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题名基于DNA甲基化的三种常见体液组织来源鉴定
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作者
杨梦思
陈燕
陈静
王科文
郭向前
季安全
丰蕾
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机构
河南大学基础医学院
公安部物证鉴定中心
中国科学院北京基因组研究所
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出处
《中国法医学杂志》
CSCD
2021年第5期483-487,共5页
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基金
“十三五”国家重点研发计划课题(2017YFC0803503)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2018JB038)
法医遗传学公安部重点实验室开放课题(2018FGKFKT02)。
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文摘
目的针对唾液、精液、外周血,找到一组可用于区分不同体液的组织差异性甲基化位点,为确定案件现场提取的体液组织来源提供科学依据。方法选取常见体液样本共49份,运用Illumina 850K甲基化芯片进行全基因组甲基化检测,筛选获得17个候选CpG位点;使用焦磷酸测序对55份样本进行测序,实际共检测了候选位点及其附近的位点共34个CpG位点。选择基于赤池信息量(AIC)的逐步条件多分类逻辑回归方法进行数据分析。结果基于3个CpG位点(cg25373595、cg18121066、cg17283169)构建了多分类逻辑回归模型用于体液组织来源预测,分别位于RAP1GAP2,TBCD,CALML3基因上。该模型对精液来源预测的AUC、灵敏度和特异性均为1,对唾液和静脉血来源的预测AUC和灵敏度均为1,特异性分别为0.99和0.98。在独立的唾液、精液和静脉血3种体液共24份样本中对该预测模型进行验证,预测结果全部正确。结论本文建立的基于3个CpG位点的体液组织来源鉴定方法可以实现唾液、精液和静脉血3种体液的有效区分,在法庭科学中具有潜在的应用价值。
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关键词
组织特异甲基化位点
焦磷酸测序
体液斑迹来源
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Keywords
Tissue specific DNA methylation site
Pyrosequencing
Body fluid identification
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分类号
D918.93
[政治法律—法学]
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