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家蚕线粒体ND2、COⅠ和若干tRNA基因的克隆及序列分析 被引量:7
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作者 廖顺尧 刘运强 +2 位作者 鲁成 周泽扬 向仲怀 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期375-383,共9页
克隆并测定了家蚕 (Bombyxmori)线粒体基因组 34 6 8bp的EcoRⅠ和HindⅢ双酶切片段序列 ,根据序列同源性比较 ,该DNA片段包括 3个蛋白质编码基因 :ND2基因、COⅠ基因和COⅡ基因 5′端 399bp的序列 ,以及 6个tRNA基因和一个尚待确定的tRN... 克隆并测定了家蚕 (Bombyxmori)线粒体基因组 34 6 8bp的EcoRⅠ和HindⅢ双酶切片段序列 ,根据序列同源性比较 ,该DNA片段包括 3个蛋白质编码基因 :ND2基因、COⅠ基因和COⅡ基因 5′端 399bp的序列 ,以及 6个tRNA基因和一个尚待确定的tRNAMet基因。家蚕与果蝇的ND2基因序列同源性约 6 9 7% ,COⅠ基因的同源性约 83 8% ,COⅡ基因 5′端的同源性约 80 % ,这表明细胞色素氧化酶基因在物种间比烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶基因保守。 6个推定的tRNA基因序列与果蝇相应tRNA基因序列差异较大。另外 ,除tRNAGln基因的二级结构相似外 ,其它tRNA基因的二级结构与果蝇相应tRNA基因的二级结构也有较大差异。 展开更多
关键词 家蚕 线粒体nd2 COⅠ TRNA 克隆 序列分析 3.5kb片段 基因组成 基因结构
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华南6水系与澜沧江-湄公河攀鲈线粒体ND2基因的遗传多样性分析 被引量:12
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作者 杨喜书 章群 +5 位作者 余帆洋 吕金磊 底晓丹 邵伟军 黄镇宇 卢丽锋 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期43-50,共8页
测定了中国华南6水系及澜沧江(云南勐腊)-湄公河流域(柬埔寨洞里萨湖)的125尾攀鲈(Anabas testudineus)线粒体部分ND2基因1 010 bp序列,分析发现39个变异位点和12个单倍型,总遗传多样性较低(h=0.369,π=0.003 8),推测可能经历过严重的... 测定了中国华南6水系及澜沧江(云南勐腊)-湄公河流域(柬埔寨洞里萨湖)的125尾攀鲈(Anabas testudineus)线粒体部分ND2基因1 010 bp序列,分析发现39个变异位点和12个单倍型,总遗传多样性较低(h=0.369,π=0.003 8),推测可能经历过严重的瓶颈效应;中国攀鲈群体遗传多样性更低(h=0.282,π=0.000 4),处于边缘区的中国攀鲈群体是造成低遗传多样性的主要原因。在单倍型网络图中柬埔寨和中国攀鲈各自聚类,具有明显地理结构和谱系结构,推测地质运动和气候变化导致基因交流受阻所致。核苷酸错配图和中性检验表明中国群体经历过种群扩张,时间约为(5.94~4.13)万年前。华南水系群体间基因交流通畅,不存在明显分化;但与云南澜沧江群体间分化大而显著(FST=0.775,P<0.01),AMOVA分析显示变异主要来自组群间(77.41%),推测二者分化时间约为(4.0~2.8)万年前,云南群体受末次冰期的影响,基因交流受阻而出现分化。中国群体和柬埔寨群体可作为2个管理单位进行保护;就中国群体而言,韩江水系群体遗传多样性最高,建议优先保护;澜沧江与华南水系间群体分化显著且遗传多样性极低,建议对澜沧江水系群体进行保护,以避免种质资源灭绝。 展开更多
关键词 攀鲈 遗传多样性 线粒体nd2 华南水系 澜沧江-湄公河
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Determination and Analysis of Mitochondrial ND2 Gene Sequence of Anas platyrhynchos 被引量:4
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作者 涂剑锋 司方方 +1 位作者 邢秀梅 杨福合 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第3期46-49,共4页
[Objective] The study was to analyze the phylogenesis of Anas platyrhynchos. [Method] Complete sequence of mitochondrial ND2 gene of 4 Anas platyrhynchos was determined by direct DNA sequencing based on PCR products. ... [Objective] The study was to analyze the phylogenesis of Anas platyrhynchos. [Method] Complete sequence of mitochondrial ND2 gene of 4 Anas platyrhynchos was determined by direct DNA sequencing based on PCR products. Combined with ND2 gene sequences of the Anas Linnaeus accessed in GenBank, phylogenetic tree was constructed by Neighbor-joining and maximum parsimony methods. [Result] The ND2 gene sequences of 4 Anas platyrhynchos were identical(1 041 bp in length; the nucleotide contents of A, G, T, and C were 28.91%, 13.35%, 20.75% and 36.98% respectively; A+T content approximated to that of C+G). Sequences of ND2 gene of mallard were same as spotbill duck, and had high homology with others. The phylogenetic trees indicated mallard and spotbilled duck were close in genetic relationship, both shared a haplotype; then Philippine duck, green-winged teal and northern pintail fell into branch ''A". [Conclusion] The domestic duck may be domesticated from mallard and spotbilled duck. 展开更多
关键词 Anas platyrhynchos nd2 gene sequence analysis Phylogenetic tree
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实时荧光聚合酶链式反应法检测食品中狗源性成分 被引量:5
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作者 高晓丽 杨昕霆 +3 位作者 薛晨玉 王丹 赵琳娜 侯彩云 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期61-64,共4页
根据狗线粒体NADH氧化还原酶亚基2基因(ND2)中的序列设计了狗特异性引物和Taqman探针,建立了食品中狗源性成分的实时荧光聚合酶链式(Real-time PCR)检测方法。实验表明,该方法可以很好地区分狗与其他常见的14个物种,引物、Taqman探针特... 根据狗线粒体NADH氧化还原酶亚基2基因(ND2)中的序列设计了狗特异性引物和Taqman探针,建立了食品中狗源性成分的实时荧光聚合酶链式(Real-time PCR)检测方法。实验表明,该方法可以很好地区分狗与其他常见的14个物种,引物、Taqman探针特异性良好,检测灵敏度可达100fg,适用于食品中狗源性成分的快速鉴定。 展开更多
关键词 REAL-TIME PCR 线粒体nd2基因 狗源性成分
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线粒体DNA5178位点C/A多态性对于2型糖尿病发生和发展的影响 被引量:5
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作者 杨训俊 张宇宁 +2 位作者 马胤 赵琼雅 吕建新 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期855-860,共6页
目的探讨线粒体DNANADH脱氢酶2亚基(NADH dehydrogenase subunit2,ND2)基因5178位点的C/A多态性与中国汉族人群2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性。方法收集1103例T2DM患者和791名正常对照的血液样本,通过聚合... 目的探讨线粒体DNANADH脱氢酶2亚基(NADH dehydrogenase subunit2,ND2)基因5178位点的C/A多态性与中国汉族人群2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性。方法收集1103例T2DM患者和791名正常对照的血液样本,通过聚合酶链反应结合测序的方法确定Mt5178C/A的多态性。采用Logistics回归分析计算患病风险比(oddsratio,OR)和95%可信区间(95% confidenceinterval,95%CI)。汇总研究Mt5178突变与T2DM相关性的文献,提取数据,进行荟萃分析。结果病例对照研究未发现Mt5178多态性与T2DM发生的相关性。Meta分析共纳入8篇已发表的研究,分析结果同样未发现Mt5178多态性与T2DM发生的相关性。但结果提示T2DM患者携带5178C基因型合并肾病并发症的风险更高(OR=1.49,95%CI:1.005-2.197,P〈0.05),而该基因型的患者并发高血压的风险则有所降低(OR=0.744,95%CI:0.556~0.996,P〈0.05)。结论线粒体ND2基因Mt5178c/A多态性与T2DM发生无关,但可能与T2DM的并发症如肾病和高血压的发展相关。 展开更多
关键词 荟萃分析 线粒体nd2基因 多态性 2型糖尿病 并发症
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