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人类基因组中可变和组成性剪接位点的预测
被引量:
4
1
作者
张利绒
罗辽复
+1 位作者
邢永强
晋宏营
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1188-1194,共7页
根据剪接位点的核酸序列保守特征,以及邻近位点的碱基组成和关联特性,结合一对可变剪接位点之间的距离参数和受体端剪接位点前30位碱基的GC和TC含量,利用结合多样性指标的二次判别方法(IDQD),预测了人类基因组中可变和组成性内含子的供...
根据剪接位点的核酸序列保守特征,以及邻近位点的碱基组成和关联特性,结合一对可变剪接位点之间的距离参数和受体端剪接位点前30位碱基的GC和TC含量,利用结合多样性指标的二次判别方法(IDQD),预测了人类基因组中可变和组成性内含子的供体端和受体端的剪接位点,对可变的供体端和受体端剪接位点,阈值!选择-2时,总的预测精度分别为87.9%和89.9%,对组成性的供体端和受体端剪接位点,阈值!选择-1,总的预测精度分别为92.8%和94.3%.
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关键词
可变
剪接
组成性剪接
二次判别方法
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职称材料
题名
人类基因组中可变和组成性剪接位点的预测
被引量:
4
1
作者
张利绒
罗辽复
邢永强
晋宏营
机构
内蒙古大学物理科学与技术学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1188-1194,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(10447003
90403010)
内蒙古自治区自然科学基金资助项目(200308020102)~~
文摘
根据剪接位点的核酸序列保守特征,以及邻近位点的碱基组成和关联特性,结合一对可变剪接位点之间的距离参数和受体端剪接位点前30位碱基的GC和TC含量,利用结合多样性指标的二次判别方法(IDQD),预测了人类基因组中可变和组成性内含子的供体端和受体端的剪接位点,对可变的供体端和受体端剪接位点,阈值!选择-2时,总的预测精度分别为87.9%和89.9%,对组成性的供体端和受体端剪接位点,阈值!选择-1,总的预测精度分别为92.8%和94.3%.
关键词
可变
剪接
组成性剪接
二次判别方法
Keywords
alternative splice, constitutive splice, quadratic discriminant analysis
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类基因组中可变和组成性剪接位点的预测
张利绒
罗辽复
邢永强
晋宏营
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008
4
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职称材料
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