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UROC1在肝细胞癌中的表达及对肿瘤发生的影响
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作者 严洪遥 劳远翔 孙倍成 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第8期1339-1346,共8页
目的 探究尿刊酸酶(UROC1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其对HCC发生发展的影响。方法 分析蛋白质质谱和TCGA数据库中UROC1在癌和癌旁组织中的表达及预后数据。利用免疫组织化学染色、实时定量PCR(qPCR)和Western blot实验验证HCC中UROC1... 目的 探究尿刊酸酶(UROC1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其对HCC发生发展的影响。方法 分析蛋白质质谱和TCGA数据库中UROC1在癌和癌旁组织中的表达及预后数据。利用免疫组织化学染色、实时定量PCR(qPCR)和Western blot实验验证HCC中UROC1表达情况。利用HE染色判断肿瘤分化水平,分析UROC1表达水平与其相关性。构建稳定过表达UROC1和其突变体的Hep3B、LM3细胞系,开展体外细胞表型实验。通过细胞计数试剂盒8(CCK-8)、平板克隆实验、EdU实验、划痕实验和Transwell实验探究UROC1对HCC细胞增殖和迁移的影响。结果 TCGA数据库分析结果显示,与癌旁组织相比,UROC1在HCC组织中普遍下调(P<0.000 1),UROC1低表达组较高表达组的患者预后更差(P<0.05)。免疫组织化学染色及评分、qPCR和Western blot实验验证了UROC1在HCC中低表达。不同分化水平癌组织的免疫组织化学染色结果提示分化越差的HCC组织中UROC1表达水平越低(P<0.05)。平板克隆实验结果显示,过表达UROC1的细胞克隆形成数目较对照组明显减少。CCK-8和EdU染色实验结果显示,UROC1过表达的细胞增殖速度显著低于对照组(P<0.001)。划痕实验结果显示,UROC1过表达的HCC细胞迁移距离明显小于对照组细胞(P<0.000 1)。Transwell实验显示,过表达UROC1后细胞穿过小室的数目显著减少(P<0.000 1)。但是UROC1的活性位点突变后上述实验表型的结果和对照组趋于一致。结论 UROC1在HCC组织中低表达,在HCC细胞中过表达UROC1可能对细胞增殖和迁移能力有抑制作用。 展开更多
关键词 肝细胞癌 UROC1 组氨酸代谢
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胶质母细胞瘤复发相关基因的筛选、表达和临床预后分析 被引量:9
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作者 林艺 王策 +4 位作者 康勋 康庄 陈峰 江波 李文斌 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期13-23,共11页
背景与目的:脑胶质瘤是常见的中枢神经系统原发性恶性脑肿瘤之一,胶质母细胞瘤恶性程度高、侵袭性强、容易复发,复发后患者的预后极差。筛选胶质母细胞瘤复发相关的基因,并分析其在胶质瘤中的表达、临床病理学参数和预后的关系。方法:... 背景与目的:脑胶质瘤是常见的中枢神经系统原发性恶性脑肿瘤之一,胶质母细胞瘤恶性程度高、侵袭性强、容易复发,复发后患者的预后极差。筛选胶质母细胞瘤复发相关的基因,并分析其在胶质瘤中的表达、临床病理学参数和预后的关系。方法:通过对GEO数据库中胶质母细胞瘤相关数据集进行挖掘,筛选包含胶质母细胞瘤原发和复发病例的相关数据集,并分析胶质母细胞瘤原发病例和复发病例样本间的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)。对DEG进行基因本体功能和信号富集分析,构架蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选Hub基因。通过PPI网络和Venn图筛选关键基因,而后研究使用基因表达谱数据动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)和中国脑胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)数据库进行关键基因的生存分析和表达分析,分析其表达与胶质瘤临床病理学参数的关系。结果:GSE62153数据集筛选到40个DEG,上调基因34个,下调基因6个。GSE58399数据集筛选到19个DEG,上调基因16个,下调基因3个。GO功能分析结果提示GSE62153的DEG主要参与中枢神经系统发育、髓鞘、肌动蛋白结合及中枢神经系统髓鞘形成等11个生理过程。而GSE58399的DEG主要参与上皮细胞迁移的正调控。京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析结果显示,GSE62153和GSE58399的DEG存在共同富集—组氨酸代谢。通过STRING数据库,将20个蛋白分子构建成为核心PPI,Hub基因共筛选出10个,分别为MOBP、OPALIN、ERMN、PLP1、MOG、CLDN11、ASPA、TMEM125、KLK6和NKX6-2基因。胶质母细胞瘤复发关键基因筛选结果显示,共有3个基因:ERMN、MOG和MOBP基因。基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和CGGA数据库胶质瘤数据分析,ERMN、MOG和MOBP基因高表达者预后均优于低表达组,ERMN、MOG和MOBP基因在胶质母细胞瘤组织内表达水平低于对照组织(P<0.001)。ERMN、MOG和MOBP基因在不同世界卫生组织(World Health Organization,WHO)分级(WHOⅡ、Ⅲ和Ⅳ级)组织内表达差异有统计学意义(P<0.001),且随着胶质母细胞瘤的级别升高,ERMN、MOG和MOBP基因的表达逐渐降低。ERMN、MOG和MOBP基因表达与WHO分级、异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)状态及临床病理学参数相关(P<0.001)。而MOBP基因表达与患者年龄(P<0.001)及MGMT甲基化状态(P=0.022)相关。结论:ERMN、MOG和MOBP基因可能发挥抑癌基因作用参与胶质瘤复发过程,组氨酸代谢途径可能与甲氨蝶呤治疗敏感性相关。 展开更多
关键词 胶质瘤 生物信息 生存预后 复发 组氨酸代谢
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Expression of Recombinant Tryptophan Decarboxylase in Different Subcellular Compartments in Tobacco Plant 被引量:2
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作者 王淼 李秋荣 +1 位作者 Stefano Di FIORE Rainer FISCHER 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第3期314-317,共4页
The gene encoded for tryptophan decarboxylase (TDC), which is the key enzyme in terpenoil indole alkaloids pathway, was targeted to different subcellular compartments and stably expressed in transgenic tobacco (Nicoti... The gene encoded for tryptophan decarboxylase (TDC), which is the key enzyme in terpenoil indole alkaloids pathway, was targeted to different subcellular compartments and stably expressed in transgenic tobacco (Nicotiana tabacum L.) plants at the levels detected by Western blot and tryptamine accumulation analysis. It was shown that the TDC was located in subcellular compartments, the chloroplasts and cytosol. The recombinant TDC targeted to chloroplasts and cytosol in tobacco plants was effectively expressed as soluble protein by Western blot analysis and enzymatic assay. The level of tryptamine accumulation in chloroplast was higher than that in cytosol and very low in vacuole and endoplasmic reticulum (ER) to be hardly detected by Western blot analysis. It was indicated that the highest amount of tryptamine was in chloroplasts, lower in endoplasmic reticula and the lowest in vacuoles as compared to those in wild type plants. The TDC targeted to different subcellular compartments of tobacco plants and its expression level were studied by different nucleotide sequences coding signal peptides at 5'-end of tdc gene in order to know the effects of the TDC in compartmentation on its functionality. 展开更多
关键词 tryptophan decarboxylase alkaloids biosynthetic pathway Nicotiana tabacum subcellular compartment
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基于代谢组学研究鹅掌草三萜皂苷抑制肝癌初步作用机制 被引量:7
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作者 姚诗琪 莫国艳 韩林涛 《湖北中医药大学学报》 2020年第4期5-9,共5页
目的观察通过气相色谱与质谱联用(GC-MS)的代谢组学方法分析鹅掌草三萜皂苷对裸鼠H22肝癌细胞构建的裸鼠皮下移植瘤模型肝癌增殖的影响,为阐明鹅掌草三萜皂苷对肝癌增殖的抑制效应机制,为治疗肝癌提供理论基础。方法建立H22肝癌细胞裸... 目的观察通过气相色谱与质谱联用(GC-MS)的代谢组学方法分析鹅掌草三萜皂苷对裸鼠H22肝癌细胞构建的裸鼠皮下移植瘤模型肝癌增殖的影响,为阐明鹅掌草三萜皂苷对肝癌增殖的抑制效应机制,为治疗肝癌提供理论基础。方法建立H22肝癌细胞裸鼠皮下移植瘤模型,实验分为模型组与鹅掌草三萜皂苷高、中、低剂量(15,10,5mg/kg)组,给药干预21d后,绘制肿瘤生长曲线;收集模型组与高剂量组肿瘤组织进行代谢组学分析。结果不同浓度(15,10,5mg/kg)的鹅掌草三萜皂苷干预21d后,与模型组(0mg/kg)比较,均能抑制H22肝癌移植瘤增殖,其中高剂量组抑制肿瘤增殖效果最显著。通过GC-MS分析,共筛选出70种代谢产物为明显改变的代谢产物,其中高剂量组相对模型组下调代谢物有47个。差异代谢物KEGG功能分析表明,代谢物主要与组氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、β-丙氨酸新陈代谢等代谢通路有关。结论鹅掌草三萜皂苷可以有效抑制肝癌移植瘤生长,组氨酸代谢可能在三萜皂苷抑制肝癌细胞增殖中发挥作用。 展开更多
关键词 肝癌 H22细胞 鹅掌草三萜皂苷 代谢组学 组氨酸代谢
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