亚洲带绦虫60S核糖体蛋白L8基因的克隆表达和免疫学分析

目的原核克隆表达亚洲带绦虫成虫60S核糖体蛋白L8基因(TaRPL8),探索其应用前景。方法用RT-PCR方法从亚洲带绦虫成虫cDNA中获取RPL8基因,克隆到原核表达质粒pET-28a(+)中,在大肠埃希菌BL21/DE3中用IPTG诱导表达,表达产物通过SDS-PAGE进行鉴定,用镍离子金属螯合剂亲和层析柱进行纯化,纯化的重组蛋白用蛋白印迹进行免疫学分析。结果 PCR、双酶切及DNA测序结果均表明pET-28a(+)-TaRPL8重组质粒构建成功。SDS-PAGE结果表明目的基因在大肠埃希菌BL21/DE3中获得高效表达,亲和层析获得了高纯度蛋白。重组蛋白可被其免疫的SD大鼠血清识别但不能够被正常大鼠血清识别,表明其具有免疫原性。结论亚洲带绦虫成虫TaRPL8基因可在大肠埃希菌BL21/DE3中获得具有免疫原性的表达,为进一步的功能研究奠定了基础。

MRP8过表达促进重组酿酒酵母外切纤维素酶生产

增强酿酒酵母纤维素酶分泌能力,为提高利用联合生物加工生产纤维素乙醇的效率提供基础。采用CRISPR/Cas9基因组编辑技术,在分泌表达外切纤维素酶CBH1的酿酒酵母Y294中过表达线粒体核糖体蛋白基因MRP8。与对照菌株相比,过表达MRP8重组酵母的胞外CBH1酶活提高了约80%。实时定量PCR结果分析表明,在MRP8过表达突变体中,CBH1转录水平高于对照菌株,但是与蛋白折叠和分泌相关的关键基因转录水平没有明显变化。在刚果红平板和含有衣霉素或二硫苏糖醇的平板上生长没有受到影响。胞内ATP含量和活性氧积累未发现显著差别。本研究表明MRP8过表达促进外切纤维素酶的生产。

色瓦绵羊RPL8基因的组织表达特征及生物信息学分析

【目的】研究色瓦绵羊核糖体蛋白L8基因(RPL8)在各组织部位的表达特征及其潜在功能作用,揭示RPL8基因调控色瓦绵羊产奶质量的分子作用机制,为推进色瓦绵羊的分子遗传育种提供理论依据。【方法】PCR扩增色瓦绵羊RPL8基因,通过ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0等在线软件分析RPL8基因结构特征及潜在功能,并以实时荧光定量PCR检测其在色瓦绵羊各组织中的表达分布情况。【结果】RPL8基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、脾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等9个组织中均有表达,在小肠、乳腺和卵巢中的相对表达量极显著高于其他组织中的相对表达量(P<0.01)。色瓦绵羊RPL8基因编码区(CDS)序列长774 bp,共编码257个氨基酸残基;基于RPL8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示,色瓦绵羊与山羊、牦牛、牛等反刍物种的亲缘关系较近。色瓦绵羊RPL8蛋白相对分子量为28024.66Da,理论等电点(pI)为11.04,是一种稳定的碱性亲水性蛋白,不具有跨膜结构,主要定位于细胞质(占78.3%);色瓦绵羊RPL8蛋白存在15个磷酸化位点[7个丝氨酸(S)位点,8个苏氨酸(T)位点],其二、三级结构中均以无规则卷曲为主。色瓦绵羊RPL8蛋白的互作蛋白均为核糖体蛋白,其同源性高达99.90%,其中,RPS5、RPS16、RPL11、RPS3、RPS18和RPS11属于通用核糖体蛋白家族,RPL13属于真核核糖体蛋白家族。【结论】色瓦绵羊RPL8是一种胞内稳定的碱性亲水性蛋白,具有核糖体蛋白的基本结构特征。RPL8基因在色瓦绵羊各组织中的表达具有普遍性,尤其在乳腺和卵巢中呈高表达,说明RPL8基因除了发挥其家族基本功能作用外,在色瓦绵羊乳腺和卵巢组织中可能还影响乳脂含量与卵泡的周期性发育。

CKMT1A、CRABP2、PAX8在子宫内膜癌患者血清中的表达水平及其与临床病理参数和预后的关系

目的探讨线粒体肌酸激酶1A(CKMT1A)、细胞视黄酸结合蛋白2(CRABP2)、配对盒基因8(PAX8)在子宫内膜癌患者血清中的表达水平及其与临床病理参数和预后的关系。方法选取2021年5月至2022年5月唐山市妇幼保健院收治的107例子宫内膜癌患者作为研究组。并在治疗后进行1年定期随访,根据患者复发情况分为复发组和未复发组。另选取同时期在该院进行体检的86例健康者作为健康组。采用酶联免疫吸附试验检测各组血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平,比较不同临床病理指标的子宫内膜癌患者血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平。采用Pearson相关分析子宫内膜癌患者血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平的相关性。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清CKMT1A、CRABP2、PAX8单独及三者联合检测对子宫内膜癌复发的预测价值。结果研究组血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平均高于健康组,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,血清CKMT1A与CRABP2水平呈正相关(r=0.437,P<0.001),CKMT1A与PAX8水平呈正相关(r=0.526,P<0.001),CRABP2与PAX8水平呈正相关(r=0.493,P<0.001)。不同肌层浸润、分化程度、淋巴结转移情况等的子宫内膜癌患者血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05),且血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平随着分化程度的降低及淋巴结的转移而升高(P<0.05)。复发组纳入12例患者,非复发组纳入95例患者。复发组血清CKMT1A、CRABP2、PAX8水平均高于非复发组,差异均有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清CKMT1A、CRABP2和PAX8单独预测子宫内膜癌复发的曲线下面积分别为0.886、0.850、0.811,均低于三者联合检测的0.978(Z三者联合-CKMT1A=2.318,P=0.020;Z三者联合-CRABP2=2.030,P=0.042;Z三者联合-PAX8=2.955,P=0.003)。结论子宫内膜癌患者血清CKMT1A、CRABP2和PAX8水平均高表达,三者表达与病理类型、分化程度、淋巴结转移情况等临床病理参数以及预后有关,可以作为评估子宫内膜癌患者预后的生物学指标。

MRPS5对膀胱癌细胞增殖能力及干性特征的影响

目的探讨线粒体核糖体蛋白S5(mitochondrial ribosomal protein S5,MRPS5)对人膀胱癌细胞的增殖能力及其中干细胞干性特征的影响。方法 Western blot检测人膀胱癌及癌旁正常组织MRPS5的表达;构建靶向干扰MRPS5的慢病毒载体,感染膀胱癌细胞株T24,以干扰Scramble序列作为对照,Western blot检测MRPS5干扰效率;细胞活力实验检测细胞增殖能力;流式细胞术检测细胞周期;细胞成球实验观察成球能力;Western blot检测肿瘤干性转录因子Nanog,Oct4,c-Myc和Sox2的表达;小鼠皮下移植瘤实验观察T24体内成瘤能力。结果 MRPS5在膀胱癌组织中的表达高于癌旁正常组织;慢病毒干扰载体PLKO.1-sh MRPS5有效,且干扰MRPS5表达后T24细胞增殖能力下降(P<0.05),周期阻滞于S期,干性因子表达均下调,成球率无变化(P>0.05)但成球直径明显减小;同时小鼠体内成瘤体积减小[(0.784±0.278)vs(0.500±0.245)cm3,P<0.05],瘤质量减轻[(0.862±0.372)vs(0.412±0.248)g,P<0.05]。结论 MRPS5在膀胱癌中较高表达,且干扰MRPS5表达能抑制T24增殖并抑制T24中的干细胞生物学特征。

心脏圆锥动脉干发育相关基因的筛选研究

目的检测剔除心脏神经嵴心脏组织与正常心脏组织之间表达差异基因,筛选心脏圆锥动脉干发育相关基因。方法用电刺激方法建立鸡胚实验模型;用抑制消减杂交法筛选出实验组和对照组心脏组织之间存在的差异表达基因;构建减数杂交文库,用cDNA基因芯片技术验证,并进行测序。结果31.8%克隆在实验组表达显著减少。经检验确定13种不同基因片段,有7种与已知鸡基因序列完全匹配,分别为心脏αactin、DEADboxRNA解旋酶、核糖体蛋白L7a、线粒体基因组、GAPDH、肽延长因子-1;有4种基因片段与人、鼠等种属已知基因存在83%～89%的同源性,分别为核糖体蛋白S3、L10a、SNX1、CIRBP等;有2种在公共数据库未查到同源序列。结论有多种基因参与心脏圆锥动脉干胚胎发育;抑制消减杂交和基因芯片技术是筛选差异表达基因的有效方法。

基于加权基因表达网络和LASSO回归筛选骨肉瘤预后和转移相关基因

目的运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法筛选出与骨肉瘤转移和预后相关的基因,为骨肉瘤患者是否发生转移及其预后提供参考依据。方法利用UCSC Xena网站下载癌症基因组图谱-产生有效治疗方法研究项目(TCGA-TARGET)骨肉瘤患者基因表达谱和临床相关资料(检索时间:建库至2021年5月31日),数据库内含有84例骨肉瘤患者,其中男性37例,女性47例;平均年龄14.99岁(标准差7.80岁)。采用WGCNA和LASSO对84例骨肉瘤患者基因表达谱进行分析并筛选与预后和骨肉瘤转移相关基因;利用ONCOMINE数据库(检索时间:建库至2021年5月31日)进行外部验证。采用基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析筛选模块涉及功能和通路,基因组富集分析(GSEA)分析核心基因所涉及通路。结果通过WGCNA筛选一共获得67个模块,其中深蓝模块为核心模块,对深蓝模块中所包含的214基因进行LASSO分析,结合蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析和复杂分子关联分析(MOCDE)得分,筛选出线粒体核糖体蛋白48基因(MRPL48)、核糖体RNA加工8基因(RRP8)、核糖体RNA加工9基因(RRP9)作为核心靶基因。利用受试者工作特性(ROC)曲线分析核心基因预测骨肉瘤转移概率,结果提示RRP8,曲线下面积(AUC)=0.504,P=0.955;RRP9,AUC=0.509,P=0.913;MRPL48,AUC=0.663,P=0.025。可以明确MRPL48在骨肉瘤患者中的表达高低与其发生、预后明确相关。结论基于WGCNA并结合LASSO、PPI、MOCDE方法共同筛选获得的MRPL48与骨肉瘤发生和患者生存相关,可为骨肉瘤发生、转移和治疗的研究提供参考依据。

化疗后卵巢癌组织中线粒体DNA的变化

目的探讨化疗后卵巢癌组织中线粒体DNA的变化。方法收集2002年11月至2003年8月北京协和医院收治的7例初治和9例化疗后复发的卵巢癌患者的肿瘤组织及其周围的正常组织标本,对其线粒体DNA全长测序,与基因库中数据对比,确定基因库中未记载的新的多态性变化位点和突变位点。结果共发现69个新的多态性变化位点和17个突变位点,多态性变化在初治和复发卵巢癌患者的肿瘤组织和周围的正常组织中均存在,而突变仅在其肿瘤组织中存在。初治标本多态性变化位点平均2.7个,复发标本平均5.6个,两者比较,差异有统计学意义(P=0.01)。初治标本中编码蛋白的多态性变化位点为14个,其中3个(21%)引起了氨基酸的改变;复发标本中编码蛋白的多态性变化位点为41个,其中13个(32%)引起了氨基酸的改变,两者氨基酸改变的发生率比较,差异无统计学意义(P=0.700)。初治标本的突变率为5/7,突变位点有7个,其中处于蛋白编码区的4个突变位点中有3个(3/4)引起了氨基酸的改变;复发标本的突变率为5/9,突变位点有10个,其中处于蛋白编码区的5个突变位点全部(5/5)使氨基酸发生了改变,两者突变率和突变位点引起的氨基酸改变发生率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论化疗后复发的卵巢癌组织中,线粒体DNA的多态性变化明显增加,而线粒体DNA的突变无明显增加。提示线粒体DNA突变可能是肿瘤固有的特性之一。