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红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的克隆、序列分析及热稳定性提高
被引量:
2
1
作者
王辂
叶丽娟
曹毅
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1447-1456,共10页
【目的】克隆红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶基因全序列,对序列进行生物信息学分析,并提高酶的热稳定性。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)克隆α-氨基酸酯水解酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分...
【目的】克隆红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶基因全序列,对序列进行生物信息学分析,并提高酶的热稳定性。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)克隆α-氨基酸酯水解酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,预测红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的三维结构;通过定点突变替换氨基酸序列中高度柔性的位点,提高该酶的热稳定性。【结果】从红纹黄单胞菌(Xanthomonas rubrillineans)中扩增得到α-氨基酸酯水解酶基因aeh(GenBank登录号JF744990),核苷酸序列长度1 917 bp,编码638个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str.GPE PC73的肽酶及地毯草黄单胞菌Xanthomonas axono-podis pv. citri str. 306的戊二酰-7-氨基头孢烷酸酰化酶氨基酸序列相似性最高,分别为91%和83%,系统进化分析表明,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str. GPEPC73的肽酶亲缘性最高。基于预测的三维模型,对高度柔性的位点进行饱和突变,从282株突变体中筛选得到3株T50较野生型高5°C以上的突变体。【结论】对红纹黄单胞菌AEH的氨基酸序列分析有助于探索同源蛋白的进化过程。对高度柔性位点进行饱和突变的策略可以用于提高热稳定性。
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关键词
α-氨基酸酯水解酶
红纹黄单胞菌
序列分析
热稳定性
定点饱和突变
原文传递
题名
红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的克隆、序列分析及热稳定性提高
被引量:
2
1
作者
王辂
叶丽娟
曹毅
机构
四川大学生命科学院
中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1447-1456,共10页
基金
"十二五"重大新药创制科技重大专项(No.2011ZX09401-403)
四川省国际科技合作与交流研究计划项目(No.2010HH0036)
+1 种基金
四川省国际合作计划项目(No.2011HH0013)
成都市科技计划项目(No.10GGYB297SW-182)
文摘
【目的】克隆红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶基因全序列,对序列进行生物信息学分析,并提高酶的热稳定性。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)克隆α-氨基酸酯水解酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,预测红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的三维结构;通过定点突变替换氨基酸序列中高度柔性的位点,提高该酶的热稳定性。【结果】从红纹黄单胞菌(Xanthomonas rubrillineans)中扩增得到α-氨基酸酯水解酶基因aeh(GenBank登录号JF744990),核苷酸序列长度1 917 bp,编码638个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str.GPE PC73的肽酶及地毯草黄单胞菌Xanthomonas axono-podis pv. citri str. 306的戊二酰-7-氨基头孢烷酸酰化酶氨基酸序列相似性最高,分别为91%和83%,系统进化分析表明,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str. GPEPC73的肽酶亲缘性最高。基于预测的三维模型,对高度柔性的位点进行饱和突变,从282株突变体中筛选得到3株T50较野生型高5°C以上的突变体。【结论】对红纹黄单胞菌AEH的氨基酸序列分析有助于探索同源蛋白的进化过程。对高度柔性位点进行饱和突变的策略可以用于提高热稳定性。
关键词
α-氨基酸酯水解酶
红纹黄单胞菌
序列分析
热稳定性
定点饱和突变
Keywords
Alpha-amino acid ester hydrolase Xanthomonas rubrillineans Sequence analysis Thermostability Site-directed saturated mutagenesis
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的克隆、序列分析及热稳定性提高
王辂
叶丽娟
曹毅
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
原文传递
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