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用线粒体nad1基因b/c内含子鉴别人参属4种药材
被引量:
5
1
作者
顾然其
程舟
+5 位作者
李靖
杨晓伶
李珊
朱云国
张文驹
陈家宽
《中药材》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期45-48,共4页
目的:探讨人参属4种药材人参、西洋参、三七、竹节参的鉴别方法及其系统发育关系。方法:扩增线粒体nad1基因,测序比对,分析该基因序列的差异。结果:获得人参(移山参、高丽参)和竹节参该基因的1290 bp片段序列,西洋参和三七的该基因片段...
目的:探讨人参属4种药材人参、西洋参、三七、竹节参的鉴别方法及其系统发育关系。方法:扩增线粒体nad1基因,测序比对,分析该基因序列的差异。结果:获得人参(移山参、高丽参)和竹节参该基因的1290 bp片段序列,西洋参和三七的该基因片段长度则分别为1269 bp和1522 bp,主要差异为该基因的b/c内含子。在NJ系统发育树上,人参和竹节参关系最近,其次是西洋参,而与三七的关系最远。结论:基于该片段的碱基差异可从这4种药材中将西洋参、三七鉴别出来。人参属植物线粒体nad1基因b/c内含子存在一定的进化信息,可以进一步用于人参属药材的鉴别及系统发育关系分析。
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关键词
人参属
线粒体nad1基因
b/c内含子
鉴别
系统发育
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职称材料
基于线粒体nad1基因的大理州亚洲带绦虫遗传多样性分析
2
作者
尹雪宇
陈远腾
+3 位作者
庄尔俊
赵俊杰
董玲
李海龙
《热带医学杂志》
CAS
2023年第3期301-304,共4页
目的了解云南省大理州亚洲带绦虫的遗传多样性。方法2019年5月-2021年8月从大理市(DL)、巍山县(WS)、弥渡县(MD)、漾濞县(YB)和洱源县(EY)5个地区采集到131份亚洲带绦虫样本,利用PCR技术扩增其线粒体nad1基因序列,运用MEGA7.0和DNASP5.1...
目的了解云南省大理州亚洲带绦虫的遗传多样性。方法2019年5月-2021年8月从大理市(DL)、巍山县(WS)、弥渡县(MD)、漾濞县(YB)和洱源县(EY)5个地区采集到131份亚洲带绦虫样本,利用PCR技术扩增其线粒体nad1基因序列,运用MEGA7.0和DNASP5.10.01软件对所得序列进行分析,计算其碱基含量、遗传多样性参数、遗传分化系数和基因流以及遗传距离等数据。结果5个亚洲带绦虫群体的nad1基因片段大小均为1058 bp,A、T、G、C的碱基平均含量分别为22.0%、48.2%、23.0%和6.8%;比对发现131条亚洲带绦虫共形成53个单倍型,其中单倍型多样性为0.9485,核酸多样性为0.0101;遗传分化指数和基因流范围分别为-0.0012~0.1072和2.0825~283.8409;遗传距离为0.0052~0.0189,MD与YB之间的遗传距离最大,DL与EY之间的遗传距离最小。中性检验结果显示,大理州5个群体的Tajima’s D和Fu’s Fs值均为负值,分别为-2.2477~-0.5001和-4.1664~-0.4196,DL和YB两个群体为显著负值,差异有统计学意义(P<0.05),推测这2个群体可能发生过群体扩张。结论大理州亚洲带绦虫群体遗传多样性水平较高,种群间基因交流频繁,遗传分化较弱,DL与MD群体间存在中等程度的遗传分化。
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关键词
亚洲带绦虫
线粒体nad1基因
遗传多样性
原文传递
题名
用线粒体nad1基因b/c内含子鉴别人参属4种药材
被引量:
5
1
作者
顾然其
程舟
李靖
杨晓伶
李珊
朱云国
张文驹
陈家宽
机构
同济大学生命科学与技术学院
复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所/生物多样性与生态工程教育部重点实验室
出处
《中药材》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期45-48,共4页
基金
上海市科学技术委员会中药现代化专项(08DZ1972500)
文摘
目的:探讨人参属4种药材人参、西洋参、三七、竹节参的鉴别方法及其系统发育关系。方法:扩增线粒体nad1基因,测序比对,分析该基因序列的差异。结果:获得人参(移山参、高丽参)和竹节参该基因的1290 bp片段序列,西洋参和三七的该基因片段长度则分别为1269 bp和1522 bp,主要差异为该基因的b/c内含子。在NJ系统发育树上,人参和竹节参关系最近,其次是西洋参,而与三七的关系最远。结论:基于该片段的碱基差异可从这4种药材中将西洋参、三七鉴别出来。人参属植物线粒体nad1基因b/c内含子存在一定的进化信息,可以进一步用于人参属药材的鉴别及系统发育关系分析。
关键词
人参属
线粒体nad1基因
b/c内含子
鉴别
系统发育
Keywords
Panax L.
Mitochondrial
nad
1
gene
b/c intron
Identification
Phylogeny
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
基于线粒体nad1基因的大理州亚洲带绦虫遗传多样性分析
2
作者
尹雪宇
陈远腾
庄尔俊
赵俊杰
董玲
李海龙
机构
大理大学基础医学院
云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室
出处
《热带医学杂志》
CAS
2023年第3期301-304,共4页
基金
云南省科技厅地方联合专项项目(2019FH001-014)
文摘
目的了解云南省大理州亚洲带绦虫的遗传多样性。方法2019年5月-2021年8月从大理市(DL)、巍山县(WS)、弥渡县(MD)、漾濞县(YB)和洱源县(EY)5个地区采集到131份亚洲带绦虫样本,利用PCR技术扩增其线粒体nad1基因序列,运用MEGA7.0和DNASP5.10.01软件对所得序列进行分析,计算其碱基含量、遗传多样性参数、遗传分化系数和基因流以及遗传距离等数据。结果5个亚洲带绦虫群体的nad1基因片段大小均为1058 bp,A、T、G、C的碱基平均含量分别为22.0%、48.2%、23.0%和6.8%;比对发现131条亚洲带绦虫共形成53个单倍型,其中单倍型多样性为0.9485,核酸多样性为0.0101;遗传分化指数和基因流范围分别为-0.0012~0.1072和2.0825~283.8409;遗传距离为0.0052~0.0189,MD与YB之间的遗传距离最大,DL与EY之间的遗传距离最小。中性检验结果显示,大理州5个群体的Tajima’s D和Fu’s Fs值均为负值,分别为-2.2477~-0.5001和-4.1664~-0.4196,DL和YB两个群体为显著负值,差异有统计学意义(P<0.05),推测这2个群体可能发生过群体扩张。结论大理州亚洲带绦虫群体遗传多样性水平较高,种群间基因交流频繁,遗传分化较弱,DL与MD群体间存在中等程度的遗传分化。
关键词
亚洲带绦虫
线粒体nad1基因
遗传多样性
Keywords
Taenia asiatica
Mitochondrial
nad
1
gene
Genetic diversity
分类号
R383.32 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用线粒体nad1基因b/c内含子鉴别人参属4种药材
顾然其
程舟
李靖
杨晓伶
李珊
朱云国
张文驹
陈家宽
《中药材》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
下载PDF
职称材料
2
基于线粒体nad1基因的大理州亚洲带绦虫遗传多样性分析
尹雪宇
陈远腾
庄尔俊
赵俊杰
董玲
李海龙
《热带医学杂志》
CAS
2023
0
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