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铜绿丽金龟线粒体全基因组及其系统发育分析 被引量:2
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作者 曲春娟 朱悦 +3 位作者 江晨 曲明静 王向誉 李晓 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期263-273,共11页
铜绿丽金龟Anomala corpulenta是一种重要的农林害虫。本文采用Illumina HiSeq X平台对其进行线粒体基因组测序,对基因组序列进行拼装、注释,并对线粒体基因组结构特征和碱基组成进行分析。基于13个蛋白质编码基因的核苷酸序列,采用最... 铜绿丽金龟Anomala corpulenta是一种重要的农林害虫。本文采用Illumina HiSeq X平台对其进行线粒体基因组测序,对基因组序列进行拼装、注释,并对线粒体基因组结构特征和碱基组成进行分析。基于13个蛋白质编码基因的核苷酸序列,采用最大似然法和贝叶斯法构建金龟科系统发育树。结果表明,铜绿丽金龟线粒体基因组全长为16 673 bp,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和一段长约1 074 bp的A+T富集区。基因排布与已知的其他丽金龟科昆虫完全相同,且遵循祖先模式,未发生基因重排。系统发育分析显示,丽金龟亚科的所有物种聚在同一分支,支持该亚科的单系性;异丽金龟属Anomala与彩丽金龟属Mimela的亲缘关系较其与弧丽金龟Popillia和喙丽金龟属Adoretus更近。本研究获得了第一条丽金龟亚科最大属——异丽金龟属Anomala昆虫的线粒体基因组全序列,有助于加深对丽金龟亚科线粒体基因组学和系统发育关系的理解。 展开更多
关键词 丽金龟亚科 异丽金龟属 铜绿丽金龟 线粒体基因 系统发育
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二代测序技术及其在法医遗传学中的应用 被引量:38
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作者 王乐 叶健 +2 位作者 白雪 杨帆 赵兴春 《刑事技术》 2015年第5期353-358,共6页
从DNA指纹图谱到STR复合扩增检验,30年来法医DNA工作者目睹着技术的深刻变革以及在此推动下案件侦查模式的巨大转变。自从二代测序技术问世以来,遗传学的研究方式已发生了巨大转变。但是相比其在癌症和遗传病诊断、基因组从头测序和重... 从DNA指纹图谱到STR复合扩增检验,30年来法医DNA工作者目睹着技术的深刻变革以及在此推动下案件侦查模式的巨大转变。自从二代测序技术问世以来,遗传学的研究方式已发生了巨大转变。但是相比其在癌症和遗传病诊断、基因组从头测序和重测序、转录组重测序、药物研制等领域的应用,二代测序在法庭科学领域的应用尚处于起步阶段。本文介绍二代测序的基本概念、发展历史和工作原理,综述了二代测序技术在STR分型、SNP分型、线粒体全基因组测序等几个重点领域近两年的最近动态,最后结合二代测序在法庭科学领域的应用展望提出可能遇到的挑战,希冀对相关研究和实践提供参考。 展开更多
关键词 法医遗传学 二代 短串联重复 单核苷酸多态性 线粒体基因
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单基因糖尿病10例患儿的临床特征与遗传学病因分析
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作者 方洁 张萍萍 +3 位作者 冯跃英 丁曙霞 闫露露 李海波 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第7期783-789,共7页
目的探讨10例单基因糖尿病患儿的临床特征与遗传学病因。方法回顾性分析2020年1月至2023年3月宁波市妇女儿童医院收治的116例糖尿病患儿的临床资料及实验室检查数据,进行糖尿病分型,对其中21例疑诊为单基因糖尿病的患儿进行全外显子组测... 目的探讨10例单基因糖尿病患儿的临床特征与遗传学病因。方法回顾性分析2020年1月至2023年3月宁波市妇女儿童医院收治的116例糖尿病患儿的临床资料及实验室检查数据,进行糖尿病分型,对其中21例疑诊为单基因糖尿病的患儿进行全外显子组测序(WES)及线粒体基因测序。结果共发现10例单基因糖尿病患儿,均为青少年起病的成人型糖尿病(MODY),其中6例为GCK基因变异所致的MODY2,1例为HNF1A基因变异所致的MODY3,2例为ABCC8基因变异所致的MODY12,1例为KCNJ11基因变异所致的MODY13。10例患儿中仅1例因"多饮多尿"就诊,其他均无典型的糖尿病症状。MODY组的糖尿病家族史阳性率显著高于1型糖尿病(T1DM)组及2型糖尿病(T2DM)组(P<0.05)。MODY组的BMI较T1DM组高(P<0.05),初诊血糖较T1DM组低(P<0.05),空腹C肽水平较T1DM组高(P<0.05),糖化血红蛋白较T1DM组、T2DM组均低(P<0.05)。结论本研究纳入的患儿中,单基因糖尿病以MODY最常见,GCK基因变异所致的MODY2占主要类型。MODY患儿初诊血糖及糖化血红蛋白轻度升高,胰岛细胞功能尚存,临床表现及实验室检查与T2DM患儿存在重叠。WES联合线粒体基因测序可望明确单基因糖尿病的病因学诊断,有助于实现精准治疗。 展开更多
关键词 全外显子组 线粒体基因测序 基因糖尿病 青少年起病的成人型糖尿病
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Determination and Analysis of Mitochondrial ND2 Gene Sequence of Anas platyrhynchos 被引量:4
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作者 涂剑锋 司方方 +1 位作者 邢秀梅 杨福合 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第3期46-49,共4页
[Objective] The study was to analyze the phylogenesis of Anas platyrhynchos. [Method] Complete sequence of mitochondrial ND2 gene of 4 Anas platyrhynchos was determined by direct DNA sequencing based on PCR products. ... [Objective] The study was to analyze the phylogenesis of Anas platyrhynchos. [Method] Complete sequence of mitochondrial ND2 gene of 4 Anas platyrhynchos was determined by direct DNA sequencing based on PCR products. Combined with ND2 gene sequences of the Anas Linnaeus accessed in GenBank, phylogenetic tree was constructed by Neighbor-joining and maximum parsimony methods. [Result] The ND2 gene sequences of 4 Anas platyrhynchos were identical(1 041 bp in length; the nucleotide contents of A, G, T, and C were 28.91%, 13.35%, 20.75% and 36.98% respectively; A+T content approximated to that of C+G). Sequences of ND2 gene of mallard were same as spotbill duck, and had high homology with others. The phylogenetic trees indicated mallard and spotbilled duck were close in genetic relationship, both shared a haplotype; then Philippine duck, green-winged teal and northern pintail fell into branch ''A". [Conclusion] The domestic duck may be domesticated from mallard and spotbilled duck. 展开更多
关键词 Anas platyrhynchos ND2 gene sequence analysis Phylogenetic tree
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河北滦河口连续二年发现松江鲈
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作者 何萍 田晨 +5 位作者 王德旺 徐杰 龙心远 王安伦 蔡紫君 张鑫钰 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期429-437,共9页
松江鲈(Trachidermus fasciatus)是一种降海洄游的浅海繁殖肉食性鱼类,为国家二级保护野生动物。在我国,松江鲈的历史分布区主要在黄海、渤海、东海沿岸及通海河流,但近年文献观点认为松江鲈已在渤海区域消失。2022年7月、2023年7月和1... 松江鲈(Trachidermus fasciatus)是一种降海洄游的浅海繁殖肉食性鱼类,为国家二级保护野生动物。在我国,松江鲈的历史分布区主要在黄海、渤海、东海沿岸及通海河流,但近年文献观点认为松江鲈已在渤海区域消失。2022年7月、2023年7月和10月分别在河北滦河口记录到1尾、19尾和1尾松江鲈。通过对标本进行线粒体细胞色素b(Cyt b)基因测序,与NCBI数据库已有基因序列比对分析,确定该物种为松江鲈。本文梳理了我国沿海松江鲈的历史和现状分布记录以及增殖放流情况。根据河北省渤海海区松江鲈以及滦河口鱼类的文献记录,松江鲈历史分布区主要在北戴河和秦皇岛海域,滦河口仅有1次早期文字记录和1次2010年的调查记录。尚未发现渤海沿岸有松江鲈增殖放流活动的报导。此次在滦河口连续两年调查到松江鲈,说明在该水域存在繁殖性洄游群体。滦河口存在松江鲈,可能与洄游通道畅通、入海断面水质多年维持地表水水质Ⅱ类且近海水质清洁(海水水质一类或二类)以及捕捞压力较轻有关。建议进一步跟踪监测滦河口松江鲈的洄游范围、繁殖地和种群动态并严格实施保护。 展开更多
关键词 松江鲈 滦河口 洄游鱼类 线粒体色素b基因
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