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基于线粒体12S基因全序列分析我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性
被引量:
3
1
作者
李燕方
古江
+4 位作者
袁媛
谢跃
赖为民
杨光友
古小彬
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期2468-2476,共9页
为了探讨我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异情况及群体遗传结构,采用PCR测序技术测定我国5个地区(华北、华东、华中、西北、西南)绵羊痒螨(兔亚种)线粒体12S基因的全序列,并进行遗传多样性分析。结果共获得89条序列,长度均为657bp,核苷酸...
为了探讨我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异情况及群体遗传结构,采用PCR测序技术测定我国5个地区(华北、华东、华中、西北、西南)绵羊痒螨(兔亚种)线粒体12S基因的全序列,并进行遗传多样性分析。结果共获得89条序列,长度均为657bp,核苷酸变异位点76个,单倍型50个(H1~H50),单倍型多样性(Hd)与核苷酸多样性(π)分别为0.931 05和0.005 59。进一步分析发现5个地理种群遗传分化程度较弱(Fst=0.042 322),基因交流非常频繁(Nm=5.657 372)。中性检验结果均为负值(Tajima’s D=-0.928 31,Fu’s Fs=-7.066 71),并且差异性不显著(P<0.05)。构建的NJ树和单倍型网络图均显示绵羊痒螨(兔亚种)5个地理种群的50个单倍型散在分布于不同的支系内,未形成明显的地理分布格局。我国绵羊痒螨(兔亚种)具有较高的遗传多样性,且有一定的遗传分化,基因交流频繁,但未形成以兔品种、温度带和地域来源划分的种群遗传结构。
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关键词
绵羊痒螨(兔亚种)
线粒体12s基因
遗传多样性
下载PDF
职称材料
大壁虎线粒体12S rRNA基因片段的两种单倍型
被引量:
8
2
作者
刘忠权
王义权
+1 位作者
周开亚
韩德民
《安徽师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2000年第4期339-340,350,共3页
通过测定大壁虎 5个个体的线粒体 12SrRNA基因片段序列 ,发现大壁虎明显地分为两种单倍型 .结合染色体组型上的微小差异 ,这样的种内差异是否可能达到亚种级水平 ,还有待于进一步研究 .
关键词
大壁虎
线粒体
12
s
rRNA
基因
单倍型
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职称材料
基于线粒体12S rRNA基因对大理州亚洲 带绦虫遗传多样性的分析
3
作者
尹雪宇
陈远腾
+3 位作者
庄尔俊
赵俊杰
董玲
李海龙
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期784-788,共5页
目的为了解云南省大理州亚洲带绦虫的遗传多样性。方法本研究采集到大理(DL)、巍山(WS)、弥渡(MD)、漾濞(YB)和洱源(EY)5个地区的131份亚洲带绦虫样本,基于线粒体12S rRNA基因进行扩增,运用MEGA7.0和DNASP5.10.01软件对所得序列进行分析...
目的为了解云南省大理州亚洲带绦虫的遗传多样性。方法本研究采集到大理(DL)、巍山(WS)、弥渡(MD)、漾濞(YB)和洱源(EY)5个地区的131份亚洲带绦虫样本,基于线粒体12S rRNA基因进行扩增,运用MEGA7.0和DNASP5.10.01软件对所得序列进行分析,计算其碱基含量、遗传多样性参数、遗传分化系数和基因流以及遗传距离等数据。结果5个地区的亚洲带绦虫12S rRNA基因片段大小均为493 bp,平均A、T、G、C的碱基含量为28.3%、43.2%、19.4%和9.1%;共定义76个单倍体型,其中单倍型多样性为0.9830,核酸多样性为0.0332;遗传分化指数和基因流范围分别为-0.01913~0.04080和5.87745~22.49795;遗传距离为0.0023~0.0229,大理与巍山之间的遗传距离最大,漾濞与洱源群体之间的遗传距离最小。结论大理州5个地区亚洲带绦虫的线粒体12S rRNA基因的遗传多样性水平较高,基因交流频繁,但种群间的遗传分化较弱,本研究为亚洲带绦虫遗传多样性提供了基础数据。
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关键词
亚洲带绦虫
线粒体
12
s
rRNA
基因
遗传多样性
大理
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职称材料
威海地区新生儿耳聋基因检测的结果分析
被引量:
2
4
作者
孙诗雨
张春晓
蓝信强
《黑龙江医药科学》
2020年第5期49-50,53,共3页
目的:调查威海地区1720名新生儿携带中国常见的非综合征耳聋致病基因的情况。方法:采集2017-06~2020-02威海市妇幼保健院出生的1720名新生儿足跟血,应用飞行时间质谱仪检测GJB2基因、GJB3基因、SLC26A4基因和线粒体12S rRNA基因的20个...
目的:调查威海地区1720名新生儿携带中国常见的非综合征耳聋致病基因的情况。方法:采集2017-06~2020-02威海市妇幼保健院出生的1720名新生儿足跟血,应用飞行时间质谱仪检测GJB2基因、GJB3基因、SLC26A4基因和线粒体12S rRNA基因的20个突变位点。结果:研究发现新生儿耳聋基因携带者80名,GJB2基因杂合突变32例,主要突变位点为c.235delC。SLC26A4基因杂合突变39例,主要突点为c.IVS7-2A>G。7例GJB3基因杂合突变,2例线粒体12S rRNA c.1555A>C突变。结论:威海地区新生儿耳聋基因主要突变位点为GJB2 c.235delC和SLC26A4 c.IVS7-2A>G。通过对新生儿耳聋基因的筛查,对异常情况可以早发现,早干预,降低耳聋疾病的发生。
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关键词
新生儿
GJB2
基因
s
LC26A4
基因
GJB3
基因
线粒体
12
s
rRNA
基因
下载PDF
职称材料
题名
基于线粒体12S基因全序列分析我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性
被引量:
3
1
作者
李燕方
古江
袁媛
谢跃
赖为民
杨光友
古小彬
机构
四川农业大学动物医学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期2468-2476,共9页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31402188)
国家级大学生创新训练计划项目(201610626017)
文摘
为了探讨我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异情况及群体遗传结构,采用PCR测序技术测定我国5个地区(华北、华东、华中、西北、西南)绵羊痒螨(兔亚种)线粒体12S基因的全序列,并进行遗传多样性分析。结果共获得89条序列,长度均为657bp,核苷酸变异位点76个,单倍型50个(H1~H50),单倍型多样性(Hd)与核苷酸多样性(π)分别为0.931 05和0.005 59。进一步分析发现5个地理种群遗传分化程度较弱(Fst=0.042 322),基因交流非常频繁(Nm=5.657 372)。中性检验结果均为负值(Tajima’s D=-0.928 31,Fu’s Fs=-7.066 71),并且差异性不显著(P<0.05)。构建的NJ树和单倍型网络图均显示绵羊痒螨(兔亚种)5个地理种群的50个单倍型散在分布于不同的支系内,未形成明显的地理分布格局。我国绵羊痒螨(兔亚种)具有较高的遗传多样性,且有一定的遗传分化,基因交流频繁,但未形成以兔品种、温度带和地域来源划分的种群遗传结构。
关键词
绵羊痒螨(兔亚种)
线粒体12s基因
遗传多样性
Keywords
P
s
oropte
s
owl
s
vat. cuniculi
mitochondrial
12
s
gene
genetic diver
s
ity
分类号
S852.746 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
大壁虎线粒体12S rRNA基因片段的两种单倍型
被引量:
8
2
作者
刘忠权
王义权
周开亚
韩德民
机构
南京师范大学遗传资源研究所
出处
《安徽师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2000年第4期339-340,350,共3页
基金
国家自然科学基金(39870913)
江苏省教委基金(98KJB360010)
文摘
通过测定大壁虎 5个个体的线粒体 12SrRNA基因片段序列 ,发现大壁虎明显地分为两种单倍型 .结合染色体组型上的微小差异 ,这样的种内差异是否可能达到亚种级水平 ,还有待于进一步研究 .
关键词
大壁虎
线粒体
12
s
rRNA
基因
单倍型
Keywords
Gekko gecko
mitochondrial
12
s
rRNa gene
haplotype
s
分类号
Q522.6 [生物学—生物化学]
Q959.62 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
基于线粒体12S rRNA基因对大理州亚洲 带绦虫遗传多样性的分析
3
作者
尹雪宇
陈远腾
庄尔俊
赵俊杰
董玲
李海龙
机构
大理大学基础医学院
云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期784-788,共5页
基金
云南省科技厅地方联合专项项目(No.2019FH001-014)。
文摘
目的为了解云南省大理州亚洲带绦虫的遗传多样性。方法本研究采集到大理(DL)、巍山(WS)、弥渡(MD)、漾濞(YB)和洱源(EY)5个地区的131份亚洲带绦虫样本,基于线粒体12S rRNA基因进行扩增,运用MEGA7.0和DNASP5.10.01软件对所得序列进行分析,计算其碱基含量、遗传多样性参数、遗传分化系数和基因流以及遗传距离等数据。结果5个地区的亚洲带绦虫12S rRNA基因片段大小均为493 bp,平均A、T、G、C的碱基含量为28.3%、43.2%、19.4%和9.1%;共定义76个单倍体型,其中单倍型多样性为0.9830,核酸多样性为0.0332;遗传分化指数和基因流范围分别为-0.01913~0.04080和5.87745~22.49795;遗传距离为0.0023~0.0229,大理与巍山之间的遗传距离最大,漾濞与洱源群体之间的遗传距离最小。结论大理州5个地区亚洲带绦虫的线粒体12S rRNA基因的遗传多样性水平较高,基因交流频繁,但种群间的遗传分化较弱,本研究为亚洲带绦虫遗传多样性提供了基础数据。
关键词
亚洲带绦虫
线粒体
12
s
rRNA
基因
遗传多样性
大理
Keywords
Taenia a
s
iatica
12
s
rRNA gene
genetic diver
s
ity
Dali
分类号
R383.3 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
威海地区新生儿耳聋基因检测的结果分析
被引量:
2
4
作者
孙诗雨
张春晓
蓝信强
机构
青岛大学附属威海市立第二医院(威海市妇幼保健院)医学遗传科
出处
《黑龙江医药科学》
2020年第5期49-50,53,共3页
基金
威海市卫生和计划生育委员会科研项目,编号:2013GNS046-1。
文摘
目的:调查威海地区1720名新生儿携带中国常见的非综合征耳聋致病基因的情况。方法:采集2017-06~2020-02威海市妇幼保健院出生的1720名新生儿足跟血,应用飞行时间质谱仪检测GJB2基因、GJB3基因、SLC26A4基因和线粒体12S rRNA基因的20个突变位点。结果:研究发现新生儿耳聋基因携带者80名,GJB2基因杂合突变32例,主要突变位点为c.235delC。SLC26A4基因杂合突变39例,主要突点为c.IVS7-2A>G。7例GJB3基因杂合突变,2例线粒体12S rRNA c.1555A>C突变。结论:威海地区新生儿耳聋基因主要突变位点为GJB2 c.235delC和SLC26A4 c.IVS7-2A>G。通过对新生儿耳聋基因的筛查,对异常情况可以早发现,早干预,降低耳聋疾病的发生。
关键词
新生儿
GJB2
基因
s
LC26A4
基因
GJB3
基因
线粒体
12
s
rRNA
基因
分类号
R764.43 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体12S基因全序列分析我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性
李燕方
古江
袁媛
谢跃
赖为民
杨光友
古小彬
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
下载PDF
职称材料
2
大壁虎线粒体12S rRNA基因片段的两种单倍型
刘忠权
王义权
周开亚
韩德民
《安徽师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2000
8
下载PDF
职称材料
3
基于线粒体12S rRNA基因对大理州亚洲 带绦虫遗传多样性的分析
尹雪宇
陈远腾
庄尔俊
赵俊杰
董玲
李海龙
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
4
威海地区新生儿耳聋基因检测的结果分析
孙诗雨
张春晓
蓝信强
《黑龙江医药科学》
2020
2
下载PDF
职称材料
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