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影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究
1
作者
王朝江
李慧
+4 位作者
王世清
高春燕
李聪
张洋
刘方
《南开大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期73-80,共8页
探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支...
探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支撑的菌群.发现太岁中细菌种类丰富,大部分是杂菌,由表至内,多数类群不明原因消失,多样性和丰度降低,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著升高;其与不动杆菌属(Acinetobacter)、根瘤菌属(Rhizobium)和鞘脂菌属(Sphingobium)为共有优势属;3种前处理方法获得的菌群结构近似,以内部组织直接热溶解过膜法为最优,其假单胞菌属占比达48.32%.
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关键词
太岁
细菌
组织前处理
DNA提取
菌群结构
原文传递
题名
影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究
1
作者
王朝江
李慧
王世清
高春燕
李聪
张洋
刘方
机构
河北省农林科学院经济作物研究所
南开大学生命科学学院
出处
《南开大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期73-80,共8页
基金
河北省农林科学院农业科技创新工程项目(2-05-03)。
文摘
探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支撑的菌群.发现太岁中细菌种类丰富,大部分是杂菌,由表至内,多数类群不明原因消失,多样性和丰度降低,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著升高;其与不动杆菌属(Acinetobacter)、根瘤菌属(Rhizobium)和鞘脂菌属(Sphingobium)为共有优势属;3种前处理方法获得的菌群结构近似,以内部组织直接热溶解过膜法为最优,其假单胞菌属占比达48.32%.
关键词
太岁
细菌
组织前处理
DNA提取
菌群结构
Keywords
Taisui
bacteria
tissue pretreatment
DNA extraction
community structure
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究
王朝江
李慧
王世清
高春燕
李聪
张洋
刘方
《南开大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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