貂熊线粒体tRNA基因序列及其二级结构预测

貂熊属环北型动物,列入国家Ⅰ级重点保护动物。本文利用PCR扩增、测序和拼接获得了貂熊线粒体基因组全序列,其基因组全长16575bp,包括13种蛋白质,22种t RNA和2种r RNA和1个控制区。通过软件t RNAScan-SE1-21和RNA structure5.6对22种t RNA的二级结构进行预测,结果显示22种t RNA除t RNA-lys外均能折叠成典型的三叶草结构,碱基错配情况在氨基酸臂和DHU臂出现较多,而TψC臂和反密码子臂错配较少,共出现的35处错配,而其中25处为GU错配。碱基配对大部分符合Wasten-Click互补配对原则,少部分符合G-U摆动配对原则。

携带线粒体tRNA^(Thr)15910C>T突变和12S rRNA 1555A>G突变的非综合征型耳聋家系的线粒体功能研究

该研究旨在探讨一个非综合征型耳聋(nonsyndromic hearing impairment,NSHI)家系中线粒体t RNAThr 15910C>T和12S r RNA 1555A>G基因突变共同作用对线粒体功能的影响。该研究建立了同时携带线粒体t RNAThr 15910C>T和12S r RNA 1555A>G基因突变(双突变组)、仅携带12S r RNA 1555A>G基因突变(单突变组)和对照组的永生化淋巴细胞,这3组细胞系的线粒体DNA单体型均属于R单体型。对该家系的临床资料进行分析,当包括使用氨基糖苷类抗生素(aminoglycoside antibiotics,Am An)的药物性耳聋家系成员时,此家系耳聋外显率为37.5%;当排除用药的耳聋成员时,耳聋外显率是25.0%;相比之下,在用药和未用药的情况下,已报道的14个m.1555A>G的耳聋家系的平均外显率只有12.8%和6.1%。通过对双突变组、单突变组和对照组永生化细胞系的线粒体功能进行研究,结果发现与对照组相比,双突变和单突变组细胞系的ROS水平分别上升了19.08%(P=0.005 4)和9.05%(P=0.003 7);ΔΨm水平分别下降了47.78%(P=0.006 3)和35.39%(P=0.0245);复合体II活力分别下降了8.26%(P=0.721 1)和19.48%(P=0.004 9),复合体IV活力分别下降了32.75%(P=0.033 5)和27.44%(P=0.180 5)。m.1555A>G与m.15910C>T共同作用,导致ROS生成量升高,ΔΨm水平下降以及线粒体呼吸链复合体IV活力降低等线粒体功能缺陷,提示m.15910C>T可能是m.1555A>G导致耳聋的继发性突变。

线粒体C150T多态性与宫颈癌和HPV感染风险关系的研究

目的探讨线粒体C150T多态性对宫颈癌和HPV感染风险的影响。方法回顾性选取2015年1月至2017年12月青海红十字医院收治的宫颈癌142例患者资料作为实验组。另选取553例健康女性作为对照组。采用聚合酶链反应(PCR)测定HPV感染情况(HPV阳性、HPV阴性),同时采用qPCR-限制片段长度多态性测定各组线粒体C150T多态性。结果线粒体C150T中D150单核苷酸多态性增加了宫颈癌风险(OR=3. 2,95%CI为1. 9～5. 3,P <0. 001);与HPV阴性组相比,HPV阳性个体更有可能携带C150T多态性(OR=5. 9,95%CI为2. 3～13. 7,P <0. 001);与对照组相比,宫颈癌患者更有可能携带C150T多态性(OR=4. 7,95%CI为2. 5～9. 4,P <0. 001);在所有案例中,HPV感染的风险增加也与C150T多态性相关(OR=4. 6,95%CI为2. 3～8. 5,P <0. 001)。结论 C150T多态性与HPV感染、宫颈癌的发病具有相关性,增加了HPV感染风险和宫颈癌患病率。

新疆地区汉族和维吾尔族耳聋基因突变的比较研究

目的:分析中国新疆地区汉族和维吾尔族耳聋患者的常见耳聋基因突变,为该地区耳聋患者的临床基因诊断提供理论依据。方法:调查对象为新疆地区乌鲁木齐和库尔勒特教学校的125例耳聋患者,其中汉族64例,维吾尔族61例,听力检查全部为重度-极重度感音神经性聋。所有受检者均采集外周血并提取DNA,进行GJB2全序列、包含SLC26A4IVS7-2A>G、线粒体DNA12SrRNA1494和1555位点的突变分析。结果:新疆地区汉族耳聋患者GJB235delG和SLC26A4IVS7-2的等位基因频率分别为7.4%和10.1%,维吾尔族耳聋人群未发现GJB235delG和SLC26A4IVS7-2突变,两者比较差异有统计学意义。而GJB2235delC、299-300delAT及线粒体DNAA1555G、C1494T维吾尔族和汉族比较差异无统计学意义。结论:新疆地区汉族和维吾尔族GJB235delG和SLC26A4IVS7-2A>G有不同的等位基因频率,新疆地区汉族和维吾尔族常见耳聋基因突变存在异同。

一个伴脊髓与脑干受累以及脑白质乳酸升高的脑白质病家系临床及DARS2基因突变分析

目的探讨一个伴脊髓、脑干受累，脑白质乳酸升高的脑白质病（LBSL）家系的临床和影像学特点，并检测其致病基因DARS2的突变情况。方法收集并分析先证者的临床资料，应用PCR方法对DARS2基因的所有17个外显子及其外显子内含子连接区域进行扩增，采用DNA直接测序与DNA限制性内切酶酶切、100条正常染色体对照验证的方法进行DARS2基因突变检测。结果（1）临床特点：先证者发病年龄为14岁，以运动倒退、走路姿势异常起病，下肢运动障碍重于上肢，智力基本正常，头颅核磁及磁共振波谱（MRS）符合LBSL特点。（2）基因突变分析：先证者DARS2基因发现第8外显子C．665G〉A（P．Gly222Asp）与第2内含子C．228—16C〉G，首次证实了我国LBSL患者中存在DARS2基因突变。家系突变分离研究结果表明，c．665G〉A（P．Gly222Asp）来自其父亲，c．228—16C〉G突变则来源于其母亲，其兄携带C．228—16C〉G，父母及其兄均为表型正常的携带者，符合常染色体隐性遗传规律。结论在国内诊断第1例LBSL病，明确了该家系中的致病基因突变及相关个体基因状况，为该家庭进行准确的遗传咨询提供了可能。