染色体组装因子1亚基A(CHAF1A)和增殖细胞核抗原在宫颈鳞状细胞癌组织高表达并与恶性程度正相关

目的探讨染色体组装因子1亚基A(CHAF1A)和增殖细胞核抗原(PCNA)在宫颈鳞状细胞癌(CSCC)组织中的表达和临床意义。方法荧光定量PCR检测CSCC组织和对应癌旁组织中CHAF1A和PCNA的mRNA的水平,免疫组织化学染色法检测正常宫颈上皮、宫颈上皮内瘤变(CIN)以及CSCC组织中CHAF1A和PCNA蛋白的表达,分析其与临床病理参数的关系,并探讨相关性。结果 CHAF1A和PCNA在CIN及CSCC组织中表达明显高于正常宫颈组织,CHAF1A和PCNA呈正相关。CHAF1A与CSCC的分化程度、肿瘤大小、浸润深度及有人乳头瘤病毒(HPV)感染有关,PCNA与CSCC的分化程度、国际妇产科联盟(FIGO)分期、淋巴结转移、浸润深度及有HPV感染有关。结论 CHAF1A和PCNA在CSCC中高表达并且与恶性程度相关,二者呈正相关。

NADH:泛醌氧化还原酶复合体组装因子2在肝癌组织中的异常表达和功能探讨

目的:基于肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库的多组学数据,分析线粒体呼吸链复合体I组装因子NADH∶泛醌氧化还原酶复合体组装因子2(NADH∶ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2,NDUFAF2)基因在肝癌组织中的表达、临床及预后意义,并探讨其参与肝癌发生发展的可能机制。方法:利用TCGA肝癌样本的RNA测序、全外显子组测序、单核苷酸多态芯片和DNA甲基化测序数据,分析NDUFAF2在肝癌中的表达特征及其异常高表达的可能机制。基于TCGA肝癌RNA测序数据获得与NDUFAF2高度相关性的共表达基因,进行Reactome、MSigDB通路和人类表型富集分析,并利用Cytoscape软件绘制功能网络。结果:对TCGA肝癌RNA测序数据的表达和生存分析显示,线粒体呼吸链复合体的全部亚基中,仅NDUFAF2在肝癌组织中显著高表达,且与不良的总生存率和无复发生存率均相关。肝癌组织中NDUFAF2的高表达与性别、人种、肿瘤分化程度和微血管侵犯显著相关(P均<0.05)。基因扩增和肝癌驱动基因TP53和CTNNB1的突变,以及MYC扩增是造成NDUFAF2高表达的可能原因。对肝癌组织中与NDUFAF2共表达的411个基因的富集分析显示,NDUFAF2可能通过调控细胞能量产生、氧化应激、RNA加工、蛋白翻译和c-Myc、mTORC1相关信号传导通路,促进肝癌的发生发展。结论:NDUFAF2在肝癌组织中的高表达可能通过调控RNA加工和蛋白翻译等生物学通路参与细胞癌变,可作为潜在的肝癌预后预测标志物和新的治疗干预靶点。

染色质组装因子1 p60预测非小细胞肺癌预后的价值

目的探讨染色质组装因子(CAF-1)p60在非小细胞肺癌中的预后价值,分析其与临床病理特征的相关性。方法连续性选取179例非小细胞肺癌肿瘤组织,采用免疫组化法检测肿瘤组织中CAF-1 p60的表达,分析其与临床病理特征的相关性及预后意义。结果 CAF-1 p60在肺癌组织中为核表达。CAF-1 p60高表达率为47.5%(85/179),低表达率为52.5%(94/179)。CAF-1 p60表达与TNM分期(P<0.001)、肿瘤分化程度(P=0.018)、远处转移(P=0.011)密切相关。KaplanMeier生存曲线提示,CAF-1 p60高表达患者的生存率明显低于低表达者(P<0.001)。Cox多变量生存分析提示,CAF-1 p60高表达是重要的独立预后因素(HR=2.747,P=0.001)。结论在非小细胞肺癌中,CAF-1 p60高表达提示预后不良,并且与肿瘤分期、分级及远处转移相关。CAF-1 p60可以作为非小细胞肺癌的独立预后因子。

血清circVMA21水平对脓毒症患者预后评估的价值

目的 探讨血清环状RNA液泡ATP酶组装因子(circVMA21)水平对脓毒症患者预后评估的价值。方法 将2020年7月至2022年12月该院收治的200例脓毒症患者纳入研究作为脓毒症组。对患者进行随访,根据脓毒症患者治疗后28 d是否存活将患者分为预后良好组(128例)和预后不良组(72例)。另外,选取200例同期本院收治的普通感染患者作为对照组。收集所有纳入研究者的临床资料,用实时荧光定量PCR(qPCR)检测血清circVMA21水平,Spearman法分析circVMA21与序贯性器官衰竭评估(SOFA)评分、急性生理学及慢性健康状况评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分的相关性。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析circVMA21对脓毒症患者预后不良的预测价值,Kaplan-Meier法分析circVMA21与脓毒症患者生存预后的关系,Logistic回归分析脓毒症患者预后的影响因素。结果 与对照组比较,脓毒症组血清circVMA21水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。脓毒症患者血清circVMA21水平与SOFA评分、APACHEⅡ评分均呈负相关(r=-0.553、-0.543,P<0.05)。与预后良好组比较,预后不良组circVMA21水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。预后不良组肌酸激酶同工酶(CK-MB)、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、超敏C-反应蛋白(hs-CRP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞计数(WBC)、中性粒细胞计数(NEU)、SOFA评分、APACHEⅡ评分高于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示,circVMA21的曲线下面积(AUC)为0.848(95%CI:0.793~0.902),截断值为0.55,灵敏度为83.30%,特异度为78.90%,约登指数为0.622。Kaplan-Meier法分析显示,circVMA21>0.55与circVMA21≤0.55患者生存预后比较,差异有统计学意义(Log-rank χ^(2)=5.138,P=0.023)。多因素Logistic回归结果显示,APACHEⅡ评分是脓毒症患者预后不良的危险因素,circVMA21为预后良好的保护因素(P<0.05)。结论 脓毒症患者血清circVMA21水平降低,血清circVMA21是脓毒症患者预后良好的保护因素,可作为评估脓毒症患者预后的生物标志物。

核糖体组装调控因子在结直肠癌组织的表达及其临床意义

目的通过生物信息学的方法探究核糖体组装调控因子(PNO1)在结直肠癌(CRC)中的表达及和临床病理、预后的相关性。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库内将结直肠转录组测序技术(RNA-seq)相关数据下载, 包含了43例正常结直肠样本和475例结直肠癌组织样本。选取PNO1在结直肠癌内表达的中位数值, 把结直肠癌患者分为表达高水平与低水平组, 探究患者病理资料和PNO1表达的关联度。对高表达和低表达组患者生存率差异应用Kaplan-Meier法分析。PNO1表达对患者预后的影响应用Cox回归分析。京都基因和基因组(KEGG)通路分析PNO1在CRC内所参加的相关通路。结果结直肠癌组织内PNO1 mRNA表达水平显著高于正常组织(χ^(2)=12.312, P<0.05)。在TCGA数据集内, 通过对43对配对样本比较显示, 结直肠癌组织内PNO1表达水平显著高于正常组织(χ^(2)=16.503, P<0.05)。PNO1表达水平在患者年龄、发病部位、性别、神经侵犯、脉管侵犯、TNM分期和肿瘤大小方面比较差异无统计学意义(χ^(2)=1.730、0.307、0.990、0.990、0.848、0.545、1.806, P>0.05);PNO1表达水平在患者淋巴结转移、浸润深度和分化程度方面比较差异有统计学意义(χ^(2)=6.275、47.943、11.479, P<0.05)。两组患者总体生存率采用Kaplan-Meier法分析显示, 与PNO1低表达组比较, 高表达组患者总体生存率显著降低(χ^(2)=11.627P<0.05)。OncoLnc数据库显示PNO1 mRNA高表达组患者的生存率低于低表达组(χ^(2)=17.105P<0.05)。单因素Cox回归分析表明, 影响患者预后因素有PNO1表达、年龄、分化程度、淋巴结转移、浸润程度和临床分期, 差异有统计学意义[风险比(HR)=1.284、1.034、1.162、2.021、1.314、2.843;95%可信区间(CI)=1.101~1.533、1.010~1.055、1.084~1.530、1.556~2.680、1.124~1.628、1.814~4.356, P<0.05];多因素Cox回归分析表明, 影响患者预后的独立因素为PNO1表达、临床分期和年龄(HR=1.290、1.743、1.051;95%CI=1.063~1.614、1.025~2.981、1.023~1.071, P<0.05)。结论 CRC组织内PNO1为高表达, 其表达水平和患者的临床病理特征及预后明显相关。

真核生物RNA聚合酶组装及其生物学意义

RNA聚合酶负责RNA生物合成,是维持机体细胞生长和器官发育的重要调控机器.真核生物主要通过3种多亚基RNA聚合酶(RNAPⅠ、RNAPⅡ和RNAPⅢ)进行基因转录.RNA聚合酶Ⅱ由10个核心亚基组成,分子质量约为520 ku.RNA聚合酶结构已经解析,但其组装过程却还不清楚.RNA聚合酶各亚基无法完成体外自我组装,说明细胞内其装配过程需要组装因子帮助.RNA聚合酶组装是一个复杂的生物学过程,近年来组装因子的鉴定和发现使RNA聚合酶组装研究成为热点.在酿酒酵母中发现的组装因子有Rba50、Bud27和GPN蛋白家族等.其中GPN蛋白家族是重要的GTP酶(GTPase)家族,从古细菌到酵母以及高等真核生物中都存在,且高度保守.近期研究发现,Rba50在动植物的同源蛋白(RPAP1和IYO)与细胞分化和发育有关.GPN等组装因子编码基因的突变与细胞发育及恶性肿瘤发生发展密切关联.本文对真核生物RNA聚合酶组装最新进展做出综述,以期为RNA聚合酶组装机制的最终阐明及其与疾病发生的关联研究提供基础.

线粒体呼吸链复合体Ⅰ

线粒体呼吸链复合体Ⅰ(简称复合体Ⅰ)是呼吸链电子传递的起始复合体,作为电子传递过程的限速酶,复合体Ⅰ的分子量远大于其余的四个呼吸链复合体。复合体Ⅰ相关的疾病发生除了与40余个复合体Ⅰ组成亚基的突变相关外,还同参与其组装的多个组装因子存在密切联系。该文对复合体I的结构以及参与调控复合体Ⅰ组装的各类组装因子进行了综述,旨在为全面了解复合体Ⅰ相关疾病的发生提供具体参考。

NDUFAF4激活Wnt/β-catenin通路增加肝癌辐射抵抗性机制研究

目的研究泛醌氧化还原酶复合物组装因子4(NDUFAF4)的表达与肝癌患者临床预后的相关性,探究NDUFAF4对人肝癌细胞系的辐射敏感性的影响及其机制。方法通过数据库及肝癌组织样本探究NDUFAF4在肝癌中的表达及其表达水平与临床预后的相关性。通过脂质体将敲减NDUFAF4基因的质粒si-NDUFAF4转入HepG2和Huh7细胞,克隆形成实验检测辐射敏感性。同时通过裸鼠开展荷瘤实验,免疫荧光法检测β联蛋白(β-catenin),蛋白质印迹法检测上皮钙黏素(E-cadherin)和神经钙黏素(N-cadherin)的蛋白表达。结果生物信息学分析结果证实,NDUFAF4在肝癌组织中显著高表达,其表达水平越高,患者预后越差(P<0.05)。NDUFAF4在肝癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织;克隆形成实验证实,敲减NDUFAF4显著降低肝癌细胞的生存率(P<0.01);体内实验证实,敲减NDUFAF4可以减慢癌细胞增殖,减少β-catenin及Ki-67的表达。敲减NDUFAF4显著减少肝癌细胞系核内β-catenin的蛋白水平,提示NDUFAF4可以激活Wnt/β-catenin通路。敲减NDUFAF4显著上调E-cadherin和下调N-cadherin的蛋白表达水平。结论敲减NDUFAF4可以通过抑制Wnt/β-catenin通路增强人肝癌细胞系的辐射敏感性,并且与临床预后紧密相关,或可为克服肝癌的辐射抗性提供新的靶点。

CHAF1A和ERα在宫颈鳞状细胞癌中的表达和临床意义

该研究探讨染色质组装因子1亚基(CHAF1A)和雌激素受体1(ERα)在宫颈鳞状细胞癌(CSCC)组织中的表达,探究CHAF1A和ERα的关系及其对CSCC潜在的临床意义,采用了免疫组织化学染色法检测CHAF1A和ERα在CSCC组织及对应的癌旁组织中的表达情况;从CSCC组织及对应癌旁组织中提取总RNA,RT-PCR检测其mRNA水平,分析其相关性;免疫印迹实验检测CHAF1A和ERα在HeLa、C33a、CaSki、Siha和HaCat细胞中的表达差异;慢病毒介导的ShRNA敲低CHAF1A mRNA的表达,RT-PCR检测CHAF1A基因敲低后对ERα表达的影响。结果显示,CHAF1A的表达随着CSCC病变的进展升高,在宫颈癌组织中的表达显著高于其对应的癌旁组织,在宫颈癌细胞株中的表达亦高于人正常表皮细胞系;ERα的表达随着CSCC病变的进展降低,在宫颈癌组织及细胞系中的表达趋势则与CHAF1A相反。CHAF1A基因敲低后ERαmRNA表达升高;另外,统计分析利用χ2检验、Spearman检验及Student’s t检验,探索CHAF1A和ERα表达与CSCC临床病理特征的关系。得出结论,CHAF1A在宫颈癌中高表达并与CSCC恶性程度呈正相关性;ERα在宫颈癌中低表达且与CSCC恶性程度呈负相关性;CHAF1A的表达与ERα的表达呈负相关性;CHAF1A可能对ERα的表达具有调控作用。

Autonomous DNA walker： probing cell membrane dynamics

We are all familiar with DNA as the substance that encodes the genomes of all living things.In addition to genetic function,DNA is one of the smartest building blocks for innovative nanostructures.DNA walker is a kind of self-assembled molecular machine that mimics the movement of protein motors in living systems.Usually,DNA walker consists of three parts：a single stranded DNA track,