tai6.1732、Tai6.53503、Tai6.45381)和DFR(Tai6.3019)及芥子油苷生物合成中的CYP83B1(Tai6.44115、Tai6.18064、Tai6.41206)和油菜素内酯生物合成中的CYP85A1(Tai6.2806、Tai6.19253、Tai6.15801),转录因子主要为C2H2、NAM、bHLH和RR-A-type。综上所述,紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的关键基因可能为IbCHS、IbDFR、IbCYP83B1和IbCYP85A1,主要转录因子可能为C2H2、NAM、bHLH和RR-A-type。
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关键词
紫甘薯叶片
UV-B辐射增强
差异表达基因
响应
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职称材料
题名
紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的转录组分析
被引量:
2
1
作者
孟凡来
白磊
郭华春
赵大伟
余兴华
王应梅
李玉祥
滕娟
机构
云南农业大学农学与生物技术学院
文山壮族苗族自治州农业科学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第5期135-142,共8页
基金
国家农业产业技术体系(CARS-09-15P)。
文摘
为了研究紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的分子机理,以滇紫甘薯24(DZS24)的叶片为试验材料,通过高通量测序技术对自然光照与人工增补UV-B辐射(T=7.2 kJ/(m 2·d))下DZS24的叶片进行转录组测序分析。结果表明,477个基因表达发生显著变化,其中382个上调表达,95个下调表达,GO功能分析显示,差异表达基因主要显著富集在生物过程的氧化还原过程和分子功能的氧化还原酶活性中,KEGG代谢通路分析共富集到9条显著差异通路,其中次生代谢产物生物合成通路所包含的差异表达基因数量最多。紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的差异表达基因主要为类黄酮合成通路中的CHS(Tai6.1732、Tai6.53503、Tai6.45381)和DFR(Tai6.3019)及芥子油苷生物合成中的CYP83B1(Tai6.44115、Tai6.18064、Tai6.41206)和油菜素内酯生物合成中的CYP85A1(Tai6.2806、Tai6.19253、Tai6.15801),转录因子主要为C2H2、NAM、bHLH和RR-A-type。综上所述,紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的关键基因可能为IbCHS、IbDFR、IbCYP83B1和IbCYP85A1,主要转录因子可能为C2H2、NAM、bHLH和RR-A-type。
关键词
紫甘薯叶片
UV-B辐射增强
差异表达基因
响应
Keywords
Purple sweet potato leaf
UV-B radiation enhancement
Differentially expressed genes
Response
分类号
S531.03 [农业科学—作物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫甘薯叶片响应UV-B辐射增强的转录组分析
孟凡来
白磊
郭华春
赵大伟
余兴华
王应梅
李玉祥
滕娟
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021
2
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参考文献
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