番鸭细小病毒YL08株VP1基因重组分析

为确定番鸭细小病毒(MDPV)YL08株的起源和进化过程,基于VP1全基因序列,将YL08株与其他6株MDPV中国大陆株进行了基因重组分析。系统进化树分析表明:7株MDPV可分成3组,MDPV-Ⅰ、MDPV-Ⅱ和MDPV-Ⅲ。MDPV-Ⅰ仅仅包括1株MDPV,为黑龙江的YL08株;MDPV-Ⅱ包括3株MDPV,为广东GD株以及福建P株和P1株;MDPV-Ⅲ包括2株MDPV,为广西MDPV-GX5株和上海SAAS-SHNH株。通过Sim Plot软件和系统进化树进行的重组分析表明,MDPV YL08株来源于MDPV-Ⅱ和MDPV-Ⅲ之间的重组。这是首次发现在MDPV VP1基因间存在重组现象。