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基于多组学联用的活鱼暂养及运输应激研究进展
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作者 岑剑伟 陈琛 +6 位作者 姚世鹏 黄卉 郝淑贤 魏涯 杨少玲 何静怡 王田 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期173-180,共8页
鱼类长途保活运输技术是我国“南鱼北运”实施的主要方法。鱼类在运输过程中受到如低温、盐度变化、碱性胁迫等环境因素影响,结合多组学联合的研究方法对鱼类运输过程中产生的应激进行多维度的分析。识别差异表达基因、蛋白质及代谢物,... 鱼类长途保活运输技术是我国“南鱼北运”实施的主要方法。鱼类在运输过程中受到如低温、盐度变化、碱性胁迫等环境因素影响,结合多组学联合的研究方法对鱼类运输过程中产生的应激进行多维度的分析。识别差异表达基因、蛋白质及代谢物,进而解析调控网络及生物标志物对应激反应的影响,有助于理解鱼类运输过程中的健康状况,优化暂养及运输条件,提高活鱼品质与存活率。综述了近年来鱼类在运输中产生各类应激的组学研究进展,为精准调控鱼类保活运输中的各项环境指标及深入研究活鱼运输应激的相关机理提供参考。 展开更多
关键词 鱼类保活运输 转录 蛋白质 代谢 组学联用
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转录组学和蛋白组学在中药毒性机制研究中的应用进展
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作者 赵灿灿 张建永 李晓飞 《遵义医科大学学报》 2024年第11期1142-1150,共9页
随着中药的普遍使用,其潜在的毒性风险也逐渐被人们所重视。目前中药毒性检测及其分子机制研究仍缺乏安全、高效、灵敏的技术体系。转录组学作为一门研究细胞内基因转录及其调控的学科,蛋白质组学作为研究生物体内蛋白质组成、结构、功... 随着中药的普遍使用,其潜在的毒性风险也逐渐被人们所重视。目前中药毒性检测及其分子机制研究仍缺乏安全、高效、灵敏的技术体系。转录组学作为一门研究细胞内基因转录及其调控的学科,蛋白质组学作为研究生物体内蛋白质组成、结构、功能和相互作用的学科,均可为深入研究中药毒性提供了新视角和新方法。二者的联合应用可弥补因转录后调控、翻译效率等因素造成的基因表达与蛋白质表达之间的差异,可更全面地了解生物体在毒性机理下的分子变化,从分子层面更精确地解释毒性机制。本文综述了近年来转录组学和蛋白组学在中药毒性研究中的应用进展,旨在为中药的安全使用提供科学依据。 展开更多
关键词 中药 毒性 转录 蛋白 组学联用 作用机制
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细胞代谢组学及其应用 被引量:5
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作者 姚卫峰 周莉娜 +2 位作者 张丽 丁安伟 李伟 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2014年第3期334-340,共7页
细胞代谢组学通常被定义为胞内和细胞膜小分子代谢物的集合,而代谢物参与胞内进程的多种变化,其浓度可近似地反映一个器官、组织或细胞的表型。细胞代谢组学是一个新兴发展的领域,它可解决基本的生物学问题,并允许观察细胞内的代谢现象... 细胞代谢组学通常被定义为胞内和细胞膜小分子代谢物的集合,而代谢物参与胞内进程的多种变化,其浓度可近似地反映一个器官、组织或细胞的表型。细胞代谢组学是一个新兴发展的领域,它可解决基本的生物学问题,并允许观察细胞内的代谢现象。在后基因时代,与当前其他常用的方法相比,细胞代谢组学具有许多潜在的优势,已成为一个有前途的分析工具。现简要综述细胞代谢组学的主要研究流程及其应用、与其他组学联用等方面的研究进展。 展开更多
关键词 细胞代谢 研究流程 组学联用
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系统生物学方法在中药品质形成机制研究中的应用
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作者 林谷音 冯煦 陈雨 《中药材》 CAS 北大核心 2023年第7期1823-1828,共6页
中药品质是药用植物在其生长发育和对环境的适应过程中逐渐形成的,主要包括中药遗传品质与中药生态品质。中药的品质决定了中药活性成分的开发与中药资源的合理利用,是中药临床应用效果的保证,因而中药品质形成机制亟待阐明。系统生物... 中药品质是药用植物在其生长发育和对环境的适应过程中逐渐形成的,主要包括中药遗传品质与中药生态品质。中药的品质决定了中药活性成分的开发与中药资源的合理利用,是中药临床应用效果的保证,因而中药品质形成机制亟待阐明。系统生物学这门新兴学科通过多组学研究的方法,可将基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学方法得到的高通量数据进行系统的生物信息学分析和数据处理,为中药品质形成机制研究带来新的机遇。本文综述了近年来系统生物学的一些前沿方法,以及在中药品质形成机制研究中的相关研究进展,概述了系统生物学方法在中药品质形成机制中的研究现状,同时总结了在中药遗传品质、中药生态品质研究中的系统生物学“整体观”研究思路,为今后中药品质形成机制的解析提供“整体观”的研究思路与技术方法。 展开更多
关键词 中药 品质形成机制 系统生物学 组学联用
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组学及其联用技术在中药毒性研究中的应用分析 被引量:1
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作者 朱睿思 李秋红 鞠爱霞 《国际中医中药杂志》 2023年第10期1332-1336,F0003,共6页
各类组学及其联用技术在中药毒性作用机制、筛选毒性生物标志物、预测中药毒性等方面有一定的应用,但应用范围仍有待扩大。在中药导致器官损伤方面,多用于研究肝毒性。在中药减毒机制方面,蛋白质组学和代谢组学更具优势,二者在探索炮制... 各类组学及其联用技术在中药毒性作用机制、筛选毒性生物标志物、预测中药毒性等方面有一定的应用,但应用范围仍有待扩大。在中药导致器官损伤方面,多用于研究肝毒性。在中药减毒机制方面,蛋白质组学和代谢组学更具优势,二者在探索炮制或配伍使中药减毒增效方面具潜在前景。将组学技术与网络药理学、生物信息学等技术相联用,有利于对中药毒性进行深入研究。 展开更多
关键词 基因 转录 蛋白质 代谢 微生物 中药毒性 中药安全性评价 组学联用
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High-performance isotope-labeling liquid chromatography mass spectrometry for investigating the effect of drinking Goji tea on urine metabolome profiling
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作者 TSENG Chiao-Li LI Liang 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2014年第5期678-685,共8页
Urine is a human biofluid that is widely used for metabolomics research on disease biomarker discovery.Ideally,the metabolome profiles generated from comparative groups of individuals should mainly consist of the endo... Urine is a human biofluid that is widely used for metabolomics research on disease biomarker discovery.Ideally,the metabolome profiles generated from comparative groups of individuals should mainly consist of the endogenous human metabolites that reflect the healthy states of the individuals.However,external factors,such as diet,may alter the urine metabolome profile by either introducing a significant amount or variety of exogenous metabolites to urine or inducing changes of the metabolome profile.Thus,strict control of the external factors during the sample collection process is critical for urine metabolomics aimed at discovery of disease biomarkers.In this work,we describe a study to determine the effect of drinking Goji tea,which is considered a nutritional supplement drink in some regions of the world,on urine metabolome profile.The purpose of this work is not to determine the nutritional values of Goji tea,but to investigate whether drinking a moderate amount of Goji tea 1-3 h(short-term effect)or 12 h(longer-term effect)before urine collection can cause significant variations of urine metabolome profiles.A highly sensitive dansylation isotope labeling liquid chromatography mass spectrometry(LC-MS)method was used to determine the urine metabolomes before and after drinking Goji tea.From the studies of the short term(<3 h)and longer term(12 h)effects of drinking Goji tea,it is clear that the consumption of a moderate amount of Goji tea does not affect the urine metabolome significantly.Fasting for 12 h should be sufficient to remove any potential interference of Goji metabolites from the human urine metabolome profile. 展开更多
关键词 metabolomics urine metabolites mass spectrometry liquid chromatography isotope labeling Goji diet
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